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植物の多細胞体制進化の鍵となったゲノム進化の特定

植物多细胞系统进化关键基因组进化的鉴定

基本信息

批准号：
20017013
负责人：
西山智明
金额：
$ 5.38万
依托单位：
Kanazawa University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
财政年份：
2008
资助国家：
日本
起止时间：
2008 至 2009
项目状态：
已结题

项目摘要

ヒメミカヅキモ、シャジクモは、陸上植物に近縁な藻類であり、ヒメミカヅキモは生活環を通じて単細胞性であるが、シャジクモはn世代だけが多細胞体制を作る。n, 2n両世代で多細胞体制を作る陸上植物への進化を解明するため、この2種でEST解析を進めた。昨年度決定したヒメミカヅキモNIES-67&68株栄養増殖ステージに加え、A2 ヒメミカヅキモNIES-67株(接合型プラス)性分化誘導ステージ;A3 ヒメミカヅキモNIES-68株(接合型マイナス)性分化誘導ステージ;の完全長cDNAライブラリーを作製し各1万9200クローンについて両端からのESTシークエンスを行った。これにより合計116, 694配列のESTが得られた。この配列を以前から得られていたESTとともにアセンブルし10 620個のcontigを得た。シャジクモについては、B2 シャジクモ生殖器官形成直前ステージ;B3 シャジクモ受精直前ステージの完全長cDNAライブラリーを作製し合計73, 388配列のESTが得られた。また、ヒメツリガネゴケの受精卵の第一分裂に必要なPpLFY転写因子は陸上植物の2倍体の多細胞体制獲得に関与しているかもしれないのでその相同遺伝子をシャジクモから単離した。さらにヒメミカヅキモの形質転換の条件を検討し、安定な株を単離できるようにし、ESTから得られた候補遺伝子の機能解析を進めている。これらの結果は、今後、さらに新型シーケンサーを用いたdeepシーケンシング、ゲノム配列の決定を行い、多細胞体制獲得の鍵が何であったかを解明する基盤となる。

There are many diseases in the plant, such as the algae, the living environment, the cellular cycle, and the multi-cell system for generations. N, 2n generations of polycytic systems are used for plant evolution and EST analysis. It was decided last year that the sexual differentiation of NIES-67&68 strain (conjugate type) and A3 strain (conjugate type) led the sexual differentiation of NIES-67 strain and A3 strain. The full-length cDNA will cost 19,200 yuan each, and the end of the EST will run the same number of lines. A total of 116,694 was assigned to EST in total. In the previous column, there were 10 620 contig entries in the EST database. The reproductive organs were formed directly before the formation of reproductive organs, and the complete growth of cDNA was obtained before fertilization in B3. A total of 73,388 was matched with EST. The first division of the fertilized egg is the necessary PpLFY writing factor. The diploid polycytic system of the plant is the same as that of the plant. It is necessary to determine whether or not the health conditions are correct, that the stable strain is isolated from the health care unit, and that the host computer is capable of parsing and making progress. According to the results of the experiment, in the future, the new type of equipment will be used to determine the performance of the system, and the multi-cell system will be used to understand the basic information.