植物寄生線虫における性決定カスケードの解明

植物寄生线虫性别决定级联的阐明

基本信息

  • 批准号:
    22H02363
  • 负责人:
  • 金额:
    $ 11.15万
  • 依托单位:
  • 依托单位国家:
    日本
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
  • 财政年份:
    2022
  • 资助国家:
    日本
  • 起止时间:
    2022-04-01 至 2025-03-31
  • 项目状态:
    未结题

项目摘要

ネコブセンチュウ性分化に関わる遺伝子群を理解するために、トマトの根に感染後7日目の性未分化幼虫と、11日目の雌雄2-3期幼虫を根から解剖学的に取り出し、RNA-seq解析に供した。比較対象として、植物体感染前のネコブセンチュウ感染態2期幼虫も加えた。各3反復ずつ遺伝子発現プロファイルを取得し、主成分分析を実施した結果、4種類のサンプルそれぞれにおいて明確なグループが形成された。ネコブセンチュウにおいてその発現量に雌雄差が確認された遺伝子の中には、他種線虫において性決定に関与するものがあり、複数の転写因子も見出された。また、ネコブセンチュウは植物から摂取する糖を性決定のトリガーとして利用していることを示唆する結果を既に得ているが、モデル線虫C. elegansにおける主要グルコーストランスポーターのオルソログの発現がネコブセンチュウの雌雄で大きく異なることが明らかになった。次に、ネコブセンチュウtra-1遺伝子の機能解析を実施する準備に着手した。tra-1遺伝子はネコブセンチュウの近縁種において、性決定遺伝子としての機能を有することが明らかになっている。公開されているゲノム情報によるとネコブセンチュウは複数のtra-1オルソログを有しているが、主要tra-1と思われる遺伝子配列が他種線虫に比べ短く、ゲノム解析時の遺伝子予測にミスが生じている可能性が考えられた。そのため、今回ネコブセンチュウからcDNAを合成し、完全長配列の取得を試みた。その結果、実際にゲノム解析時の情報が誤りであることが明らかになった。現在では、このtra-1遺伝子の性決定における機能を調べるべく、ベンサミアナタバコにおけるVIGS系を用いた実験系の確立に取り組んでいる。現状、ネコブセンチュウがベンサミアナタバコにおよそ20%程度の寄生率を有することを確認できている。
ネ コ ブ セ ン チ ュ ウ sexual differentiation に masato わ る heritage 伝 subgroup を understand す る た め に, ト マ ト の root に infection after 7 orders の と undifferentiated larvae, 11 orders, the male and female 2-3 stage larvae の を root か ら anatomy に take り し, RNA - seq analytic に for し た. For comparison, the counterpart is と て て, and the pre-infection stage 2 larva of the ネコブセ チュウ infection state of the plant is と plus えた. Each 3 repeatedly ず つ heritage 伝 son 発 now プ ロ フ ァ イ ル を を obtain し, principal component analysis be applied し た results, 4 species の サ ン プ ル そ れ ぞ れ に お い て clear な グ ル ー プ が form さ れ た. ネ コ ブ セ ン チ ュ ウ に お い て そ の 発 に amount of male and female difference が now confirmed さ れ た heritage 伝 child の に は, he kind of nematodes に お い て sex determination に masato and す る も の が あ り, plural の planning factors も see write a さ れ た. ま た, ネ コ ブ セ ン チ ュ ウ は plant か ら, take す る sugar を sex determination の ト リ ガ ー と し て using し て い る こ と を in stopping す る results て を に both い る が, モ デ ル nematodes C. Elegans に お け る main グ ル コ ー ス ト ラ ン ス ポ ー タ ー の オ ル ソ ロ グ の 発 now が ネ コ ブ セ ン チ ュ ウ の male and female で big き く different な る こ と が Ming ら か に な っ た. This time, に, ネコブセ, チュウ, チュウ the function analysis of the 伝 subla of tra-1 を implementation する, prepare に to start the た. Tra - 1 heritage 伝 son は ネ コ ブ セ ン チ ュ ウ の about try species に お い て, sex determination but 伝 と し て の function を have す る こ と が Ming ら か に な っ て い る. Public さ れ て い る ゲ ノ ム intelligence に よ る と ネ コ ブ セ ン チ ュ ウ は plural の tra - 1 オ ル ソ ロ グ を have し て い る が と thought, main tra - 1 わ れ る heritage 伝 with sequence が he kind of nematodes に く, shorter than べ ゲ ノ ム when parsing の heritage 伝 son be に ミ ス が raw じ て い る possibility が exam え ら れ た. Youdaoplaceholder0 ため ため, this time ネコブセ チュウ チュウ ら らcDNAを was synthesized into を, and complete long binding of <s:1> obtained を test みた. Youdaoplaceholder0 results, actual situations にゲノム analysis, <s:1> information が errors が である になった とが Ming ら ら になった. Now で は, こ の tra - 1 heritage 伝 son の sexual decision に お け る function を adjustable べ る べ く, ベ ン サ ミ ア ナ タ バ コ に お け る を VIGS department with い た be 験 is の establish に group take り ん で い る. Status quo, ネ コ ブ セ ン チ ュ ウ が ベ ン サ ミ ア ナ タ バ コ に お よ そ 20% degree の parasitic rate を す る こ と を confirm で き て い る.

