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DDM1によるヘテロクロマチン形成にRNA分子が関与する可能性

RNA 分子参与 DDM1 异染色质形成的可能性

基本信息

批准号：
17026036
负责人：
柴原慶一
金额：
$ 3.33万
依托单位：
National Institute of Genetics
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
财政年份：
2005
资助国家：
日本
起止时间：
2005 至 2006
项目状态：
已结题

项目摘要

SWI/SNF型のATPaseドメインをもつDDM1は、高等植物からヒトに至る広範な生物種で保存された因子であり、そのシロイヌナズナ変異株では、DNAメチル化低下、ヒストン修飾異常、ジーンサイレンシングの脱抑制、ヘテロクロマチン形成異常などが観察される。我々は申請段階で、ヒトDDM1がRNaseA感受性分子を含む高分子複合体を形成するという予備データを得ていたので、「ヒトDDM1複合体を精製し、その複合体中のRNaseA感受性分子を同定、解析する」という実践課題をたて、RNase感受性分子がヘテロクロマチン形成に果す役割の解明を目指した。労力と時間を費やし様々な方法を試みたが、ヒトDDM1蛋白複合体及びRNase感受性分子の同定には至らなかった。申請時の予備データには再現性があるが、現時点では、ヒトDDM1は安定的な結合する相互作用因子を持たない、仮にRNase感受性分子と機能的に相互作用するとしても、その分子は単一ではなく多様な分子であるという推論に至っている。こうした状況を考慮し、ヒト培養細胞にてヒトDDM1遺伝子の人為的発現抑制をかける際に、最初に現れるエピジェネティク修飾の異常を検出することによりDDM1の作用機序を探るという別課題を並行して進めた。その過程で、「ヒト培養細胞における、誘導型のノックアウト系」の開発(特願2006)といった副次的な成果を得た。今後この系は広く他の必須遺伝子の解析に適応される期待がもてる。さて、作製したヒトDDM1変異細胞株を解析した結果、DDM1の発現消失後、DNAのメチル化は極めて緩やかに低下することが示された。このことは、DDM1の第一作用点が、必ずしもDNAのメチル化ではないことを示唆している。今後の解析により、DDM1を介したヘテロクロマチン形成機構、及び、RNase感受性分子の関与の理解の進展を期待したい。

SWI/SNF-type ATPase selection factor DDM1, higher plant species from the beginning to the end of the preservation factor, all kinds of species from the beginning to the end of the mutant plant, DNA mutation, abnormal DNA modification, de-inhibition of the enzyme, abnormal formation of the enzyme. We have applied for the preparation of DDM1-RNase A-sensitive molecules and polymer complexes containing DDM1-DDM1. We have identified and analyzed the RNase A-sensitive molecules in DDM1-DDM1 complexes. The method of determining the protein complex of DDM1 and RNase receptor was studied. Application time and preparation time and reproducibility time and stability time and stability The status of DDM1 gene expression in cultured cells was considered, and the mechanism of DDM1 gene expression was explored. The development of the process,"culture of cells, induction of cells"(Special Application 2006), and the development of secondary results were obtained. In the future, this system will not be able to analyze the necessary information. The results of analysis of DDM1 mutant cell lines show that DDM1 gene expression disappears, and DNA gene expression decreases. The first point of action of DDM1 must be detected. Future progress in the analysis and understanding of DDM1 receptor mechanisms and RNase receptor molecules is expected.

项目成果

期刊论文数量（12）

专著数量（0）

科研奖励数量（0）

会议论文数量（0）

专利数量（0）

Chromatin assembly factor I ensures the stable maintenance of silent chromatin states in Arabidopsis.

染色质组装因子 I 确保拟南芥中沉默染色质状态的稳定维持。

DOI：
发表时间：
2006
期刊：
Genes Cells (Cover to this issue) 18
影响因子：
0
作者：
Ono;T.;Kaya;H.;Takeda;S.;Abe;Y.;Ogawa;Y.;Kato;M.;Kakutani;T.;Scheid.OM;Araki;T.;Shibahara;K-i
通讯作者：
K-i

Asfl is required for viability and chromatin assembly during DNA replication in vertebrate cells.

Asfl 是脊椎动物细胞 DNA 复制过程中活力和染色质组装所必需的。

DOI：
发表时间：
2006
期刊：
Journal of Biological Chemistry 281
影响因子：
0
作者：
Kline;S.;Cheeseman;I.M.;Hori;T.;Fukagawa;T.;Desai;A.;Masahiro Okada;Hiroshi Kimura;Masahiro Okada;Susan Kline;Fumiyuki Sanematsu
通讯作者：
Fumiyuki Sanematsu

標的組換え細胞とランダム組換え細胞を判別する方法及びその用途

区分目标重组细胞和随机重组细胞的方法及其用途

DOI：
发表时间：
2006
期刊：
影响因子：
0
作者：
通讯作者：

Enhanced homologous recombination and T-DNA integration in chromatin assembly factor-1 mutants in Arabidopsis thaliana.

拟南芥染色质组装因子 1 突变体中同源重组和 T-DNA 整合增强。

DOI：
发表时间：
2006
期刊：
EMBO J. 25(23)
影响因子：
0
作者：
Endo;M.;Ishikawa;Y.;Kaya;H.;Araki;T.;Shibahara;K-i.;Ito;Y.;Osakabe;K.;Abe;K.;Ichikawa;H.;Valentine;L.;Hohn;B.;Toki;S.
通讯作者：
S.

Chromatin assembly factor-1 is required for rapid nucleosome formation during DNA replication and efficient Chkl activation in vertebrate chicken DT40 cells.

脊椎动物鸡 DT40 细胞中 DNA 复制过程中快速核小体形成和 Chk1 有效激活需要染色质组装因子 1。