喘息の感受性遺伝子の多変量解析的アプローチ

哮喘易感基因的多变量分析方法

• 批准号: 16012204
• 负责人: 鈴木 洋一
• 金额: $ 2.24万
• 依托单位: Chiba University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
• 财政年份: 2004
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2004 至 无数据
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-16012204/
• 关键词: 喘息; 遺伝子多型; 多変量解析; ハプロタイプ; 補体; アドレナリン受容体; ロイコトリエン受容体; インターロイキン4受容体

本研究は、複数の疾患感受性遺伝子の遺伝子多型から、喘息発症のリスクをどの程度まで推定できるのかを明らかにすることを目的とする。これまで、喘息感受性候補遺伝子として80遺伝子、320以上の一塩基多型をスクリーニングし、複数の遺伝子が疾患との相関を示すことを見出してきたが、それら複数の感受性遺伝子からのロジェスティック回帰による疾患発症予測がどの程度可能か、Area Under ROC curve (AUC)を中心に用い評価した。また、本年度には、各遺伝子のハプロタイプまたは、多アレルマーカーの喘息発症リスクへの相互作用をスクリーニングするプログラムを開発し、これまでSNP単位でしか相互作用の項を検討できなかった限界を改善した。小児喘息の発症に関しては、捕体C3、β2アドレナリン受容体、IL-4受容体α、ロイコトリエン受容体CysLT2などの11の遺伝子多型を組み合わせると、AUC値は0.861、NagelkerkeのR2乗は0.491であった。これら遺伝子に、2組の遺伝子間の相互作用を加えると、AUCとR2乗の値はそれぞれ、8.87、0.549となった。得られたAUCの値は、小児喘息とコントロールを、肺機能検査や一酸化窒素排出量によって識別を試みた研究(Malmberg LP (2003) Thorax58:494-499)で得られた、肺機能検査のAUC値(0.76〜0.77)よりは良好で、一酸化窒素排出量による値(0.91)よりやや劣っていた。今回の結果は、遺伝子多型からの疾患の有無の診断において、一般的な臨床検査と同程度の成績が期待出来る事を示している。

は, this study traces of plural の disease susceptibility 伝 child の but 伝 polymorphism か ら, breathing 発 の リ ス ク を ど の degree ま で presumption で き る の か を Ming ら か に す る こ と を purpose と す る. こ れ ま で, breathing feelings of sexual alternate heritage 伝 son と し て 80 legacy 伝 son, more than 320 の a salt Quito を ス ク リ ー ニ ン グ し, plural の but 伝 が disorders と の phase masato を shown す こ と を shows し て き た が, そ れ ら plural の susceptibility heritage 伝 son か ら の ロ ジ ェ ス テ ィ ッ ク back 帰 に よ 発 る disease syndrome can be が ど の degree may か, Area Under the ROC curve (AUC)を center に uses を to comment on 価 た た. ま た, this year's に は, all survived 伝 の ハ プ ロ タ イ プ ま た は, multiple ア レ ル マ ー カ ー の breathing 発 disease リ ス ク へ の interaction を ス ク リ ー ニ ン グ す る プ ロ グ ラ ム を open 発 し, こ れ ま で SNP 単 a で し か interaction の item を beg で 検 き な か っ た limit を improve し た. Small where breathing の 発 disease に masato し て は, catching C3, beta 2 ア ド レ ナ リ ン by capacity, IL - 4 by let alpha, ロ イ コ ト リ エ ン by let body CysLT2 な ど の 11 の heritage 伝 child group type を み multiplexing わ せ る と, AUC numerical は 0.861, Nagelkerke の R2 乗 は 0.491 で あ っ た. こ れ ら heritage 伝 に, two groups の heritage の interaction between 伝 son を plus え る と, AUC と R2 乗 の numerical は そ れ ぞ れ, 8.87, 0.549, と な っ た. Have ら れ た AUC の numerical は, small where the breathing と コ ン ト ロ ー ル を, lung function 検 や a acidification smothering element discharge に よ っ て recognition を try み た research (Malmberg LP (2003). Thorax58:494-499) で ら れ た, lung function 検 の AUC nt (0.76 ~ 0.77) よ り は good で, a acidification smothering discharge に よ る nt (0.91) よ り や や substandard っ て い た. Today back は の results, but 伝 polymorphism か ら の presence of の の disease diagnosis に お い て, general clinical 検 な と の grades が looking forward to the same extent out る matter を shown し て い る.

项目成果

遺伝子相互作用の解析

基因相互作用分析

• 发表时间: 2004
• 期刊: アレルギー・免疫 11
• 作者: Tomita;Y. et al.;鈴木洋一;鈴木洋一
• 通讯作者: 鈴木洋一

Association between genetic variation in the gene for death-associated protein-3 (DAP3) and adult asthma

• DOI: 10.1007/s10038-004-0161-4
• 发表时间: 2004-07-01
• 期刊: JOURNAL OF HUMAN GENETICS
• 影响因子: 3.5
• 作者: Hirota, T;Obara, K;Tamari, M
• 通讯作者: Tamari, M

Artificial neural network approach for selection of susceptible single nucleotide polymorphisms and construction of prediction model on childhood allergic asthma.

• DOI: 10.1186/1471-2105-5-120
• 发表时间: 2004-09-01
• 期刊: BMC bioinformatics
• 影响因子: 3
• 作者: Tomita Y;Tomida S;Hasegawa Y;Suzuki Y;Shirakawa T;Kobayashi T;Honda H
• 通讯作者: Honda H

喘息治療に影響を与える遺伝子-喘息の薬理遺伝学-

影响哮喘治疗的基因 - 哮喘的药物遗传学 -

• 发表时间: 2004
• 期刊: International Review of Asthma 6
• 作者: Tomita;Y. et al.;鈴木洋一
• 通讯作者: 鈴木洋一

Association of the hCLCA1 gene with childhood and adult asthma

• DOI: 10.1038/sj.gene.6364124
• 发表时间: 2004-11-01
• 期刊: GENES AND IMMUNITY
• 影响因子: 5
• 作者: Kamada, F;Suzuki, Y;Matsubara, Y
• 通讯作者: Matsubara, Y