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電子顕微鏡像の単粒子解析での構造分類と3次元再構成法の開発

电子显微镜图像单粒子分析中结构分类和三维重建方法的发展

基本信息

批准号：
17053021
负责人：
安永卓生
金额：
$ 1.86万
依托单位：
Kyushu Institute of Technology
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
财政年份：
2005
资助国家：
日本
起止时间：
2005 至无数据
项目状态：
已结题

项目摘要

安永は、電子顕微鏡像の単粒子解析方法の開発を進めた。まず、電子顕微鏡像の自動抽出のために、SVM(support Vector machine)を用いた新規のアルゴリズムを開発し、Wseas Trans.Biol.Biomed.に報告した。さらに、電子顕微鏡像のデフォーカスによる像の歪みを高速に補正するためのプログラムを開発した。次に、単粒子解析三次元再構成法のための新規の角度決定法として特徴量抽出法をもちいた角度決定法を開発し、この手法は従来の共相関法に比べ雑音に強いということがわかった。傾斜シリーズを用いた三次元再構成法に関して、迅速かつ高精度の解析システムを構築し、インテグリンに適用し、有効であることを示した。構造分類に関しては、主成分分析とクラスター解析を組み合わせた手法を開発してきた。ミオシンII/VI/IX,ダイニンなどの分子モーターに開発した手法を適用し、現在、三次元像を確度の高いものとしているところである。さらに、筋肉の細いフィラメント内部のトロポニンIのC末端サブドメインの位置を電子顕微鏡法で同定し、NMR観察の情報を統合化することにより、J.Mol.Biol.に報告した。また、鞭毛内部での軸糸内椀ダイニンcの配置をクラスター分類、精密化による画像処理法を用いて同定し、J.Biol.Chem.に報告した。電子顕微鏡法により得られた三次元構造の原子モデリングのための新しいアルゴリズムを開発し、J.Plasma.Phys.に印刷中である。

Development of a method for analyzing particles in electron micromirrors Automatic extraction of electronic micro-images, SVM(support Vector machine), Wseas Trans.Biol.Biomed. In addition, the electronic micro-mirror image is corrected at high speed. The angle determination method of three-dimensional reconstruction method of secondary particle analysis is developed by the angle determination method of feature extraction method, and the method of co-correlation is developed by the method of comparison. The three-dimensional reconstruction method is used to quickly construct high-precision analytical systems. Structural classification, principal component analysis, and analysis methods II/VI/IX, the first three dimensional images are accurate and accurate. J. Mol.Biol. Report on the identification of the position of the C-terminal segment of the muscle by electron microscopy and the integration of NMR information J. Biol.Chem., Inc., Inc. Electronic micro-mirror method to obtain three-dimensional structure of the atom, the new development, J. Plasma.Phys.

项目成果

期刊论文数量（4）

专著数量（0）

科研奖励数量（0）

会议论文数量（0）

专利数量（0）

Automatic Detecting Particles Approach Using Adaboost-SVM

使用 Adaboost-SVM 的自动检测粒子方法

DOI：
发表时间：
2005
期刊：
Wseas Transactinns on Biology and Biomedicine 2
影响因子：
0
作者：
Yang;J.
通讯作者：
J.

Atomic model construction of protein complexes from electron micrographs and visualization of their 3D structure using VR system

利用电子显微照片构建蛋白质复合物的原子模型，并使用 VR 系统对其 3D 结构进行可视化

DOI：
发表时间：
期刊：
J.Plasma Physics In press
影响因子：
0
作者：
Noda;K.
通讯作者：
K.

Structural basis for Ca2+-regulated muscle relaxation at interaction sites of troponin with actin and tropomyosin

DOI：
10.1016/j.jmb.2005.06.067
发表时间：
2005-09-09
期刊：
JOURNAL OF MOLECULAR BIOLOGY
影响因子：
5.6
作者：
Murakami, K;Yumoto, F;Wakabayashi, T
通讯作者：
Wakabayashi, T

An axonemal dynein particularly important for flagellar movement at high viscosity. Implications from a new Chlamydomonas mutant deficient in the dynein heavy chain gene DHC9

一种轴丝动力蛋白，对于高粘度下的鞭毛运动特别重要。

DOI：
发表时间：
2005
期刊：
J. Biol. Chem. 280
影响因子：
0
作者：
Naoko Imamoto;Maiko Furuta;Makiko Koike;Shingo Kose;Takashi Ikeda;Yuji Kamikubo;Toshiki Yagi
通讯作者：
Toshiki Yagi