シンビオジェネシスにおける共生者ゲノムの縮小進化に関する研究

共生发生中共生体基因组收缩进化研究

基本信息

批准号：
16013214
负责人：
石田健一郎
金额：
$ 3.26万
依托单位：
Kanazawa University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
财政年份：
2004
资助国家：
日本
起止时间：
2004 至无数据
项目状态：
已结题

项目摘要

本研究では、二次共生由来の生物であり、葉緑体の祖先真核藻の痕跡核であるヌクレオモルフ(Nm)を有するクロララクニオン藻について、Nmゲノムサイズの多様性を明らかにし、その進化傾向を推察することを目的とした。これまでNmゲノムサイズの調査がされていない主要系統群を代表する3株:BC52、CCMP2058(Lotharella amoebiformis)、CCMP2057(Gymnochlora stellata)を含む合計5株について、パルスフィールド電気泳動法を用いNm染色体を分離し、各Nm染色体に必ず存在する18SrDNAをプローブにサザンハイブリダイゼーションを行ない、各Nm染色体の数とサイズを推定した。その結果、5株のうち4株は、以前の報告と同様3本の直鎖状Nm染色体をもつことがわかった。残る1株(L.amoebiformis)は4本の染色体を持つ可能性が示唆された。Nm染色体の数は必ず3本であるとされており、もし4本の染色体が本当だとしたら、今後のNmゲノム進化の研究の発展において重要な知見となる。いずれにせよ本藻群全体のNmゲノムサイズは、約350〜405(あるいは455)kbの範囲となり、クロララクニオン藻内でゲノムサイズに多様性があることが再確認された。また核コード18SrDNAの分子系統樹をもとにNmゲノムサイズの進化を考えると、1)Nmゲノムは、本藻群の分岐以前に現存のサイズと同程度まで縮小し、その後非コード領域等でサイズの増減がおこった、2)Nmゲノムは、常に減少傾向にあり、全ての系統群で独立にサイズの減少がおこった、のどちらかである可能性が示唆された。なお、本研究成果は、第15回国際進化原生生物学会大会(2005年1月、メルボルン・オーストラリア)および第29回日本藻類学会大会(2005年3月、京都)で口頭発表を行なった。

这项研究旨在阐明NM基因组大小的多样性，并推断氯酸藻类藻类的进化趋势，藻类藻类（一种二次共生生物体和核素），核叶祖先祖先真核生物藻类的痕量核（NM）。总共五种菌株，包括BC52，CCMP2058（lotharella amoebifieris）和CCMP2057（Gymnochlora stellata），代表尚未研究NM基因组大小的主要菌株，使用NM染色体始终使用脉冲型电场表演，以表演的是NM染色体，以至于表现出18S，以表现出18S，并表演了18S，该均表现为18S，以表现出18S，以表演的是nm hymiD inm inm inm inm inm inm inm inm inm inm inm inm inm inm inm inm inm inm inm inm inm inm inm inm inm inm inm inm inm inm inm inm inm n.作为估计每个NM染色体的数量和大小的探针。结果表明，如先前的报道，这五个菌株中有四个具有三个线性NM染色体。有人提出剩余的菌株（L. amoebiformis）可能具有四个染色体。据说总是有三个NM染色体，如果四个染色体是正确的，那么这将是对NM基因组进化研究的未来发展的重要发现。无论如何，整个主要藻类组的NM基因组大小范围约为350至405（或455）kb，并且已经重申，基因组大小在藻类藻类内存在多样性。此外，考虑到基于NM基因组大小的演变，基于核编码的18srDNA的分子系统发育树的演变，建议1）NM基因组降低到与主要藻类分支之前的现有大小相同的大小，然后在非编码区域中增加或降低NM的大小，并在nm中增加了nm的大小。系统发育群体独立。这项研究的结果是在第15届进化原生动物生物学国际会议上口头介绍的（2005年1月，墨尔本和澳大利亚）和日本呼吸道学会第29届会议（2005年3月，京都）。