Development of Intramolecular Polarization Determination Method Using Electron Scattering and Quantum Chemical Calculations

利用电子散射和量子化学计算开发分子内极化测定方法

基本信息

  • 批准号:
    22K19296
  • 负责人:
  • 金额:
    $ 4.16万
  • 依托单位:
  • 依托单位国家:
    日本
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)
  • 财政年份:
    2022
  • 资助国家:
    日本
  • 起止时间:
    2022-06-30 至 2024-03-31
  • 项目状态:
    已结题

项目摘要

結晶構造解析の手法として、X線結晶構造解析が広く用いられてきた。電子線結晶構造解析は,これまで試料損傷、傾斜角の制限、ドリフトなどの問題からあまり用いられて来なかった。近年、micrcoEDという低電子線量で行う、試料損傷を押さえて、小さい結晶から構造解析する手法が注目されている。microEDなどの電子線回折を用いた結晶構造解析では、一般的に、構造精密化を行う際にX線結晶構造解析に用いるプログラムを流用している場合が多い。しかし、X線回折では光子が試料の電子雲と相互作用することから、解析の結果として電子密度が得られるのに対して、電子線回折では、照射電子は試料の原子核や電子の分布由来のクーロン力と相互作用し、回折からは静電ポテンシャルが得られることになる。このとき、静電ポテンシャルは試料の電子状態をより反映してくるため、X線では考慮されない電子状態を考慮した構造精密化が可能である。本研究では、アセトアミノフェンをテスト試料として、microED・電子線回折法において、量子化学計算を用いて電子状態を考慮した構造精密化手法を提案し、電子状態の解明を目的とした。ここまでの研究成果として、電子密度及び静電ポテンシャルから,R因子をもとに比較することで、電子回折を利用した構造解析では、電子状態をより反映する静電ポテンシャルで行われるべきであることを示唆した。さらに、X線用アルゴリズムで精密化したモデルを初期モデルとして、水素分子の位置や強度補正などのモデル更新を行い、R因子から、構造信頼性が向上が示された。また、精密化構造から対象分子が持つ電子状態が示すことに成功している。本研究は、電子回折を用いた構造解析の精密化において、量子化学の情報を加え、信頼性の高い構造を計算する手法であり、物質の構造及び反応性をより詳細に提供し、生化学研究や創薬分野に対して貢献できる。
The method of crystal structure analysis and X-ray crystal structure analysis are widely used. Electron line crystal structure analysis, such as sample damage, tilt angle limit, and other problems. In recent years, micrcoED and low electron flux, sample damage, and structural analysis methods have attracted attention. MicroED is used for electron beam reflection, crystal structure analysis, general structure analysis, structure refinement, X-ray crystal structure analysis, etc. X-ray reflection results in electron cloud interaction between photons and sample, electron density and electron density, electron ray reflection, electron interaction between irradiated electrons and sample nuclei, electron distribution and electrostatic interaction. The electronic state of the sample is reflected in the electrostatic field, and the electronic state of the sample is considered in the X-ray field. In this study, the electron state of quantum chemistry calculation was considered, and the electron state of quantum chemistry calculation was proposed. The results of this research are as follows: electron density and electrostatic properties, R factor, electron reflection, structure analysis, electron state reflection, electrostatic properties, etc. In addition, the X-ray application is refined, the initial phase is refined, the position and intensity of water molecules are corrected, the phase is updated, the R factor is changed, and the structural reliability is displayed upward. The precision structure of the molecule is shown in the electronic state. This study provides detailed contributions to the refinement of structural analysis for electron reflection, the enhancement of information in quantum chemistry, the calculation of high structural reliability, the structure and reflectivity of substances, and the innovation of biochemical research.

项目成果

期刊论文数量(1)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Structural refinement considering the electron orbitals in structural analysis using electron diffraction
使用电子衍射进行结构分析时考虑电子轨道的结构细化
  • DOI:
  • 发表时间:
    2022
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Honda;Y.;Takahira;K.;and Yasunaga;T.
  • 通讯作者:
    T.
{{ item.title }}
{{ item.translation_title }}
  • DOI:
    {{ item.doi }}
  • 发表时间:
    {{ item.publish_year }}
  • 期刊:
  • 影响因子:
    {{ item.factor }}
  • 作者:
    {{ item.authors }}
  • 通讯作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ monograph.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ sciAawards.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ conferencePapers.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ patent.updateTime }}

安永 卓生其他文献

タンパク質の可視花技術の最前線
最前沿的蛋白可见花技术
  • DOI:
  • 发表时间:
    2007
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Moustafa;MA.;Ogino;D.;Nishimura;M.;Ueda;N.;Naito;S.;Furukawa;M.;Uchida;T.;Ikai;I.;Sawada;H.;Fukumoto;M;安永 卓生
  • 通讯作者:
    安永 卓生
心筋サルコメアにおけるFhod3とMyBP-Cの同定
心脏肌节中 Fhod3 和 MyBP-C 的鉴定
  • DOI:
  • 发表时间:
    2020
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    祁答院 渉;瀧岩 里穂;下城 奈央;武谷 立;安永 卓生
  • 通讯作者:
    安永 卓生
カリウムチャネルKcsAの開閉時の構造変化
钾通道 KcsA 打开和关闭过程中的结构变化
  • DOI:
  • 发表时间:
    2021
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    高崎 寛子;清水 啓史;安永 卓生
  • 通讯作者:
    安永 卓生
Volume conjecture for the logarithmic invariant
对数不变量的体积猜想
  • DOI:
  • 发表时间:
    2018
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    高崎 寛子;清水 啓史;安永 卓生;Jun Murakami
  • 通讯作者:
    Jun Murakami
カリウムチャネルKcsAの開閉にともなう構造変化
与钾通道 KcsA 的打开和关闭相关的结构变化
  • DOI:
  • 发表时间:
    2021
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    髙﨑 寛子;清水 啓史;安永 卓生
  • 通讯作者:
    安永 卓生

