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ロドプシンの発色団レチナ-ル光異性化のトンネル反応機構

ロドプシンの発色団レチナ-ル光異性化のトンネル反応機構
视紫质发色团视网膜光异构化的隧道反应机制
批准号:
08240220
负责人:
垣谷 俊昭
金额:
$0.77万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
财政年份:
1996
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
1996 至 --

项目摘要

项目成果

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高度好塩菌バクテリオロドプシンの発色団レチナ-ルの超高速光異性化のダイナミックスを明らかにするために吸収スペクトルのフーリエ変換法(FTOA)による解析をおこなった。すなわち、励起フランク・コンドン状態からスタートする振動の波束の運動を時間相関関数(tcf)によって追跡した。今回特に工夫したところは、異性化するボンド13=14のねじれを困難にするように化学修飾した発色団レチナ-ルを組み込んだバクテリオロドプシンに対して解析を行ったことである。その結果を化学修飾しないバクテリオロドプシンの以前の結果と比べると、化学修飾した効果は100fs迄にあまり顕著に現れず、100fsから200fsにかけてtcfの絶対値の明らかな減少(最大-桁)が見られた。また、tcfの位相も100fsから200fsにかけて大きな変化が見られた。200fs以降は化学修飾する、しないに関わらず位相が急激に変化した。これらのことは 13=14 ボンドの本格的な異性化反応は100fs 位から開始され、200fsぐらいからトンネル遷移の状態に入ることを強く示唆する。実際には、tcfの絶対値は100fs迄に急峻な減少(4-5桁)があり、これが異性化反応の運動と直接結びついていないことになる。最近の我々のおこなった分子動力学シミュレーションの結果においても、励起状態ダイナミックスは初期状態により非常に異なった経路を取ることがしめされている。したがって、励起状態にあがった直後の発色団の運動は多岐に渡っており、100fs 程度経ってから、雑多な運動が13=14ボンドのねじれ運動に集約されていく描像が描かれる。今後 FTOA の解析から得られたデータを分子動力学シミュレーションの解析から得られたデータと詳細に比較して、上の結論を確かめる作業を行う予定である。
期刊论文(2)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
R.Akiyama et al.: "Analysis of the excited-state dynamics of 13-trans-locked-bacteriorhodopsin" J.Phys.Chem.101. 412-417 (1997)
R.Akiyama 等人:“13-反式锁定细菌视紫红质的激发态动力学分析”J.Phys.Chem.101。
DOI: --
发表时间:
期刊:
影响因子: --
作者: []
通讯作者:
R.Akiyama et al.: "Analysis of the temperature dependence of femtosecond excited state dynamics of bacteriorhodopsin by spin-boson model" Chemical Physics Letters. 256. 165-171 (1996)
R.Akiyama 等人:“通过自旋玻色子模型分析细菌视紫红质飞秒激发态动力学的温度依赖性”化学物理快报。
DOI: --
发表时间:
期刊:
影响因子: --
作者: []
通讯作者:
蛋白質中電子移動経路を決める新しい方法
  • 批准号:
    12042235
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
  • 资助金额:
    $2.3万
  • 财政年份:
    2000
  • 负责人:
    垣谷 俊昭
  • 依托单位:
非線形電極反応のメカニズム
  • 批准号:
    11166230
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
  • 资助金额:
    $1.02万
  • 财政年份:
    1999
  • 负责人:
    垣谷 俊昭
  • 依托单位:
電極反応機構の理論的研究
  • 批准号:
    11118233
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
  • 资助金额:
    $1.09万
  • 财政年份:
    1999
  • 负责人:
    垣谷 俊昭
  • 依托单位:
電極反応機構の理論的研究
  • 批准号:
    10131232
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
  • 资助金额:
    $1.02万
  • 财政年份:
    1998
  • 负责人:
    垣谷 俊昭
  • 依托单位: