シロイヌナズナのフェノーム解析と4000遺伝子についての破壊株の作製

拟南芥表型分析和 4000 个基因的破坏菌株的创建

• 批准号: 16011265
• 负责人: 黒森 崇
• 金额: $ 3.84万
• 依托单位: The Institute of Physical and Chemical Research
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
• 财政年份: 2004
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2004 至 无数据
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-16011265/
• 关键词: シロイヌナズナ; タグライン; フェノーム解析

1.シロイヌナズナのトランスポゾン挿入変異体の育成と発芽率の測定植物変異開発研究チームがこれまでに作製していたトランスポゾン挿入変異株の中で、遺伝子への挿入が予測されるラインを選別し、1,478ライン(合計4,768ライン)について種子50粒ずつをプレート培地に播種し、発芽率・初期育成率を測定した。これまでの結果を合計すると発芽率については、4,215ライン(88%)が80%以上の発芽率を示したのに対し、212ライン(4.4%)については発芽率70%未満であり、発芽に影響のある遺伝子変異体の候補と考えられた。育成率については110ライン(2.3%)が50%未満の育成率を示し、これらの変異体は致死表現型の候補と考えられた。2.シロイヌナズナの形態観察による表現型データの記録プレートで約3週間育成の後、各ライン8個体ずつを土に植え換え植物体を育て、形態に異常の観察されるラインについてデジタル画像によって記録を取った。これまでに行った植物体地上部の観察で比較的はっきりした表現型を示したのは265ライン(5.5%)だった。その中には、植物体の矮性・アルビノ形質・植物体の色が薄い・遅咲き・葉の形態異常・茎の形態異常・花の形態異常・さやの形態異常など様々な表現型が含まれていた。3.シロイヌナズナの遺伝子破壊系統の選別と各種スクリーニング上記表現型解析の過程で、647ライン(合計1,965ライン)はトランスポゾンがホモに挿入されており、遺伝子破壊株系統になっていると予測された。それらの植物個体から種子回収を行い、地上部観察では見ることのできなかった根・根毛・胚軸・トライコームの定量的表現型スクリーニングと、環境ストレス条件下での耐性変異体のスクリーニングを始めた。

1. The rate of buds of plants was determined by the determination of the percentage of buds after they were bred in the body. The seeds were introduced into the plants, and the seeds were added to the election, 1478 yuan (a total of 4768 yuan), 50 seeds were planted on the ground, and the seeds were planted on the ground. The initial growth rate of bud rate was measured. The results showed that the percentage of buds was 4215, 80%, 4.4%, 4.4%, 4.4%, 4.4%, 4.4%, 4.4%, 4.4%, 4.4%, 4.4%, 4.4%, 4.4%, 4.4%, 4.4%, 4.4%, 4.4%. Fertility rate (2.3%), 50% (2.3%), 50% (2.3%), 50% (2.3%), 50% (2.3%), 50% (2.3%), 50% (2.3%), 50% (2.3%), 50% (2.3%), 50% (2.3%), 50% (2.3%), 50% (2.3%), 50% (2.3%). two。 After being bred in about 3 years, 8 plants in each plant were used to monitor the shape of the plant, and the images were collected. The above ground part of the plant body is displayed in the table type of the plant body. The shape of the plant is thin, the shape is thin, the shape is thin, the shape 3. In order to analyze the characteristics of the system, the data of each kind of system was analyzed. (a total of 1965 yuan), the data of each system was analyzed, and the results were analyzed. There is a quantitative analysis of the root hair, the embryo of the root hair, the embryo of the plant and the environmental environment under the conditions of environmental protection and environmental protection.

项目成果

The HALTED ROOT (HLR) gene encoding the 26S proteasome subunit RPT2a is essential for the maintenance of Arabidopsis meristems.

编码 26S 蛋白酶体亚基 RPT2a 的 HALTED ROOT (HLR) 基因对于拟南芥分生组织的维持至关重要。

• 发表时间: 2004
• 期刊: Development 131
• 作者: Susumu Mochizuki;Minako Ueda
• 通讯作者: Minako Ueda

Quantitative trait loci analysis of nitrate storage in Arabidopsis leading to an investigation of the contribution of the anion channel gene, AtGLC-c, to variation

拟南芥硝酸盐储存的数量性状位点分析导致研究阴离子通道基因 AtGLC-c 对变异的贡献

• 发表时间: 2004
• 期刊: Journal of Experimental Botany 55
• 作者: Kiyosawa H.;Mise N.;Iwase S.;Hayashizaki H.;Abe K.;Sakurai T;Takei K;Harada H
• 通讯作者: Harada H

An Arabidopsis ACT2 dominant-negative mutation, which disturbs F-actin polymerization, reveals its distinctive function in root development

• DOI: 10.1093/pcp/pcg158
• 发表时间: 2003-11-01
• 期刊: PLANT AND CELL PHYSIOLOGY
• 影响因子: 4.9
• 作者: Nishimura, T;Yokota, E;Okada, K
• 通讯作者: Okada, K

LARGE : a large-scale database of RIKEN Arabidopsis resources ranging from transcriptome to phenome.

LARGE：从转录组到表型组的 RIKEN 拟南芥资源的大型数据库。

• 发表时间: 2005
• 期刊: Nucleic Acids Research 33
• 作者: Kiyosawa H.;Mise N.;Iwase S.;Hayashizaki H.;Abe K.;Sakurai T
• 通讯作者: Sakurai T

AtJPT3 is a key determinant of nitrate-dependent cytokinin biosynthesis in Arabidopsis.

AtJPT3 是拟南芥中硝酸盐依赖性细胞分裂素生物合成的关键决定因素。

• 发表时间: 2004
• 期刊: Plant and Cell physiology 45
• 作者: Kiyosawa H.;Mise N.;Iwase S.;Hayashizaki H.;Abe K.;Sakurai T;Takei K
• 通讯作者: Takei K