安永 卓生的其他文献

{{ item.title }}
{{ item.translation_title }}
  • DOI:
    {{ item.doi }}
  • 发表时间:
    {{ item.publish_year }}
  • 期刊:
  • 影响因子:
    {{ item.factor }}
  • 作者:
    {{ item.authors }}
  • 通讯作者:
    {{ item.author }}

{{ truncateString('安永 卓生', 18)}}的其他基金

電子顕微鏡像の単粒子解析での構造分類と3次元再構成法の開発
电子显微镜图像单粒子分析中结构分类和三维重建方法的发展
  • 批准号:
    17053021
  • 财政年份:
    2005
  • 资助金额:
    $ 4.16万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
計算機顕微鏡を指向した電子顕微鏡像・分子動力学法統合による原子モデルの構築
通过集成电子显微镜图像和计算机显微镜分子动力学方法构建原子模型
  • 批准号:
    15650052
  • 财政年份:
    2003
  • 资助金额:
    $ 4.16万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Exploratory Research
クライオ電子顕微鏡を用いてアクチン構造変化の協同性の起源を探る
使用冷冻电子显微镜探索肌动蛋白结构变化协同性的起源
  • 批准号:
    13780525
  • 财政年份:
    2001
  • 资助金额:
    $ 4.16万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
クライオ電子顕微鏡でみたミオシン分子モーターの構造変化と揺らぎ情報の検出
冷冻电镜检测肌球蛋白分子运动的结构变化和波动信息
  • 批准号:
    09279212
  • 财政年份:
    1997
  • 资助金额:
    $ 4.16万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
クライオ電子顕微鏡法・一分子可視化法を用いたミオシンモーターの三次元構造解明
使用冷冻电子显微镜和单分子可视化阐明肌球蛋白运动的三维结构
  • 批准号:
    09780596
  • 财政年份:
    1997
  • 资助金额:
    $ 4.16万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
クライオ電子顕微鏡法によるアクチンフィラメントの動的構造変化の追求
使用冷冻电子显微镜追踪肌动蛋白丝的动态结构变化
  • 批准号:
    06780526
  • 财政年份:
    1994
  • 资助金额:
    $ 4.16万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)

相似海外基金

電子線回折を使ったHRMDシミュレーション による炭素材料の表面構造解析
利用电子衍射进行 HRMD 模拟对碳材料的表面结构进行分析
  • 批准号:
    24H02576
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    $ 4.16万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Encouragement of Scientists
THz波ポンプ電子線回折プローブ実験系の開発と物質の強電場誘起現象の開拓的研究
太赫兹波泵浦电子衍射探针实验系统研制及材料强电场诱发现象的开创性研究
  • 批准号:
    23K25798
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    $ 4.16万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
時間分解共鳴軟X線散乱およびパルス電子線回折による反強磁性スピンダイナミクス研究
使用时间分辨共振软 X 射线散射和脉冲电子衍射进行反铁磁自旋动力学研究
  • 批准号:
    21K03461
  • 财政年份:
    2021
  • 资助金额:
    $ 4.16万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
光電子分光および時間分解電子線回折による鉄系超伝導体の研究
利用光电子能谱和时间分辨电子衍射研究铁基超导体
  • 批准号:
    14J10674
  • 财政年份:
    2014
  • 资助金额:
    $ 4.16万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for JSPS Fellows
角度分解光電子分光及び時間分解電子線回折による高温超伝導体の研究
利用角分辨光电子能谱和时间分辨电子衍射研究高温超导体
  • 批准号:
    12J08331
  • 财政年份:
    2012
  • 资助金额:
    $ 4.16万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for JSPS Fellows
反射型高速電子線回折法による動的表面構造変化のその場観察
利用反射型高速电子衍射原位观察动态表面结构变化
  • 批准号:
    01J04098
  • 财政年份:
    2001
  • 资助金额:
    $ 4.16万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for JSPS Fellows
楔形単結晶の電子線回折強度精密測定による電子非弾性散乱過程の定量的解析
精确测量楔形单晶电子衍射强度定量分析非弹性电子散射过程
  • 批准号:
    12740234
  • 财政年份:
    2000
  • 资助金额:
    $ 4.16万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
収束電子線回折法による鉱物内部組織の局所解析
使用会聚电子衍射法对矿物内部结构进行局部分析
  • 批准号:
    06740412
  • 财政年份:
    1994
  • 资助金额:
    $ 4.16万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
走査トンネル顕微鏡/反射高速電子線回折複合評価装置によるエピタキシ成長過程の研究
利用扫描隧道显微镜/反射式高速电子衍射复合评价装置研究外延生长工艺
  • 批准号:
    04227223
  • 财政年份:
    1992
  • 资助金额:
    $ 4.16万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
P.denitrificansチトクロム酸化酵素の2次元結晶化及び電子線回折実験
脱氮假单胞菌细胞色素氧化酶的二维结晶和电子衍射实验
  • 批准号:
    04780184
  • 财政年份:
    1992
  • 资助金额:
    $ 4.16万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
{{ showInfoDetail.title }}

作者:{{ showInfoDetail.author }}

知道了