Flexible dynamics and reactions in biomolecules
生物分子中的灵活动力学和反应
基本信息
- 批准号:18066005
- 负责人:
- 金额:$ 11.71万
- 依托单位:
- 依托单位国家:日本
- 项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
- 财政年份:2006
- 资助国家:日本
- 起止时间:2006 至 2009
- 项目状态:已结题
- 来源:
- 关键词:
项目摘要
Flexible dynamics of the large scale conformational change of proteins is essential in many biochemical reactions. In order to solve the principles of flexible dynamics and to bridge between quantum chemical understanding of reactions and the observed physiological phenomena, we studied the energy landscape models of protein conformation change. Also important is the flexible stochastic kinetics of reactions among biomolecules which are confined in a meso-scopic i.e. cellular size space. We studied the stochastic processes in such meso-scopic systems by developing models of biochemical reactions.
在许多生物化学反应中,大规模蛋白质构象变化的柔性动力学是必不可少的。为了解决柔性动力学原理,并在反应的量子化学理解和观察到的生理现象之间架起桥梁,我们研究了蛋白质构象变化的能量景观模型。同样重要的是灵活的随机动力学反应之间的生物分子是局限在一个介观,即细胞大小的空间。我们通过建立生化反应模型来研究这种介观系统中的随机过程。
项目成果
期刊论文数量(66)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Harnessing the thermal noise with molecular machines, International Symposium on Molecular Theory for Real Systems
利用分子机器利用热噪声,真实系统分子理论国际研讨会
- DOI:
- 发表时间:2010
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:K. Itoh;M. Sasai;M. Nakano;M. Sasai
- 通讯作者:M. Sasai
タンパク質のダイナミックな構造と機能に果たす水の役割
水在蛋白质动态结构和功能中的作用
- DOI:
- 发表时间:2008
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:Yurie Okabe;Hiroki Murakami;Masaki Sasai;中野雅由;Satoshi Takahashi and Kazuo Takatsuk;笹井理生
- 通讯作者:笹井理生
Stable, precise, and reproducible patterning of bicoid and hunchback molecules in the early Drosophila embryo.
- DOI:10.1371/journal.pcbi.1000486
- 发表时间:2009-08
- 期刊:
- 影响因子:4.3
- 作者:Okabe-Oho Y;Murakami H;Oho S;Sasai M
- 通讯作者:Sasai M
シャッフリングとアロステリック転移を用いたKaiC概日リズムのモデル化
使用改组和变构转变对 KaiC 昼夜节律进行建模
- DOI:
- 发表时间:2007
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:依田充正;江口浩平;寺田智樹;笹井理生
- 通讯作者:笹井理生
Monte Carlo simulation of transcriptional control in 6 kbp DNA
6 kbp DNA 转录控制的蒙特卡罗模拟
- DOI:
- 发表时间:2009
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:Naoko Tokuda;Masaki Sasai and George Chikenii
- 通讯作者:Masaki Sasai and George Chikenii
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$ 11.71万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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- 资助金额:
$ 11.71万 - 项目类别:
Discovery Grants Program - Individual
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- 批准号:
DP110102932 - 财政年份:2011
- 资助金额:
$ 11.71万 - 项目类别:
Discovery Projects
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- 批准号:
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- 资助金额:
$ 11.71万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research