分化した集団間の比較ゲノム機能解析によるショウジョウバエ種多様化メカニズムの解明

通过差异种群之间的比较基因组功能分析阐明果蝇物种多样化机制

基本信息

  • 批准号:
    18017024
  • 负责人:
  • 金额:
    $ 4.16万
  • 依托单位:
  • 依托单位国家:
    日本
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
  • 财政年份:
    2006
  • 资助国家:
    日本
  • 起止时间:
    2006 至 2007
  • 项目状态:
    已结题

项目摘要

本研究では、分化の進んだ西アフリカ産のMEL6系統と台湾産のTW1系統についてゲノムがどのように変化しているかを探ることで、種が多様化していくメカニズムを解明することが大きな目的である。また、これら分化の進んだ二つの系統の特徴的な表現型の違いを体系的にゲノム上の違いとしてマッピングしていくため、複数形質のマッピングに用いることができる多数の組み換え体パネルを準備し、ゲノムレベルでの遺伝子マッピングを行うことにより原因遺伝子を特定することを目標として行った。本研究では特徴的な形質の1つである胸部クチクラのpigmentationパターンについて上記マッピングにより原因遺伝子ebonyを特定することができた。また、西表集団を利用した種内のゲノム比較により、原因サイトを遺伝子上流領域の一部(約150bp)にしぼることができた。この形質は、交尾相手選好性にも関与しているため、表皮細胞及び神経系の両方で多面発現が見られる遺伝子が原因遺伝子として同定されたことは、種分化のポテンシャルを考える上で大変インパクトのある成果であった。また、雄の交尾相手選好性については、ビデオ撮影装置による行動観察方法を確立したことにより肉眼での観察ではわからなかった交尾前0.5秒以内の雌雄の距離に違いがあることがわかった。このような詳細な交尾行動の変異が報告されたことがなく今後の展開が期待される成果であった。この表現型の違いについても上記組み換え体を用いたマッピングを進め、第3染色体の右腕先端部にこの形質を制御する領域があることがわかった。このように、本研究の成果により、分化した集団を用いた上記の機能ゲノム的アプローチが、種多様化メカニズムの解析に対し有効な方法であることを示すことができた。
This study で の は, differentiation into ん だ west ア フ リ カ production の MEL6 system と Taiwan の TW1 system に つ い て ゲ ノ ム が ど の よ う に variations change し て い る か を agent る こ と で, kind of が others more し て い く メ カ ニ ズ ム を interpret す る こ と が big き な purpose で あ る. ま た, こ れ の ら differentiation into ん だ two つ の system の な phenotype of 徴 の violations い を system に ゲ ノ ム の violations on い と し て マ ッ ピ ン グ し て い く た め, plural form quality の マ ッ ピ ン グ に with い る こ と が で き る most み の group in え body パ ネ ル を し, ゲ ノ ム レ ベ ル で の heritage 伝 son マ ッ ピ ン グ を line う こ と に よ り reason 伝 son Youdaoplaceholder0 specific する と とを とを target と て て line った. This study で は of 徴 な character の 1 つ で あ る chest ク チ ク ラ の pigmentation パ タ ー ン に つ い て written マ ッ ピ ン グ に よ り reason but 伝 child ebony を specific す る こ と が で き た. ま た, west table set 団 を using し た intraspecific の ゲ ノ ム compare に よ り, cause サ イ ト を posthumous son 伝 の a high field (about 150 bp) に し ぼ る こ と が で き た. こ の character は, copulation phase picking a temper に も masato and し て い る た め, epidermal cells and び god 経 の struck party で polyhedral 発 が now see ら れ る heritage 伝 child が reason but 伝 と し て with fixed さ れ た こ と は, differentiation of の ポ テ ン シ ャ ル を exam え る で large variations イ ン パ ク ト の あ る results で あ っ た. ま た, male の copulation phase picking a temper に つ い て は, ビ デ オ pinch of shadow device に よ る action を 観 examine method established し た こ と に よ り macroscopic で の 観 examine で は わ か ら な か っ た の within 0.5 seconds before mating male and female の distance に violations い が あ る こ と が わ か っ た. <s:1> ような detailed な handover action <e:1> change が report された <s:1> とがなく とがなく Future development が looking forward to される results であった. こ の phenotype の violations い に つ い て も み written group in を え body with い た マ ッ ピ ン グ を め, chromosome 3 の right wrist apex of に こ の character を suppression す る field が あ る こ と が わ か っ た. の こ の よ う に, this research に よ り, differentiation し た set 団 を with い た written の function ゲ ノ ム of ア プ ロ ー チ が, kind of many others in メ カ ニ ズ ム の parsing に し polices have sharper な method で あ る こ と を shown す こ と が で き た.

