ロタウイルスゲノムの進化のメカニズムの解明

阐明轮状病毒基因组进化机制

• 批准号: 06273205
• 负责人: 中込 治
• 金额: $ 0.77万
• 依托单位: Akita University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
• 财政年份: 1994
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 1994 至 无数据
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-06273205/
• 关键词: ロタウイルス; ゲノム; RNA; 分子進化; 種間伝播; 遺伝子交雑

ロタウイルスは、11分節からなる2本鎖RNAをゲノムとするウイルスであり、分類上レオウイルス科に属する。ロタウイルスの特徴の1つは、著しい抗原性、および遺伝子型の多様性である。本研究では、この遺伝子の多様性がどのようにして生まれてくるのかということについて、(1)遺伝子組換え、および(2)ウイルスの宿主の種を越えた伝播にある、という仮説を立てて、臨床分離株の解析を行い、以下の結果を得た。われわれが過去12年間にわたって蓄積したロタウイルス臨床分離株のコレクションを整備し、遺伝子のRT-PCRによる分析と、ゲノム全体のゲル電気泳動法による遺伝子型分析を行った。この結果、ロタウイルスのゲノムの遺伝子型には著しい多様性がある一方、RNA-RNA hybridizationにより、遺伝子の相対的相同性の上から3つの大きなgenogroupに分けられることを明らかにした。さらに、このgenogroupが原則として、特定のG型とP型の組合せを決定している要因となっていることを強く示唆する結果を得た。一方、genogroupが異なるウイルス株の間でも、低頻度ではあるが、遺伝子分節の組換えがおこり、そのようなウイルスが自然界に存在することを明らかにした。さらに、ロタウイルスのP血清型を規定する遺伝子のうち、今まで未知であった3つの対立遺伝子の全塩基配列を決定し、すでに塩基配列が知られていた対立遺伝子と合せて、分子系統樹を作成して、それらの進化的関係を明らかにしようと試みた。その結果、系統樹の分岐パターンと分離株間の遺伝距離の関係から、動物ロタウイルスがヒトに感染するという、interspecies transmissionが起こっていることが明らかとなった。

2. The RNA of this gene must be classified according to its family. 1. Antigenicity, diversity and genetic type of the virus. In this study, the diversity of these genes was analyzed, and the following results were obtained: (1) gene sub-group transformation,(2) host species transformation, and analysis of clinical isolates. For the past 12 years, the accumulation of DNA in clinical isolates has been carried out by RT-PCR analysis and DNA sequencing. As a result, there are three different genogroups in the gene type, one in the RNA-RNA hybridization, and the other in the gene type. The principle of "genogroup" and the specific combination of "G" and "P" are determined by the results. A party, a genogroup, a plant, a low frequency, a sub-segment, a group, a sub-segment, a group, a group, a sub-segment, a sub-segment, a The complete base alignment of 3 pairs of genes is determined, and the base alignment of 3 pairs of genes is determined. The genetic relationships of 3 pairs of genes are determined, and the genetic relationships of 3 pairs of genes are determined. Results, phylogenetic tree divergence, genetic distance between isolates, animal species transmission, infection, interspecies transmission