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青枯病菌の宿主域を決定する因子をゲノムの比較により解き明かす

通过比较基因组阐明决定青枯病宿主范围的因素

基本信息

批准号：
20017020
负责人：
大西浩平
金额：
$ 3.84万
依托单位：
Kochi University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
财政年份：
2008
资助国家：
日本
起止时间：
2008 至 2009
项目状态：
已结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-20017020/
关键词：
ゲノム微生物病理学遺伝子

项目摘要

1. タバコに病気を起こして枯らせてしまうOE1-1株とタバコにHRを誘発する株として8266株のドラフトゲノム解析を行った。GMI1000株(タバコに非病原性)に対してBLAST解析を行い、遺伝子配置について調べた。2. GMI1000株で74個あると予想されているエフェクター遺伝子について、ドラフト解析を元にOE1-1株、8266株の両方から抽出を行った。その結果14個のエフェクター遺伝子において、3株間で何らかの違いがみられた。こうしたエフェクターは、病原細菌の分離された地理的な状況を反映している可能性やタバコに対する病原性を支配している可能性がある。また、日本株にのみ見られるエフェクター遺伝子がひとつ存在した。3. 2で抽出された候補遺伝子のうち、2つの遺伝子RSp0914、RSc1356はLRR-GALA family type III effector proteinに分類される。青枯病菌において7種類のLRR-GALA family type III effector Droteinが知られており、すべてを欠損させた変異株は宿主植物に対する病原性が弱まることが報告されている。そこでまず、これらの7種類のLRR-GALA family type III effector protein遺伝子についてOE1-1株と8266株の間での入れ替え実験を行うこととした。そのために、OE1-1株において5それぞれの遺伝子の欠失変異株を作製し、そこにOE1-1株もしくは8266株の対応する遺伝子を染色体上の特定の位置に挿入した株を作製し、タバコに対する病原性を調べるという手法をとった。そのために、まず、それぞれの遣伝子の欠失変異株を作製し、その病原性を調べた。GMI1000株で見られたように、ほとんどすべての1gala遺伝子欠損株は野生株OE1-1株と同等の病原性を示した。今後は、いずれか1種類のgala遺伝子だけが発現する変異株およびすべてのgala遺伝子欠損株を構築し、それら変異株の病原性について明らかにする。4. gala3欠損株はタバコに対して野生株と同等の病原性を示す。エフェクターの入れ替え実験として、この欠損株に8266株のgala3遺伝子を図5の手法を用いて導入した。タバコ葉に接種したところ、OE1-1野生株と同様に病原性を示し、HRは示さなかった。gala3遺伝子は、OE1-1株と8266株の間でよく保存されていることからタバコに対するHR要因とはならないとの予想とよく一致している。

1.とタバコにH Rをinduced 発する strain として8266 strain のドラフトゲノムanalytic を行った. GMI1000 strain (タバコに non-pathogenic) BLAST analysis を row い, 缝子configuration について Adjustment べた. 2. GMI1000 strain 74 piecesて, ドラフトanalyzed を元にOE1-1 strain, 8266 strain の両square から extracted を行った. As a result, there are 14 のエフェクター伝子において, and 3 plants between the trees. Reflection of the isolation of pathogenic bacteria and geographical conditionsしている possibility やタバコに対するpathogenic を dominated している possibility がある.また、Japanese strain にのみ见られるエフェクター缝子がひとつexistent した. 3. 2 extracted された candidate addendum 伝子のうち, 2 つの伝子 RSp0914, RSc1356 and はLRR-GALA family type III effector protein に classification される. Ralstonia solanacearum LRR-GALA family type III effector Drotein がknow られており, すべてをawning させた変different strains はhost plant に対するpathogenic がweak まることがreport されている.そこでまず、これらの7 kinds of LRR-GALA family type III effector Protein is left in the OE1-1 strain and the 8266 strain is in the room.そのために, OE1-1 strain において5 それぞれの缝子のowed loss of different strains をmaking し, OE1-1 strain もしくは8266 strainの対応する伝子をinsertion into a specific position on the chromosome した strain を production し, タバコに対するpathogenic をadjusted べるというtechnique をとった.そのために, まず, それぞれの缝子のowed 変different strains をmaking し, そのpathogenic をadjusted べた. The GMI1000 strain is the same as the one that has the same pathogenicity as the GMI1000 strain and the GMI1000 strain.は、いずれか1 kind of gala legacy 伝子だけが発 appear する変different strains およびすべてのgala's remaining strains are not damaged, and the pathogenic properties of different strains are different. 4. The damaged strain of gala3 has the same pathogenicity as the wild strain.エフェクターの入れ为え実験として, この无码综合に8266 strainのgala3缝子を図5のtechnique を用いて Import した. The タバコ叶に inoculation したところ, the OE1-1 wild strain と同様にpathogenic をshow, and the HR は时さなかった. gala3 remains 伝子は, OE1-1 strain and 8266 strains are saved by the roomことからタバコに対するHR is due to とはならないとのとよく unanimous している.