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ATP遊離リズムを新規指標とした生物時計の振動子の決定および機能部位の解析

以ATP释放节律为新指标测定生物钟振荡器及功能位点分析

基本信息

批准号：
21K06117
负责人：
武藤梨沙
金额：
$ 2.66万
依托单位：
Toho University (2022)Fukuoka University (2021)
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
财政年份：
2021
资助国家：
日本
起止时间：
2021-04-01 至 2024-03-31
项目状态：
已结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-21K06117/
关键词：
生物時計藍色細菌 ATP 時計タンパク質

项目摘要

シアノバクテリアの生物時計分子装置は、時計タンパク質KaiA、KaiB、KaiCの3つから構成されている。これらのタンパク質を試験管内で混合すると、ATP存在下で約24時間周期でKaiCのリン酸化レベルやATPase活性が変動する。これらは、KaiA、KaiB、KaiCの3つが揃わないと観測されない現象のため、KaiABCが時計の最小単位であると考えられる。しかし、私たちは、2021年に、KaiC単独で、KaiCに結合したATPの遊離に振動があることを示した（Mutoh et al., 2021）。これは、KaiAやKaiBがなくてもKaiC単独で振動機能を有することを示している。そこで、本研究では、KaiCが時計の振動子であることを示し、ATP遊離のリズムと時計の関連性を明らかにする。これまでに、KaiCに変異を入れると様々な周期変異体（長周期、短周期、無周期、アリズミックなど）が発見されている（Ishiura et al., 1998）。これらの周期変異体を用いて、ATP遊離リズムと周期変異体に相関があるのか否かを調べた。その結果、ATP遊離の周期（遊離する時間帯）とin vivoで観測される周期には直接的な相関はなさそうであった。in vivoでは、kaiCだけではなく、kaiAやkaiB、さらには時計関連タンパク質が関わってリズムを生み出している。kaiCに変異が入ることで周期に異常が出るのは明らかであるが、その周期を決定する機構は、KaiCではなくその下流にあるのではないかと考えられる。

The biochronometer molecular devices, KaiA, KaiB and KaiCun 3 were tested and tested. In the presence of a mixture of chemicals and ATP, there are about 24-hour cycles of KaiC acidification and ATPase activity in the tube. For example, KaiA, KaiB, KaiC, and so on, the performance test of the minimum clock position of KaiABC timing is very important. Sales, private, 2021, KaiC alone, KaiC in combination with the ATP isolation program, the mobile phone display (Mutoh et al., 2021). The radio, KaiA, KaiB, and the KaiC alone vibrator can display a message to show the alarm. In this study, the vibrator was tested in this study, the vibrator was displayed in KaiC, and the connection was confirmed by ATP. Please see Ishiura et al., 1998 for long period, short period, short cycle, long period, short period, long period, short period, Do you want to know if you have a cycle? if you don't have a cycle, you have to use the ATP to separate the cycle from the cycle. The results of the test, the ATP quarantine cycle (quarantine time), the in vivo quarantine cycle, the direct phase response cycle, the phase response cycle, the quarantine cycle. In vivo, kaiC, KaiABA, KaiAUKaiB, KaiANGKaiB, KaiAUKaiB, KaiABA, KaiABA, KaiA The kaiC information system is used to determine the performance of the operating system. The operating cycle determines the performance of the system, and the KaiC cycle determines the performance of the system.

项目成果

期刊论文数量（8）

专著数量（0）

科研奖励数量（0）

会议论文数量（0）

专利数量（0）

Analytical Techniques for the Elucidation of Protein Function (Biological Applications of EPR)

阐明蛋白质功能的分析技术（EPR 的生物学应用）

DOI：
发表时间：
2023
期刊：
影响因子：
0
作者：
Suetake Isao;Risa Mutoh;Yuichi Mishima;Masatomo So;Hironobu Hojo
通讯作者：
Hironobu Hojo

Rhythmic ATP release from the cyanobacterial circadian clock protein KaiC revealed by real-time monitoring of bioluminescence

通过实时监测生物发光揭示蓝藻生物钟蛋白 KaiC 的节律性 ATP 释放

DOI：
发表时间：
2021
期刊：
影响因子：
0
作者：
Mutoh R;Iida T.;Onai K.
通讯作者：
Onai K.

Dynamics of the HP1 Hinge Region with DNA Measured by Site-Directed Spin Labeling-EPR Spectroscopy

DOI：
10.1007/s00723-022-01519-2
发表时间：
2023-01-05
期刊：
APPLIED MAGNETIC RESONANCE
影响因子：
1
作者：
Suetake，Isao;Sato，Kazunobu;Arata，Toshiaki
通讯作者：
Arata，Toshiaki

Energy transfer fluctuation observed by single-molecule spectroscopy of red-shifted bacteriochlorophyll in the homodimeric photosynthetic reaction center

同型二聚体光合反应中心红移细菌叶绿素的单分子光谱观察能量转移波动

DOI：
10.1063/5.0077290
发表时间：
2022
期刊：
The Journal of Chemical Physics
影响因子：
0
作者：
Kondo Toru;Mutoh Risa;Arai Shun;Kurisu Genji;Oh-oka Hirozo;Fujiyoshi Satoru;Matsushita Michio
通讯作者：
Matsushita Michio

Structural dynamics of the chromo-shadow domain and chromodomain of HP1 bound to histone H3K9 methylated peptide, as measured by site-directed spin-labeling EPR spectroscopy

通过定点自旋标记 EPR 光谱测量与组蛋白 H3K9 甲基化肽结合的 HP1 的染色阴影结构域和染色结构域的结构动力学

DOI：
10.1016/j.bbrc.2021.06.010
发表时间：
2021
期刊：
Biochemical and Biophysical Research Communications
影响因子：
3.1
作者：
Suetake Isao;Nakazawa Shigeaki;Sato Kazunobu;Mutoh Risa;Mishima Yuichi;Kawakami Toru;Takei Toshiki;Watanabe Mikio;Sakai Norio;Fujiwara Toshimichi;Takui Takeji;Miyata Makoto;Shinohara Akira;Hojo Hironobu;Arata Toshiaki
通讯作者：
Arata Toshiaki