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ヒト高次脳機能関連遺伝子群の分子進化学的解析

ヒト高次脳機能関連遺伝子群の分子進化学的解析
人类高级脑功能相关基因的分子进化分析
批准号:
20017021
负责人:
柴田 弘紀
金额:
$2.94万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
财政年份:
2008
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2008 至 2010

项目摘要

项目成果

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統合失調症感受性遺伝子変異の平衡選択の可能性を検討するため、代謝調節型グルタミン酸受容体遺伝子群を含む統合失調症関連遺伝子群、計12個の上流領域を対象として、ヒト72検体、チンパンジー24検体の全変異検出を行い頻度スペクトラム法(Tajima's D(以下TD))による中立性の検定を行った。1) 代謝調節型グルタミン酸受容体遺伝子全8個のうちパラログが存在するためにPCRによる解析の不可能なGRM5を除く7遺伝子の解析の結果、領域全体の解析では、ヨーロッパ人においてGRM1が有意な正のTDを示し(+2.66)、平衡選択が示唆された。同様にウィンドウ解析(ウィンドウサイズ100bp、ステップ20bp)では、GRM1転写開始点の上流3.7kb付近において日本人とヨーロッパ人でTDの有意な上昇(それぞれ+2.25, +2.17)が見出された。いずれの領域もチンパンジーでは有意な自然選択は検出されず、これらの領域はヒト特異的平衡選択の対象となった可能性が示唆された。2) 統合失調症との関連が報告されている遺伝子のうち、BDNF、COMT、DRD1、DRD2、SLC18A1の5個について、有意な関連が報告されたSNPの周辺領域各7kbおよび上流領域5kbを対象に1)と同様の全変異検出を行った。その結果COMTの非同義SNP、rs4680 (Val158Met)周辺領域において、ヨーロッパ人で有意な正のTDが観察され(+2.10)、日本人集団とアフリカ系アメリカ人集団においても有意ではないものの同様の傾向(それぞれ+1.46, +1.75)が見られた。しかし、チンパンジーにおいては同様の傾向は全く観察されなかった。以上のことから、rs4680のアミノ酸多型はヒト特異的な平衡選択で維持されており、統合失調症に関連する表現型が、そのターゲットになった可能性が示唆された。
期刊论文(30)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
Association study of polymorphisms in the neutral amino acid transporter genes SLC1A4, SLC1A5 and the glycine transporter genes SLC6A5, SLC6A9 with schizophrenia.
中性氨基酸转运蛋白基因SLC1A4,SLC1A5和甘氨酸转运蛋白基因SLC6A5,SLC6A9,具有精神分裂症的结合研究。
DOI: 10.1186/1471-244x-8-58
发表时间: 2008-07-18
期刊: BMC psychiatry
影响因子: 4.4
作者: [Deng X, Sagata N, Takeuchi N, Tanaka M, Ninomiya H, Iwata N, Ozaki N, Shibata H, Fukumaki Y]
通讯作者: Fukumaki Y
統合失調症のSTRマーカーによるゲノムワイド関連解析
使用 STR 标记对精神分裂症进行全基因组关联分析
DOI: --
发表时间: 2009
期刊:
影响因子: --
作者: [服巻保幸, 山本健, 孫竹, 岡晃, 猪子英俊, 有波忠雄, 岩田仲生, 尾崎紀夫, 柴田弘紀]
通讯作者: 柴田弘紀
Molecular evolutionary study of the ionotropic glutamate-receptor gene family as schizophrenia susceptibility genes: human-specific balancing selection in the GRIN2B upstream region.
离子型谷氨酸受体基因家族作为精神分裂症易感基因的分子进化研究:GRIN2B上游区域的人类特异性平衡选择。
DOI: --
发表时间: 2009
期刊:
影响因子: --
作者: [Shibata, H., Watanabe, K., Tanaka, K., Goto, H., Mano, S., Takenaka, O., Fukumaki, Y.]
通讯作者: Y.
マイクロサテライトマーカーを用いた統合失調症のゲノムワイド関連解析
使用微卫星标记进行精神分裂症的全基因组关联分析
DOI: --
发表时间: 2010
期刊:
影响因子: --
作者: [服巻保幸, 山本健, 岡晃, 猪子英俊, 有波忠雄, 岩田仲生, 尾崎紀夫, 柴田弘紀]
通讯作者: 柴田弘紀
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    統合失調症関連遺伝子群を突破口とした"humanness"の起源の解明
    • 批准号:
      18017020
    • 项目类别:
      Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
    • 资助金额:
      $5.5万
    • 财政年份:
      2006
    • 负责人:
      柴田 弘紀
    • 依托单位:
    グルタミン酸受容体遺伝子群のヒト上科における多様性と"humanness"の起源
    • 批准号:
      17018027
    • 项目类别:
      Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
    • 资助金额:
      $3.84万
    • 财政年份:
      2005
    • 负责人:
      柴田 弘紀
    • 依托单位:
    精神分裂病感受性遺伝子としてのグルタミン酸受容体遺伝子群の包括的研究
    • 批准号:
      14704056
    • 项目类别:
      Grant-in-Aid for Young Scientists (A)
    • 资助金额:
      $18.8万
    • 财政年份:
      2002
    • 负责人:
      柴田 弘紀
    • 依托单位:
    海外基金