项目成果

期刊论文数量(4)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
The role of a pigmentation gene and mating preference in Drosophila speciation
色素沉着基因和交配偏好在果蝇物种形成中的作用
  • DOI:
  • 发表时间:
    2008
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Takahashi;A.
  • 通讯作者:
    A.
Natural variation of ebony gene controlling thoracic pigmentation in Drosophila melanogaster
  • DOI:
    10.1534/genetics.107.075283
  • 发表时间:
    2007-10-01
  • 期刊:
  • 影响因子:
    3.3
  • 作者:
    Takahashi, Aya;Takahashi, Kuniaki;Takano-Shimizu, Toshiyuki
  • 通讯作者:
    Takano-Shimizu, Toshiyuki
Mosaic genealogy of the Mus musculus genome revealed by 21 nuclear genes from its three subspecies.
  • DOI:
    10.1266/ggs.83.77
  • 发表时间:
    2008-02
  • 期刊:
  • 影响因子:
    1.1
  • 作者:
    Yu-Hua Liu;Aya Takahashi;T. Kitano;Tsuyoshi Koide;T. Shiroishi;K. Moriwaki;N. Saitou
  • 通讯作者:
    Yu-Hua Liu;Aya Takahashi;T. Kitano;Tsuyoshi Koide;T. Shiroishi;K. Moriwaki;N. Saitou
キイロショウジョウバ工集団内における胸部三叉の色素沈着パターンの多型と非ランダム交配
果蝇种群内胸三叉色素沉着模式的多态性和非随机交配
  • DOI:
  • 发表时间:
    2007
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    高橋文;ら
  • 通讯作者:
{{ item.title }}
{{ item.translation_title }}
  • DOI:
    {{ item.doi }}
  • 发表时间:
    {{ item.publish_year }}
  • 期刊:
  • 影响因子:
    {{ item.factor }}
  • 作者:
    {{ item.authors }}
  • 通讯作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ monograph.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ sciAawards.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ conferencePapers.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ patent.updateTime }}

高橋 文其他文献

アンプリコンシークエンス解析による塩基配列多型データに基 づく針葉樹スギ(Cryptomeria japonica )の集団史の推定
基于扩增子序列分析的核苷酸序列多态性数据估计针叶树日本柳杉(Cryptomeria japonica)的种群历史
  • DOI:
  • 发表时间:
    2017
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    森口 夏季;内山 憲太郎;宮城 竜太郎;高橋 文;田村 浩一郎;津村 義彦;手島 康介;楠見 淳子;舘田 英典
  • 通讯作者:
    舘田 英典
キイロショウジョウバエにおける胸部三叉の色素沈着パターンの集団内多型に関する分子基盤
果蝇胸三叉神经色素沉着模式群体内多态性的分子基础
  • DOI:
  • 发表时间:
    2006
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Takahashi;K. H.;Tanaka;K.;Itoh;M.;Takano-Shimziu;T.;伊藤 雅信;高橋 文
  • 通讯作者:
    高橋 文
アンプリコンシークエンス解析による塩基配列多型データに基づく針葉樹スギ(Cryptomeria japonica)の集団構造の推定
使用扩增子序列分析基于核苷酸序列多态性数据估计针叶日本柳杉(Cryptomeria japonica)的种群结构
  • DOI:
  • 发表时间:
    2016
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    森口 夏季;内山 憲太郎;宮城 竜太郎;高橋 文;田村 浩一郎;津村 義彦;手島 康介;楠見 淳子;舘田 英典
  • 通讯作者:
    舘田 英典
Natural variants of a pigmentation-controlling gene that affects mate preference in Drosophila melanogaster
影响果蝇交配偏好的色素控制基因的自然变异
  • DOI:
  • 发表时间:
    2007
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Inomata;N.;Itoh;M.;Kondo;R.;Ohshima;M.;Inoue;Y.;Takano-Shimizu;T.;高野 敏行;高橋 文
  • 通讯作者:
    高橋 文

