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主要組織適合抗原遺伝子群のDNAデ-タベ-ス構築とそのビジュアルソフトウェア開発

主要组织相容性抗原基因组DNA数据库的构建及其可视化软件开发

基本信息

批准号：
03266210
负责人：
堀寛
金额：
$ 1.6万
依托单位：
Hiroshima University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
财政年份：
1991
资助国家：
日本
起止时间：
1991 至无数据
项目状态：
已结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-03266210/
关键词：
主要組織適合抗原系遺伝子群 MHC HLA デ-タベ-スタイピング自己非自己識別

项目摘要

本研究計画は,複雑なMHC遺伝子群の情報をGenBankなどの巨大デ-タベ-スから抽出し,より効率よく利用し補完する新たな基磁デ-タベ-スと検索解析ツ-ルを提供する。さらに解析結果のコンピュ-タ表現処理ツ-ルをも提供し最終目標としてバイオソフト用WINDOWS的統合化環境を提供しようとしている。これは臨床におけるHLAタイピングの基礎情報を提供するだけでなく,主要組織適合抗原遺伝子群を基礎とする生物の自己と非自己識別の分子機構の進化を検討する上でも重要な基礎的デ-タベ-スとなる。この目的のためGenBankデ-タベ-スよりMHC遺伝子群を切り出し,その配列のCDNA化を行い,並列化の作業を行った。このデ-タベ-スを利用し解析した結果は1990年1月のヒュ-マン・ゲノムプロジエクト・シンポジウム,国際人類生物学会シンポジウム,日本人類遺伝学会において発表した。また1992年の当研究領域の班会議(東京)においてさらに発展したデ-タベ-スの紹介とそれを利用した解析結果を報告することができた。我々はまたマイコン用GENEMAPと呼ぶ遺伝子デ-タベ-スの検索,構築用ソフトのプロトタイプを開発しこれにより遺伝子をデ-タベ-スからカラ-グラフィック表示し,染色体地図上で検索することも可能にした。今後はこのデ-タベ-スをより強力なグラフィック機能を持つUnix系ワ-クステ-ションに移植しその機能を更に拡張,強化してヒュ-マンインタフェ-スの充実を計る予定である。

This study aims to provide GenBank with information on multiple MHC gene subsets, and to extract and utilize the information to complete the analysis of new MHC genes. The result of the analysis is to provide an integrated environment for Windows applications. This provides basic information on HLA identification in clinical settings, including the basis for the analysis of molecular mechanisms that are essential for the identification of antigen subsets and organisms. For this purpose, GenBank will cut out MHC gene subgroups, align them with cDNA, and coordinate them. The results of this analysis were published in January 1990 by the International Society for Human Biology and the Japanese Society for Human Genetics. In 1992, the class meeting of the current research field (Tokyo) was held to report the results of the analysis. We use GENEMAP to express the gene expression, construct the gene expression, and construct the gene expression. In the future, we will continue to expand the functions of Unix system migration and strengthen the functions of Unix system migration.