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クロマチン構造変換の及ぶ領域を調節し局限化する機構

调节和定位受染色质结构变化影响的区域的机制

基本信息

批准号：
18055032
负责人：
石井浩二郎
金额：
$ 5.06万
依托单位：
Kurume University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
财政年份：
2006
资助国家：
日本
起止时间：
2006 至 2007
项目状态：
已结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-18055032/
关键词：
クロマチン遺伝子染角体構造変換転写 RNAi 染色体構造変換

项目摘要

ヘテロクロマチン化は遺伝子転写に対して抑制的に働くクロマチン構造変換のひとつの典型であり、染色体形態を凝集型へと大きく変化させる。ヘテロクロマチン化反応は本質的に可逆的であるため、ヘテロクロマチン領域の成立にはクロマチン構造の確立と維持の二つの作用が必要とされる。一方ヘテロクロマチン領域は、ヌクレオソーム構造の共通性を分子基盤に近隣のクロマチン領域へと拡大していく潜在能力を持つ。分裂酵母ではそのようなヘテロクロマチン領域の形成もしくは拡大に細胞性のRNAi装置が必要なことが判明しており、拡散能力を備えたRNAi装置がヘテロクロマチン構造変換の及ぶ領域の局限化に機能していると考えられる。これまで、セントロメアヘテロクロマチン領域に由来するノンコーディングRNAがsiRNAに変換される過程の分子レベルでの解析を継続して行ってきた。本年度はそれら内在性のノンコーディングRNAに共通する配列要素SIREに結合するタンパク質因子の探索を行った。核抽出液を用いたゲルシフトアッセイによって、SIREや類似配列RNAに対するバンドシフトが得られ、分裂酵母のタンパク質精製をすすめることによって、その少なくとも一部は細胞性RNAi装置のエフェクター複合体であるRITSによって生み出されていることが判明した。SIRE類似RNAへの結合は、RITSの必須コンポーネントであるago1の変異株に加え、細胞内のsiRNA生成が不能なdcr1やrdp1など他のRNAi装置変異株から精製したRITSでは失われ、siRNAとの塩基配列依存的な結合を検出していると考えられる。その特異性に関する解析はさらに深められている。

The chromosome morphology is aggregated, and the chromosome structure is changed. It is necessary to establish and maintain the reversible nature of the domain. The commonality of structure, neighborhood, and potential of a single domain is maintained. It is necessary to identify and disperse the RNAi device in order to form a large cellular RNAi domain and limit the function of the domain. The analysis of the molecular structure of the siRNA gene sequence is carried out in the following ways: This year, we will explore the intrinsic factors of RNA synthesis, the common alignment elements of RNA synthesis, and the quality factors of RNA synthesis. A part of the cellular RNAi device complex was identified by using the nuclear extract as a vector for RNA synthesis, SIRE, and RNA like alignment. SIRE-like RNA binding, RITS binding, siRNA production, siRNA deletion, siRNA binding, siRNA binding The specificity of the analysis is very important.