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植物時計コアサーキットのダイナミクスの解析

植物时钟核心电路的动态分析

基本信息

批准号：
22H02255
负责人：
中道範人
金额：
$ 11.23万
依托单位：
Nagoya University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
财政年份：
2022
资助国家：
日本
起止时间：
2022-04-01 至 2025-03-31
项目状态：
未结题

项目摘要

我々の発見した植物の時計周期延長化合物BML-259は、サイクリン依存性キナーゼC(CDKC;1およびCDKC;2)のリン酸化活性を阻害する。CDKCは基本転写因子RNA Polymerase IIのC末端リピートをリン酸化し、転写活性を制御している。BML-259の処理は、時計関連遺伝子を含む多くの遺伝子の発現を抑圧する。このBML-259の構造活性相関研究から、より活性の強い低分子化合物TT369を見出した。しかし、以前報告した動物のCDKを用いた結合モデル(Uehara et al., Plant Cell Physiol., 2022)では、TT369の強い活性の理由を説明できなかった。そこで、新たにシロイナズナのCDKC;2の構造をホモロジーモデリングで構築し、TT369やBML-259との結合を統計的に検討することとした。その結果、TT369はBML-259よりも、安定的にCDKC;2に結合することが示唆された(Saito, Maeda, Takahara et al., Plant Cell Physiol., 2022)。時計関連転写因子のPRR7の安定性に影響を与える低分子化合物を見出している。また植物体内でPRR7に相互作用するタンパク質を複数同定することができた。In silico解析から、低分子化合物はPRR7タンパクに結合する可能性は極めて低いと示唆された。植物の時計を調節する、もしくは影響を与える低分子化合物や、その化合物の作用機序についての総説を発表した(Nakamichi et al., New Phytologist, 2022)。時計関連遺伝子の変異が、穀物の栽培地域の拡大に貢献したという知見を取りまとめた総説を発表した（Maeda and Nakamichi, Plant Physiology, 2022）。

I am using the plant's clock cycle extension compound BML-259, and I am using the サイクリン-dependent キナーゼC (CDKC; 1 およびCDKC; 2) のリン acidifying activity を hindrance する. CDKC's basic writing factor, RNA Polymerase II, is a C-terminal acidification and writing activity control system. The handling of BML-259 and the timepiece-related legacy are also limited. Research on the structure and activity of BML-259 has been carried out, and the activity of low-molecular compound TT369, which has strong activity, has been studied. It was previously reported that the CDK of animals was combined with the モデル (Uehara et al., Plant Cell Physiol., 2022) and the reason for the strong activity of TT369 was explained.そこで、新たにシロイナズナのCDKC; 2のstructural をホモロジーモデリングでConstructed, TT369, BML-259, and combined with statistics, the に検多することとした.そのRESULTS, TT369はBML-259よりも, stable にCDKC; 2にcombination of することが见憆された (Saito, Maeda, Takahara et al., Plant Cell Physiol., 2022). The timepiece is related to the influence of the stability of the PRR7 factor on the watch and the appearance of low molecular weight compounds. The interaction between PRR7 and PRR7 in the plant is the same as the plural number. In silico analysis, the low molecular weight compound PRR7 is combined, the possibility is extremely high, and the low molecular weight is low. The mechanism of action of plant timepieces regulating the effects of する and もしくは and える low-molecular compounds や and その compounds についての総说を発表した (Nakamichi et al., New Phytologist, 2022). Timepieces are related to the の変different が and the の拡大にcontribution to the cultivation area of cereals したという知见をtake りまとめた総说を発表した (Maeda and Nakamichi, Plant Physiology, 2022).