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形態変化する分子を用いた並行計算と分散計算

使用形态变化分子的并行分布式计算

基本信息

批准号：
14085202
负责人：
萩谷昌己
金额：
$ 79.49万
依托单位：
The University of Tokyo
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
财政年份：
2002
资助国家：
日本
起止时间：
2002 至 2006
项目状态：
已结题

项目摘要

形態変化するDNA分子の設計方法:萩谷は、連続ヘアピンからなる分子マシンに関して、ヘアピンの配列を変化させたときに、3連続ヘアピンから成る分子マシンの挙動がどのように変化するかを調べた。分子マシンの光制御を目指した光機能性超分子の構築:浅沼は、これまでとは逆に「cis-体で二重鎖形成、trans-体で解離」というスイッチングが可能な光応答性DNAの設計と実現に成功した。ヘアピンとバルジによる並行計算:萩谷は、Whiplash PCRの熱力学的な解析と、状態遷移の効率化(Displacement WPCR)を行った。レトロウィルスによる並行計算:陶山は、二つの正帰還と一つの負帰還反応から構成されたオシレータをRTRACの基本反応を用いて構築した。シミュレーションにより発振可能な条件が存在することを確かめた後、実装を進めた。翻訳系による並行計算:横山は、翻訳システムを利用した「オートマトン」を動物細胞(培養細胞)内でも構築することを目標に、非天然型アミノ酸が細胞に与えられた場合にのみ活性化され、サプレッサーtRNAにアミノ酸を結合するような酵素(アミノアシルtRNA合成酵素)を用いることにより、サプレションを制御する機構を構築した。DNA Walker:萩谷は、DNA Walkerの構築に向けて、温度、pH、光の三種類の入力によって駆動する分子マシンに関する予備実験を行った。特に、これらの三種類の入力の独立性について調べた。マイクロチップのための微量液体制御機構の開発:藤井は、液滴操作に必要な周辺技術等の整備を進め、オンデマンド式で液滴の生成・合一の操作が可能にした。また、本技術を用いてDNAとPNAのハイブリダイゼーション反応と電気泳動による反応産物の分離操作をデバイス上で実現した

The configuration and configuration of DNA molecular devices are as follows: data storage, link analysis, molecular configuration, configuration and configuration, and three-link configuration. Molecular photoluminescence system is designed to detect the photosensitivity of supramolecular devices: shallow marshes, rapid growth of cis- bodies, double formation of trans- bodies, dissociation of trans- systems, optical response DNA devices may be designed successfully. The calculation is carried out in parallel: the valley, the Whiplash PCR, the mechanical analysis, the shape shift, the probability (Displacement WPCR). In the meantime, you can calculate the price of Tao Shan, the second half of the year, and the first day of the year, and the result is that you basically use the RTRAC to make sure that you don't have to. Please make sure that the vibration conditions exist before you install the equipment. The parallel calculation of Yokohama and Fengyama is as follows: in Yokohama, Hengshan, Yokohama, Hengshan, Yokohama, Yokoyama, Yokohama, Yokoyama, Yokoyama, Yokohama, Yokoyama, Yoko We should make sure that we control and control the supervision and control of the financial institutions to conduct the operation of the police. DNA Walker: the temperature, temperature, pH, and light levels of the equipment are affected by the temperature, temperature, pH, and light emission. There are three types of independence, such as special training and information management. During the opening of the micro-liquid control facility: Fujii, droplet operation is necessary, the equipment is improved, and the combination of droplet generation and operation is possible. In this technology, you can use the DNA equipment, PNA equipment, etc.