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Flexible dynamics and reactions in biomolecules

Flexible dynamics and reactions in biomolecules
生物分子中的灵活动力学和反应
批准号：
18066005
负责人：
SASAI Masaki
金额：
$11.71万
依托单位：
Nagoya University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
财政年份：
2006
资助国家：
日本
项目状态：
已结题
起止时间：
2006 至 2009
来源：
https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-18066005/
关键词：
生物物理化学物理自己組織化生体分子蛋白質

项目摘要

项目成果

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Flexible dynamics of the large scale conformational change of proteins is essential in many biochemical reactions. In order to solve the principles of flexible dynamics and to bridge between quantum chemical understanding of reactions and the observed physiological phenomena, we studied the energy landscape models of protein conformation change. Also important is the flexible stochastic kinetics of reactions among biomolecules which are confined in a meso-scopic i.e. cellular size space. We studied the stochastic processes in such meso-scopic systems by developing models of biochemical reactions.
期刊论文(66)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
Harnessing the thermal noise with molecular machines, International Symposium on Molecular Theory for Real Systems
利用分子机器利用热噪声，真实系统分子理论国际研讨会
DOI： --
发表时间： 2010
期刊：
影响因子： --
作者： [K. Itoh, M. Sasai, M. Nakano, M. Sasai]
通讯作者： M. Sasai
タンパク質のダイナミックな構造と機能に果たす水の役割
水在蛋白质动态结构和功能中的作用
DOI： --
发表时间： 2008
期刊：
影响因子： --
作者： [Yurie Okabe, Hiroki Murakami, Masaki Sasai, 中野雅由, Satoshi Takahashi and Kazuo Takatsuk, 笹井理生]
通讯作者： 笹井理生
Stable, precise, and reproducible patterning of bicoid and hunchback molecules in the early Drosophila embryo.
DOI： 10.1371/journal.pcbi.1000486
发表时间： 2009-08
期刊： PLoS computational biology
影响因子： 4.3
作者： [Okabe-Oho Y, Murakami H, Oho S, Sasai M]
通讯作者： Sasai M
シャッフリングとアロステリック転移を用いたKaiC概日リズムのモデル化
使用改组和变构转变对 KaiC 昼夜节律进行建模
DOI： --
发表时间： 2007
期刊：
影响因子： --
作者： [依田充正, 江口浩平, 寺田智樹, 笹井理生]
通讯作者： 笹井理生
共 36 条
    Genome structural dynamics and transcription regulation
    • 批准号：
      26610130
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research
    • 资助金额：
      $2.33万
    • 财政年份：
      2014
    • 负责人：
      SASAI Masaki
    • 依托单位：
      Nagoya University
    Theories of fluctuation and regulation of eukaryotic gene switches
    • 批准号：
      24244068
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Scientific Research (A)
    • 资助金额：
      $24.54万
    • 财政年份：
      2012
    • 负责人：
      SASAI Masaki
    • 依托单位：
      Nagoya University
    Statistical physics of dynamical transitions in ES cells
    • 批准号：
      23654147
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research
    • 资助金额：
      $2.25万
    • 财政年份：
      2011
    • 负责人：
      SASAI Masaki
    • 依托单位：
      Nagoya University
    Functional Funnel of Molecular Motors
    • 批准号：
      20244068
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Scientific Research (A)
    • 资助金额：
      $28.12万
    • 财政年份：
      2008
    • 负责人：
      SASAI Masaki
    • 依托单位：
      Nagoya University
    国内基金
    海外基金
    含钾盐细水雾抑制氢气爆炸的化学-物理耦合机理及加氢站喷淋系统参数优化研究
    • 批准号：
    • 项目类别：
      省市级项目
    • 资助金额：
      --
    • 批准年份：
      2025
    • 负责人：
      游成旭
    • 依托单位：
      重庆安全技术职业学院
    盐冻-化学物理多场耦合效应下水工混凝土损伤演化机理及算法研究
    • 批准号：
      --
    • 项目类别：
      面上项目
    • 资助金额：
      54万元
    • 批准年份：
      2022
    • 负责人：
      覃源
    • 依托单位：
      西安理工大学
    反应性纺丝构筑高强水凝胶纤维及其“化学-物理”协同调控机制研究
    • 批准号：
      --
    • 项目类别：
      --
    • 资助金额：
      58万元
    • 批准年份：
      2021
    • 负责人：
      侯恺
    • 依托单位：
      东华大学
    反应性纺丝构筑高强水凝胶纤维及其“化学—物理”协同调控机制研究
    • 批准号：
      52173029
    • 项目类别：
      面上项目
    • 资助金额：
      58.00万元
    • 批准年份：
      2021
    • 负责人：
      侯恺
    • 依托单位：
      东华大学