糖脂質による新生タンパク質鎖保護と膜輸送の機構解明
糖脂質による新生タンパク質鎖保護と膜輸送の機構解明
批准号:
22H02213
负责人:
島本 啓子
金额:
$11.32万
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
财政年份:
2022
资助国家:
日本
项目状态:
未结题
起止时间:
2022-04-01 至 2025-03-31
中文摘要
MPIase は、大腸菌の内膜における膜タンパク質の統合に関与する糖脂質である。我々は、天然MPIaseの微量性と不均一性を克服するために、系統的なMPIaseのアナログ合成を進めてきた。これまでにドッキングシミュレーションや飽和移動差(STD)-NMR等から糖脂質MPIaseとタンパク質の相互作用点を予測している。これを実験的に証明し、より詳細にMPIaseに特徴的な官能基や糖鎖長の寄与を明らかにするために、特徴的な官能基を改変した3糖類縁体、および糖鎖伸長した6糖、9糖類縁体の化学合成を行った。3糖単位で糖鎖伸長する戦略を立案し、アクセプターにもドナーにも誘導可能な3糖ユニットを設計・合成した。新戦略により化学的に構築が難しいグルコサミンのα結合でユニット間を繋ぐことに成功し、9糖ピロリン脂質(mini-MPIase-9) や6糖モノリン脂質(mini-ECA-6)をはじめとする種々の類縁体の合成に成功した。これらの膜挿入試験の結果から、グルコサミン6位のAc基、マンノサミンのカルボキシ基、ピロリン酸の重要性が明らかになった。特に、6糖以上の糖鎖で膜シャペロンYidCとの協働作用が見られたことから、糖鎖部とYidCとが膜上で相互作用していることが示唆され、今後の機能化MPIaseとの相互作用解析の道筋をつけることができた。大腸菌のトランスロコン非依存型膜タンパク質膜挿入として、MPIaseが基質タンパク質を捕捉し、凝集を抑制しつつ立体配座を整えて膜挿入を行い、YidCへ引き渡す事で、自身の膜タンパク質膜挿入活性を再生するという機構を実証した。
英文摘要
MPIase は、大腸菌の内膜における膜タンパク質の統合に関与する糖脂質である。我々は、天然MPIaseの微量性と不均一性を克服するために、系統的なMPIaseのアナログ合成を進めてきた。これまでにドッキングシミュレーションや飽和移動差(STD)-NMR等から糖脂質MPIaseとタンパク質の相互作用点を予測している。これを実験的に証明し、より詳細にMPIaseに特徴的な官能基や糖鎖長の寄与を明らかにするために、特徴的な官能基を改変した3糖類縁体、および糖鎖伸長した6糖、9糖類縁体の化学合成を行った。3糖単位で糖鎖伸長する戦略を立案し、アクセプターにもドナーにも誘導可能な3糖ユニットを設計・合成した。新戦略により化学的に構築が難しいグルコサミンのα結合でユニット間を繋ぐことに成功し、9糖ピロリン脂質(mini-MPIase-9) や6糖モノリン脂質(mini-ECA-6)をはじめとする種々の類縁体の合成に成功した。これらの膜挿入試験の結果から、グルコサミン6位のAc基、マンノサミンのカルボキシ基、ピロリン酸の重要性が明らかになった。特に、6糖以上の糖鎖で膜シャペロンYidCとの協働作用が見られたことから、糖鎖部とYidCとが膜上で相互作用していることが示唆され、今後の機能化MPIaseとの相互作用解析の道筋をつけることができた。大腸菌のトランスロコン非依存型膜タンパク質膜挿入として、MPIaseが基質タンパク質を捕捉し、凝集を抑制しつつ立体配座を整えて膜挿入を行い、YidCへ引き渡す事で、自身の膜タンパク質膜挿入活性を再生するという機構を実証した。
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DOI:
--
发表时间:
2022
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Keiko Shimamoto]
通讯作者:
Keiko Shimamoto
Sec非依存性膜蛋白質膜挿入における大腸菌由来糖脂質MPIaseの役割解明
阐明大肠杆菌衍生的糖脂 MPIase 在不依赖于 Sec 的膜蛋白膜插入中的作用
DOI:
--
发表时间:
2022
期刊:
影响因子:
--
作者:
[野村†, 森, 藤川, 大澤, 津田, 熊谷, 増田, 西尾, 吉矢, 西山, 島本]
通讯作者:
島本
DOI:
10.1016/bs.accb.2022.09.005
发表时间:
2022
期刊:
Advances in Carbohydrate Chemistry and Biochemistry
影响因子:
--
作者:
[Fujikawa Kohki, Mori Shoko, Nishiyama Ken-ichi, Shimamoto Keiko]
通讯作者:
Shimamoto Keiko
大腸菌膜タンパク質膜挿入に必須な糖脂質MPIaseの構造活性相関研究
大肠杆菌膜蛋白膜插入必需的糖脂 MPIase 的构效关系研究
DOI:
--
发表时间:
2022
期刊:
影响因子:
--
作者:
[藤川†, 韓, 大澤, 森, 野村, 西山, 島本]
通讯作者:
島本
Structural Requirements of a Glycolipid MPIase for Membrane Protein Integration
膜蛋白整合的糖脂 MPIase 的结构要求
DOI:
10.1002/chem.202300437
发表时间:
2023
期刊:
Chemistry - A European Journal
影响因子:
--
作者:
[Fujikawa Kohki, Han Youjung, Osawa Tsukiho, Mori Shoko, Nomura Kaoru, Muramoto Maki, Nishiyama Ken‐ichi, Shimamoto Keiko]
通讯作者:
Shimamoto Keiko
共 9 条
糖脂質による新生タンパク質鎖保護と膜輸送の機構解明
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批准号:23K23480
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
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资助金额:$2.66万
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财政年份:2024
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负责人:島本 啓子
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依托单位:
グルタミン酸トランスポーターブロッカーの開発
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批准号:10780361
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$1.22万
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财政年份:1998
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负责人:島本 啓子
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依托单位:
グルタミン酸トランスポーター選択的ブロッカーの合成と基質認識機構の解明
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批准号:10169264
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
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资助金额:$1.02万
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财政年份:1998
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负责人:島本 啓子
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依托单位:
NO合成酵素選択的阻害のための配座制御リガンド合成
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批准号:08780551
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.64万
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财政年份:1996
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负责人:島本 啓子
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依托单位:
海外基金