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シロイヌナズナのフェノーム解析と4000遺伝子についての破壊株の作製

シロイヌナズナのフェノーム解析と4000遺伝子についての破壊株の作製
拟南芥表型分析和 4000 个基因的破坏菌株的创建
批准号:
16011265
负责人:
黒森 崇
金额:
$3.84万
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
财政年份:
2004
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2004 至 --

项目摘要

项目成果

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1.シロイヌナズナのトランスポゾン挿入変異体の育成と発芽率の測定植物変異開発研究チームがこれまでに作製していたトランスポゾン挿入変異株の中で、遺伝子への挿入が予測されるラインを選別し、1,478ライン(合計4,768ライン)について種子50粒ずつをプレート培地に播種し、発芽率・初期育成率を測定した。これまでの結果を合計すると発芽率については、4,215ライン(88%)が80%以上の発芽率を示したのに対し、212ライン(4.4%)については発芽率70%未満であり、発芽に影響のある遺伝子変異体の候補と考えられた。育成率については110ライン(2.3%)が50%未満の育成率を示し、これらの変異体は致死表現型の候補と考えられた。2.シロイヌナズナの形態観察による表現型データの記録プレートで約3週間育成の後、各ライン8個体ずつを土に植え換え植物体を育て、形態に異常の観察されるラインについてデジタル画像によって記録を取った。これまでに行った植物体地上部の観察で比較的はっきりした表現型を示したのは265ライン(5.5%)だった。その中には、植物体の矮性・アルビノ形質・植物体の色が薄い・遅咲き・葉の形態異常・茎の形態異常・花の形態異常・さやの形態異常など様々な表現型が含まれていた。3.シロイヌナズナの遺伝子破壊系統の選別と各種スクリーニング上記表現型解析の過程で、647ライン(合計1,965ライン)はトランスポゾンがホモに挿入されており、遺伝子破壊株系統になっていると予測された。それらの植物個体から種子回収を行い、地上部観察では見ることのできなかった根・根毛・胚軸・トライコームの定量的表現型スクリーニングと、環境ストレス条件下での耐性変異体のスクリーニングを始めた。
期刊论文(10)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
The HALTED ROOT (HLR) gene encoding the 26S proteasome subunit RPT2a is essential for the maintenance of Arabidopsis meristems.
编码 26S 蛋白酶体亚基 RPT2a 的 HALTED ROOT (HLR) 基因对于拟南芥分生组织的维持至关重要。
DOI: --
发表时间: 2004
期刊: Development 131
影响因子: --
作者: [Susumu Mochizuki, Minako Ueda]
通讯作者: Minako Ueda
Quantitative trait loci analysis of nitrate storage in Arabidopsis leading to an investigation of the contribution of the anion channel gene, AtGLC-c, to variation
拟南芥硝酸盐储存的数量性状位点分析导致研究阴离子通道基因 AtGLC-c 对变异的贡献
DOI: --
发表时间: 2004
期刊: Journal of Experimental Botany 55
影响因子: --
作者: [Kiyosawa H., Mise N., Iwase S., Hayashizaki H., Abe K., Sakurai T, Takei K, Harada H]
通讯作者: Harada H
DOI: 10.1093/pcp/pcg158
发表时间: 2003-11-01
期刊: PLANT AND CELL PHYSIOLOGY
影响因子: 4.9
作者: [Nishimura, T, Yokota, E, Okada, K]
通讯作者: Okada, K
LARGE : a large-scale database of RIKEN Arabidopsis resources ranging from transcriptome to phenome.
LARGE:从转录组到表型组的 RIKEN 拟南芥资源的大型数据库。
DOI: --
发表时间: 2005
期刊: Nucleic Acids Research 33
影响因子: --
作者: [Kiyosawa H., Mise N., Iwase S., Hayashizaki H., Abe K., Sakurai T]
通讯作者: Sakurai T
水分ストレスネットワークの時空間的制御の視覚化
  • 批准号:
    22K06273
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
  • 资助金额:
    $2.66万
  • 财政年份:
    2022
  • 负责人:
    黒森 崇
  • 依托单位:
シロイヌナズナのフェノーム解析とデータベースの作製
シロイヌナズナの4000遺伝子についての破壊株の作製とフェノーム解析
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