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オープンサイエンスの分析と基盤的ソフトウェアの構築

オープンサイエンスの分析と基盤的ソフトウェアの構築
开放科学分析和基础软件构建
批准号:
21650018
负责人:
萩谷 昌己
金额:
$1.92万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research
财政年份:
2009
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2009 至 2010

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项目成果

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本年度は,オープンサイエンスを志向した情報システム構築を行った.情報システムは,Media Wikiを拡張することによって構築されており,インターネットにアクセス可能なコンピュータであれば,自由に閲覧・編集できるようになっている.これを基盤システムとして,はじめに化学実験に関する情報を電子的に保管するためのテンプレートの作成を行った.実験の情報は,「Material Page」「Method Page」「Result Page」に分類され,相互に関連するページは整合性を保つようにリンク付けされる.データは電子的に保存されているため,検索性に優れており,即座に必要な情報にアクセスすることが可能である.また,前述したように各種の情報は整合性を保つ形で保存されており,どの実験結果のデータからでも元となる原データや実験プロトコルに辿りつくことができる.つまり,traceabilityを備えている.従来の実験系研究では,全てのデータは外部に非公開の実験ノートに記載されていたため,部外者は論文に記載されている一部のデータにしかアクセスできなかった.また,実験ノートにアクセスできたとしても,各々の流儀で書かれているために検索性や可読性,traceabilityに難があったが,本システムの導入により,これらの問題が解決され,実験系研究の進展が加速されることが期待される.また,情報システムの構築に加えて,iGEMの部門賞「Information Processing」を受賞するなど,オープンサイエンス活動に様々な観点から貢献した.
期刊论文(0)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
Hybrid Method for Simulating Small-Number Molecular Systems
模拟小数量分子系统的混合方法
DOI: --
发表时间: 2009
期刊: Algorithmic Bioprocesses, Natural Computing Series
影响因子: --
作者: [Kazufumi Mizunuma, Masami Hagiya]
通讯作者: Masami Hagiya
DNAロボットの自動設計に向かって
DNA机器人的自动化设计
DOI: --
发表时间: 2009
期刊:
影响因子: --
作者: [K.Ito, D.Sumpter, T.Nakagaki, Toshihiko Ogura, 萩谷昌己]
通讯作者: 萩谷昌己
DOI: 10.1186/1471-2164-11-s4-s16
发表时间: 2010-12-02
期刊: BMC genomics
影响因子: 4.4
作者: [Ayukawa S, Kobayashi A, Nakashima Y, Takagi H, Hamada S, Uchiyama M, Yugi K, Murata S, Sakakibara Y, Hagiya M, Yamamura M, Kiga D]
通讯作者: Kiga D
DOI: --
发表时间: 2010
期刊:
影响因子: --
作者: [川又生吹, 木賀大介, 有田正規, 田中文昭, 萩谷昌己]
通讯作者: 萩谷昌己
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    形態変化する分子を用いた並行計算と分散計算
    • 批准号:
      14085202
    • 项目类别:
      Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
    • 资助金额:
      $79.49万
    • 财政年份:
      2002
    • 负责人:
      萩谷 昌己
    • 依托单位:
    分子プログラミング
    • 批准号:
      14085101
    • 项目类别:
      Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
    • 资助金额:
      $34.88万
    • 财政年份:
      2002
    • 负责人:
      萩谷 昌己
    • 依托单位:
    ハイブリッド・セル・オートマトンを用いた生物系と化学系の解析と検証
    • 批准号:
      14658088
    • 项目类别:
      Grant-in-Aid for Exploratory Research
    • 资助金额:
      $1.47万
    • 财政年份:
      2002
    • 负责人:
      萩谷 昌己
    • 依托单位:
    分子計算の効率と忠実度
    • 批准号:
      01F00061
    • 项目类别:
      Grant-in-Aid for JSPS Fellows
    • 资助金额:
      $0.77万
    • 财政年份:
      2001
    • 负责人:
      萩谷 昌己
    • 依托单位:
    国内基金
    海外基金
    青藤碱生物合成下游途径解析及合成生物学体系构建
    • 批准号:
      2026JJ30121
    • 项目类别:
      省市级项目
    • 资助金额:
      --
    • 批准年份:
      2026
    • 负责人:
      黄雪霜
    • 依托单位:
    天然产物合成生物学绿色制造中试基地建设培育
    • 批准号:
      2026ZYQ058
    • 项目类别:
      省市级项目
    • 资助金额:
      --
    • 批准年份:
      2026
    • 负责人:
      刘书灿
    • 依托单位:
    基于合成生物学的动物底盘品种优化及中试应用研究
    基于结构和序列的硒糖基转移酶SenB热稳定性改造及麦角硒因合成生物学研究
    • 批准号:
      JCZRQN202500672
    • 项目类别:
      省市级项目
    • 资助金额:
      --
    • 批准年份:
      2025
    • 负责人:
    • 依托单位: