分子シグナルから細胞運動への統合的システム生物学に関する研究
分子シグナルから細胞運動への統合的システム生物学に関する研究
批准号:
17017028
负责人:
石井 信
金额:
$1.92万
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
财政年份:
2005
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2005 至 --
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本研究は、低分子量Gタンパク質の相互作用が関わるシグナル伝達と、細胞骨格系タンパク質が生み出す細胞運動との融合モデルを作ることが目的である。つまり、タンパク質相互作用による「生化学反応系」を超えて、空間的な現象、すなわち細胞形状変化や細胞走性といった「物理現象系」をも含めた生命システムの統合的理解を目指すものである。具体的には、細胞運動の制御ダイナミクスを解明するためのシステム生物学を、シミュレーションと一分子時空間計測技術を併用して実施する。研究代表者の石井と分担者の作村は、神経細胞の軸索誘導機構について、Gタンパク質相互作用の特性から説明するモデル研究を行ってきた。現象の本質を見るために、細胞骨格形成との関係が深いと考えられるRhoファミリー低分子量Gタンパク質の相互作用を主要反応系として簡略化し、Gタンパク質の相互作用によって、非線形な応答特性を持ち得ることが示された。成長円錐モデルにおいては、局所非線形応答を仮定し、その非線形応答によって軸索が細胞外誘導因子の勾配を検知し、伸長していく能力があることを示した(Sakumura et al.,Biophys.J. 89, 812-822,2005)。しかし、このモデルでは、上流の受容体及びPI3キナーゼシグナル、下流のアクチン細胞骨格形成に至る部分は、簡略化を行った。そのため、分担者の中村は、軸索成長円錐におけるFRETイメージングを行い、Gタンパク質の上流(PI3K)と下流(アクチン)の時空間計測を行い、成長円錐の形態とGタンパク質の活性分布との関係を調査した(Nakamura et al.,Mol. Brain Res. 139,277-287,2005)。今後は、成長円錐内Ca^<2+>濃度の局所性による生化学反応特性も考慮する必要があるが、石井と作村はシナプス可塑性の分子メカニズムにおける局所Ca^<2+>シグナルに関する研究を行っており(Honda et al.,Mol.Sys.Biol. doi:10.1038/msb4100035)、本研究にも応用できると考えている。
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DOI:
10.1529/biophysj.104.055624
发表时间:
2005-08
期刊:
Biophysical journal
影响因子:
3.4
作者:
[Y. Sakumura;Yuki Tsukada;N. Yamamoto;Shin Ishii]
通讯作者:
Y. Sakumura;Yuki Tsukada;N. Yamamoto;Shin Ishii
Local Signaling with Diffusion Process as a Decoder of Ca2+ Signals in Synaptic Plasticity
具有扩散过程的局部信号作为突触可塑性中 Ca2 信号的解码器
DOI:
--
发表时间:
2005
期刊:
Molecular Systems Biology
影响因子:
9.9
作者:
[Sato, T., et al., Y.Sakumura, T.Nakamura, N.Honda]
通讯作者:
N.Honda
DOI:
10.1016/j.molbrainres.2005.05.030
发表时间:
2005-10-03
期刊:
MOLECULAR BRAIN RESEARCH
影响因子:
--
作者:
[Nakamura, T, Aoki, K, Matsuda, M]
通讯作者:
Matsuda, M
Stochastic Resonance with Differential Code in Feedforward Network with Intra-layer Random Connections.
具有层内随机连接的前馈网络中差分码的随机共振。
DOI:
--
发表时间:
期刊:
Neural Networks (In press)
影响因子:
--
作者:
[Sato, T., et al., Y.Sakumura, T.Nakamura, N.Honda, Y.Sakumura]
通讯作者:
Y.Sakumura
Generative adversarial brain: a comprehensive study of multi-agent learning by natural and artificial intelligence
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批准号:22H04998
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (S)
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资助金额:$123.88万
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财政年份:2022
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负责人:石井 信
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依托单位:
敵対生成脳の計算理論と人工知能応用
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批准号:22H00534
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (A)
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资助金额:$27.21万
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财政年份:2022
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负责人:石井 信
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依托单位:
細胞の形状変化と分子シグナルとの多次元相互作用に関する研究
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批准号:18016021
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$5.5万
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财政年份:2006
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负责人:石井 信
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依托单位:
Gタンパク相互作用によって制御される軸索誘導の動作機構
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批准号:16014214
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$2.3万
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财政年份:2004
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负责人:石井 信
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依托单位:
スパースガウシアンネットワークによる遺伝子ネットワークの構造推定
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批准号:15014222
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$2.11万
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财政年份:2003
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负责人:石井 信
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依托单位:
時空間トランスクリプトーム解析に基づく転写制御ネットワークの推定
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批准号:14015223
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.92万
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财政年份:2002
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负责人:石井 信
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依托单位:
組合せ最適化問題のためのカオス的ニューラルネットモデルの数理と大規模問題への応用
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批准号:10750278
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$1.34万
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财政年份:1998
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负责人:石井 信
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依托单位:
海外基金