项目成果

期刊论文数量(14)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Bursaphelenchus okinawaensis における確率論的性決定トリガーの解明
冲绳松材线虫随机性别决定触发因素的阐明
  • DOI:
  • 发表时间:
    2022
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    木村 拓己;新屋 良治
  • 通讯作者:
    新屋 良治
サツマイモネコブセンチュウは糖依存性決定?
甘薯线虫对糖有依赖性吗?
  • DOI:
  • 发表时间:
    2022
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    眞鍋 浩亮;深山 敦司;澤 進一郎;新屋 良治
  • 通讯作者:
    新屋 良治
マツノザイセンチュウの交尾行動観察で明らかになった交尾における雌の協力
通过观察日本线虫的交配行为揭示交配过程中雌性的合作
  • DOI:
  • 发表时间:
    2022
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    土井 健太郎;新屋 良治
  • 通讯作者:
    新屋 良治
Bursaphelenchus okinawaensis の dauer 誘導条件から紐解く 昆虫便乗の進化プロセス
冲绳松材线虫的dauer诱导条件揭示了昆虫搭载的进化过程
  • DOI:
  • 发表时间:
    2022
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    桐野巴瑠 ;前原紀敏 ;新屋良治
  • 通讯作者:
    新屋良治
捕食性線虫Seinura italiensis は形態的に酷似した近縁の捕食性線 虫を一方的に捕食する
捕食性线虫 Seinura italiensis 单方面捕食形态相似的密切相关的捕食性线虫。
  • DOI:
  • 发表时间:
    2022
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    浴野泰甫;新屋良治
  • 通讯作者:
    新屋良治
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Validation of the Tea Bag Index as a standard approach for assessing organic matter decomposition: a laboratory incubation experiment.
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  • 作者:
    浴野 泰甫;新屋 良治;MORI Taiki
  • 通讯作者:
    MORI Taiki
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  • DOI:
  • 发表时间:
    2022
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
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  • 通讯作者:
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  • 发表时间:
    2023
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
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  • 通讯作者:
    新屋 良治
微小な捕食者間では 体サイズに依存せず 勝敗が決定する
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  • DOI:
  • 发表时间:
    2023
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    浴野 泰甫;新屋 良治
  • 通讯作者:
    新屋 良治
Is the Tea Bag Index (TBI) useful for comparing decomposition rates among soils?
茶袋指数 (TBI) 对于比较土壤的分解率有用吗?
  • DOI:
    10.3390/ecologies3040038
  • 发表时间:
    2022
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    眞鍋 浩亮;深山 敦司;澤 進一郎;新屋 良治;高木悦郎,武井進也;MORI Taiki
  • 通讯作者:
    MORI Taiki

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  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    $ 11.15万
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    Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
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阐明极长链脂肪酸“引导神经极性决定的脂筏”形成机制
  • 批准号:
    24K09657
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    $ 11.15万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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