金属錯体の関与する酵素反応過程の理論的研究

金属配合物酶促反应过程的理论研究

基本信息

  • 批准号:
    04243214
  • 负责人:
  • 金额:
    $ 0.64万
  • 依托单位:
  • 依托单位国家:
    日本
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
  • 财政年份:
    1993
  • 资助国家:
    日本
  • 起止时间:
    1993 至 1995
  • 项目状态:
    已结题

项目摘要

(1)オキシヘムモデルのCASSCF計算ヘモグロビン、ミオグロビンの反応中心であるヘム酸素錯体の電子構造を明らかにするために、原子のHartree-Fockの極限に近いbasis setからなる、369軌道によるSCF-CASSCF計算を実行した。この計算はスーパーコンピュータのベクトルプロセッサの演算性能、拡張記憶とパラレルIOの高速性を利用したものである。得られた解の主電子配置の重みはわずか68%でPaulingやWeissのモデルとは全く異なるもので、d電子分布は(d_<x2-y2>)^2(d_<xz>)^2(d_<yz>)^1(d_<z2>)^1に近い。現在、各種物理量と化学的諸性質についての計算を行っている。(2)チトクロムc_3中のヘムのイオン化ポテンシャルの計算チトクロムc_3は4個のヘムを持つタンパク質で4個の電子の受渡し能力を持っている。このタンパク質には32種のイオン化ポテンシャルがあるが、最近NMRの実験により全ての値が導かれた。4個のヘムすべての鉄イオンには上下からヒスチジンのイミダゾールが配位しているが、ローカルな構造も環境も互いの間でかなり異なっている。これら4個のヘムのイオン化ポテンシャルをab initio RHF法で計算した。分子軌道法プログラムJAMOLで対称性の高い構造の解を求めてから、日電基礎研で開発されたDIRECT SCFプログラムAMOSSで対称性の低い解を求めた。これまではタンパク質による静電場の計算による見積りしか行われていなかったが、われわれの結果では、最も支配的な要因は錯体の分子構造の差異そのものであり、環境からの静電場は緩和的に働いていることが明らかにされた。
(1)CASSCF calculation of the atomic Hartree-Fock limit is performed on the basis of the 369 orbit. The calculation of this kind of computer is based on the calculation performance of the computer, the expansion memory and the high speed of the computer. The results show that the main electron configuration of the solution is 68% different, and the d electron distribution is (d_<x2-y2>)^2(d_)^2 (d<xz>_ )^1 <yz>(d_)<z2>^1. Now, all kinds of physical quantities and chemical properties are calculated. (2)The number of entries in the list c_3 is 4, and the number of entries in the list c_3 is 4. 32 kinds of NMR spectra were obtained. The most recent NMR spectra were obtained. The four groups of iron atoms are coordinated from top to bottom, and the structure and environment are different from each other. This is calculated using the ab initio RHF method. Molecular Orbital Method: JAMOL for Solving Symmetrical Structures in High and Low Levels The calculation of electrostatic field is based on the difference in molecular structure of the wrong body, the difference in environment and the difference in electrostatic field.

项目成果

期刊论文数量(24)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
M.Okamoto: "Biomimetic Switching Device:Biomimetic Approach and Application to Neural Network Study" J.Biotechnol.24. 109-127 (1992)
M.Okamoto:“仿生开关装置:仿生方法及其在神经网络研究中的应用”J.Biotechnol.24。
  • DOI:
  • 发表时间:
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
  • 通讯作者:
S.Yamamoto,H.Kashiwagi: "Theoretical Investigation on the Fe-O_2 Bond in Oxyhemoglobin" Proceedings of the Third World Congress of Theoretical Organic Chemists. 140-140 (1993)
S.Yamamoto,H.Kashiwagi:“氧合血红蛋白中 Fe-O_2 键的理论研究”第三届世界理论有机化学家大会论文集。
  • DOI:
  • 发表时间:
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
  • 通讯作者:
S.Yamamoto,H.Kashiwagi: "CASSCF calculation on Dioxygen Heme Complex with Extended Basis Set" Chem.Phys.Lett.205. 306-312 (1993)
S.Yamamoto、H.Kashiwagi:“具有扩展基础集的双氧血红素复合物的 CASSCF 计算”Chem.Phys.Lett.205。
  • DOI:
  • 发表时间:
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
  • 通讯作者:
S.Ina,Y.Hatano & H.Kashiwagi: "Computer Graphics Visualization of Electrostatic Potential around a Biomolecule" Bioimages. (1993)
伊那·波多野
  • DOI:
  • 发表时间:
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    0
  • 作者:
  • 通讯作者:
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