Development of Intramolecular Polarization Determination Method Using Electron Scattering and Quantum Chemical Calculations
Development of Intramolecular Polarization Determination Method Using Electron Scattering and Quantum Chemical Calculations
批准号:
22K19296
负责人:
安永 卓生
金额:
$4.16万
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)
财政年份:
2022
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2022-06-30 至 2024-03-31
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英文摘要
結晶構造解析の手法として、X線結晶構造解析が広く用いられてきた。電子線結晶構造解析は,これまで試料損傷、傾斜角の制限、ドリフトなどの問題からあまり用いられて来なかった。近年、micrcoEDという低電子線量で行う、試料損傷を押さえて、小さい結晶から構造解析する手法が注目されている。microEDなどの電子線回折を用いた結晶構造解析では、一般的に、構造精密化を行う際にX線結晶構造解析に用いるプログラムを流用している場合が多い。しかし、X線回折では光子が試料の電子雲と相互作用することから、解析の結果として電子密度が得られるのに対して、電子線回折では、照射電子は試料の原子核や電子の分布由来のクーロン力と相互作用し、回折からは静電ポテンシャルが得られることになる。このとき、静電ポテンシャルは試料の電子状態をより反映してくるため、X線では考慮されない電子状態を考慮した構造精密化が可能である。本研究では、アセトアミノフェンをテスト試料として、microED・電子線回折法において、量子化学計算を用いて電子状態を考慮した構造精密化手法を提案し、電子状態の解明を目的とした。ここまでの研究成果として、電子密度及び静電ポテンシャルから,R因子をもとに比較することで、電子回折を利用した構造解析では、電子状態をより反映する静電ポテンシャルで行われるべきであることを示唆した。さらに、X線用アルゴリズムで精密化したモデルを初期モデルとして、水素分子の位置や強度補正などのモデル更新を行い、R因子から、構造信頼性が向上が示された。また、精密化構造から対象分子が持つ電子状態が示すことに成功している。本研究は、電子回折を用いた構造解析の精密化において、量子化学の情報を加え、信頼性の高い構造を計算する手法であり、物質の構造及び反応性をより詳細に提供し、生化学研究や創薬分野に対して貢献できる。
期刊论文(1)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
Structural refinement considering the electron orbitals in structural analysis using electron diffraction
使用电子衍射进行结构分析时考虑电子轨道的结构细化
DOI:
--
发表时间:
2022
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Honda, Y., Takahira, K., and Yasunaga, T.]
通讯作者:
T.
電子顕微鏡像の単粒子解析での構造分類と3次元再構成法の開発
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批准号:17053021
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.86万
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财政年份:2005
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负责人:安永 卓生
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依托单位:
計算機顕微鏡を指向した電子顕微鏡像・分子動力学法統合による原子モデルの構築
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批准号:15650052
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项目类别:Grant-in-Aid for Exploratory Research
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资助金额:$2.11万
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财政年份:2003
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负责人:安永 卓生
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依托单位:
クライオ電子顕微鏡を用いてアクチン構造変化の協同性の起源を探る
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批准号:13780525
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项目类别:Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
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资助金额:$1.41万
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财政年份:2001
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负责人:安永 卓生
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依托单位:
クライオ電子顕微鏡でみたミオシン分子モーターの構造変化と揺らぎ情報の検出
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批准号:09279212
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.47万
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财政年份:1997
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负责人:安永 卓生
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依托单位:
クライオ電子顕微鏡法・一分子可視化法を用いたミオシンモーターの三次元構造解明
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批准号:09780596
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$1.09万
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财政年份:1997
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负责人:安永 卓生
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依托单位:
クライオ電子顕微鏡法によるアクチンフィラメントの動的構造変化の追求
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批准号:06780526
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.7万
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财政年份:1994
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负责人:安永 卓生
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依托单位:
海外基金