高橋 文的其他文献

{{ item.title }}
{{ item.translation_title }}
  • DOI:
    {{ item.doi }}
  • 发表时间:
    {{ item.publish_year }}
  • 期刊:
  • 影响因子:
    {{ item.factor }}
  • 作者:
    {{ item.authors }}
  • 通讯作者:
    {{ item.author }}

{{ truncateString('高橋 文', 18)}}的其他基金

雌雄形態の急速な共進化の背景にある遺伝的基盤の解析
雌雄形态快速协同进化的遗传基础分析
  • 批准号:
    23K27221
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    $ 4.16万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
Genetic basis of rapid coevolution of morphological traits between sexes
两性形态性状快速协同进化的遗传基础
  • 批准号:
    23H02530
  • 财政年份:
    2023
  • 资助金额:
    $ 4.16万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
類人猿ゲノム内のDNA多型解析
类人猿基因组内的DNA多态性分析
  • 批准号:
    01J60096
  • 财政年份:
    2001
  • 资助金额:
    $ 4.16万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for JSPS Fellows

相似海外基金

緩歩動物クマムシにおける求愛・交尾行動の初観測と性差をもたらす分子基盤の解明
首次观察缓步动物的求偶和交配行为并阐明性别差异的分子基础
  • 批准号:
    18J21345
  • 财政年份:
    2018
  • 资助金额:
    $ 4.16万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for JSPS Fellows
性的対立と宿主-寄生者間軍拡競争の相互作用:寄生者が宿主の交尾行動に与える影響
性冲突与宿主-寄生虫军备竞赛之间的相互作用:寄生虫对宿主交配行为的影响
  • 批准号:
    08J02329
  • 财政年份:
    2008
  • 资助金额:
    $ 4.16万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for JSPS Fellows
ガ類の性フェロモンと交尾行動における遺伝的多型とその進化
飞蛾性信息素和交配行为的遗传多态性及其进化
  • 批准号:
    00J09330
  • 财政年份:
    2000
  • 资助金额:
    $ 4.16万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for JSPS Fellows
シロスジフジツボとタテジマフジツボの混合個体群における両種の交尾行動の研究
白藤壶和垂直藤壶在两种物种混合种群中交配行为的研究
  • 批准号:
    08918025
  • 财政年份:
    1996
  • 资助金额:
    $ 4.16万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (B)
ナミアゲハ交尾器上の光受容系と交尾行動
燕尾交配器官的感光系统及其交配行为
  • 批准号:
    05740510
  • 财政年份:
    1993
  • 资助金额:
    $ 4.16万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
ナミアゲハの交尾行動における腹部末端光受容系の役割
腹侧末端感光系统在燕尾燕尾交配行为中的作用
  • 批准号:
    03740382
  • 财政年份:
    1991
  • 资助金额:
    $ 4.16万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
雄型交尾行動における中脳被蓋の役割に関する生理心理学的研究
中脑被盖在雄性交配行为中作用的生理和心理研究
  • 批准号:
    63710052
  • 财政年份:
    1988
  • 资助金额:
    $ 4.16万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
オス型交尾行動の学習性要因に関する行動生理学的研究
雄性交配行为习得因素的行为生理学研究
  • 批准号:
    62221020
  • 财政年份:
    1987
  • 资助金额:
    $ 4.16万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Special Project Research
蝶類の交尾器における光受容と交尾行動
蝴蝶交配器官的光感受和交配行为
  • 批准号:
    59740376
  • 财政年份:
    1984
  • 资助金额:
    $ 4.16万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
チョウの交尾器の光受容と交尾行動
蝴蝶交配器官的感光和交配行为
  • 批准号:
    56740274
  • 财政年份:
    1981
  • 资助金额:
    $ 4.16万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
{{ showInfoDetail.title }}

作者:{{ showInfoDetail.author }}

知道了