ハイブリッド関数ペトリネットによる多細胞動物のパターン形成シミュレーション
使用混合功能 Petri 网模拟多细胞动物的模式形成
基本信息
- 批准号:16014216
- 负责人:
- 金额:$ 2.69万
- 依托单位:
- 依托单位国家:日本
- 项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
- 财政年份:2004
- 资助国家:日本
- 起止时间:2004 至 无数据
- 项目状态:已结题
- 来源:
- 关键词:
项目摘要
ハイブリッド関数ペトリネット(HFPN)よる濃度勾配による細胞分化システムのモデル化手法を考案した。ショウジョウバエのwingless(Wg)は、ショウジョウバエ胚の消化管における肛門部から分泌されるタンパク質である。この濃度は発生源近くでは高く、距離が離れるに従って低下し、濃度勾配を形成する。濃度のある閾値超えた細胞は直腸に分化し、それ以下の細胞は大腸に分化するが、この濃度勾配による細胞分化機構をHFPNによってモデル化し、Genomic object Net (GoN)を用いてシミュレーショ'ンを行った。上記の多細胞動物パターン形成モデル化手法に加えて、マウス時計遺伝子機構のモデル化とシミュレーションを行った。これまでにマウスで知られ,ているサーカディアン遺伝子制御作用もとにHFPNモデルを作成し、GONでシミュレーションしたところ、実験的に知られている事実と矛盾する結果が得られた。そこで、ショウジョウバエでは確かめられている遺伝子制御作用をマウスに導入したところ、この矛盾が解消された。このことは、マウスにもこの作用が存在することを示唆している。さらにこれまでの研究成果を公開するため、Genomic Object Net Pathway Database (GON Pathway DB) http://genome.ib.sci.yamaguchi-u.ac.jp/~gon/を作成した。
A study of cell differentiation and differentiation methods for HFPN concentration matching It's not a good idea. It's a good idea. It's a good idea. The concentration is high, the distance is low, and the concentration is matched. The concentration of the above threshold value of cell differentiation in the rectum, the following cells in the colon differentiation, the concentration of the above threshold value of cell differentiation mechanism in HFPN, Genomic object Net (GoN) in the middle of the process. The multi-cell animals described above are formed by means of chemical reaction, chemical reaction and chemical reaction. The result of this is that we have to make sure that we have a good understanding of the relationship between the two. It's not a good idea to have a good time. This is the first time I've ever seen you. Genomic Object Net Pathway Database (GON Pathway DB) http://genome.ib.sci.yamaguchi-u.ac.jp/<$gon/was completed.
项目成果
期刊论文数量(14)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Constructing biological pathway models with hybrid functional Petri nets
使用混合功能 Petri 网构建生物途径模型
- DOI:
- 发表时间:2004
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:Doi;A.
- 通讯作者:A.
Modeling and simulation of fission yeast cell cycle on hybrid functional Petri net
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- DOI:
- 发表时间:2004
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:Fujita;S.
- 通讯作者:S.
A versatile Petri net based architecture for modeling and Simulation of complex biological processes
一种基于 Petri 网的多功能架构,用于复杂生物过程的建模和仿真
- DOI:
- 发表时间:2004
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:Nagasaki;M.
- 通讯作者:M.
Bioinformatics Technologies (Computational Modeling of Biological Processes with Petri Net-Based Architectureの章担当)(Yi-Ping Phoebe Chen編)
生物信息学技术(基于 Petri 网的体系结构的生物过程计算建模章节)(由 Yi-Phoebe Chen 编辑)
- DOI:
- 发表时间:2005
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:Nagasaki;M.
- 通讯作者:M.
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