权益分类	功能权益	普通用户	{{item.name}}会员
{{category.name}}	{{benefitItem.name}}

溶液理論と分子シミュレーションの融合による機能性分子の膜結合の分子論的解析

结合溶液理论和分子模拟对功能分子膜结合进行分子分析

基本信息

批准号：
20038034
负责人：
松林伸幸
金额：
$ 0.83万
依托单位：
Kyoto University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
财政年份：
2008
资助国家：
日本
起止时间：
2008 至无数据
项目状态：
已结题

项目摘要

本研究の目的は、膜結合の自由エネルギーの定量的解析である。リン脂質二重膜への物質結合を系統的に検討する。膜への結合は、溶質がバルクの水から膜の内部・界面へ移行する過程に相当する。膜系を水と脂質分子からなる「混合溶媒」とみなすことで、膜系への溶質挿入の自由エネルギー変化を取扱った。DMPC(1,2-dimyristoyl-sn-glycero-3-phosphatidylcholine)の脂質二重膜への疎水性分子の結合の自由エネルギー解析を行った。膜中で大きな自由エネルギー安定化を見出したが、膜内部での強い局在化の傾向は無いことを示した。これは、SDSミセルの場合と対照的であり、DMPC頭部がメチルやメチレン基を有し、親水性が「中途半端」であるためである。さらに、溶媒和自由エネルギーをDMPCからの寄与と水からの寄与に分割した。分散引力の低下を大きく上回る斥力効果(排除体積効果)の低下によって、膜の界面領域にあるとき、水は疎水性溶質を安定化する方向に働くことを見出した。さらに、一般麻酔薬ハロタンを取り上げ、膜結合強度の圧力依存性を解析した。数百気圧までの条件、すなわち、圧力拮抗作用が見出されている生理的条件では、ハロタンのDMPCへの結合の自由エネルギー変化は、単調に圧力に依存し、かつ、小さいことを明らかにした。これは、1世紀にわたる謎である圧力拮抗作用の要因として、膜結合強度の圧力依存性はマイナーであることを示すものである。次いで、20残基程度の膜蛋白質であるグリコフォリンAを取り上げ、その脂質膜結合の自由エネルギー解析を行った。小分子で行ったと同様に、結合自由エネルギーを脂質膜との相互作用の寄与と水との相互作用の寄与に分割し、水の効果を定量的に示している。

The purpose of this study is to quantitatively analyze the free radical of membrane binding. A study of the substance binding system of lipid double membrane The process of membrane binding, solute formation, and membrane internal/interface transition is quite similar. The membrane system is a mixture of water and lipid molecules, and the membrane system is a mixture of solute and lipid molecules. Analysis of the free radical binding of aqueous molecules in lipid double membranes of DMPC(1,2-dimyristoyl-sn-glycero-3-phosphoxylcholine) The stabilization of large free spheres in the film is evident, and the tendency of strong interaction inside the film is no longer present. In the case of SDS, the DMPC head has a base, and the hydrophilicity is "halfway". In addition, the solvent and the free life of the DMPC are divided into two parts. Dispersive attraction decreases greatly and repels upward (excluding volume effects), and decreases in the interfacial area of the membrane, as well as in the direction of stabilization of the aqueous solute. In this paper, the relationship between membrane bonding strength and pressure is analyzed. The physiological conditions for the formation of hundreds of degrees of pressure, pressure antagonism, etc., and the combination of DMPC and DMPC are free to change, and the pressure antagonism depends on the degree of pressure. In the first century, the relationship between membrane binding strength and pressure antagonism was discussed. Second, the 20 residue level of membrane protein is selected from the top, and the lipid membrane binding is analyzed. The interaction between small molecules and lipid membrane is characterized by the interaction between small molecules and lipid membrane, and the interaction between small molecules and lipid membrane is characterized by the interaction between small molecules and lipid membrane.