オープンサイエンスの分析と基盤的ソフトウェアの構築
オープンサイエンスの分析と基盤的ソフトウェアの構築
批准号:
21650018
负责人:
萩谷 昌己
金额:
$1.92万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research
财政年份:
2009
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2009 至 2010
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本年度は,オープンサイエンスを志向した情報システム構築を行った.情報システムは,Media Wikiを拡張することによって構築されており,インターネットにアクセス可能なコンピュータであれば,自由に閲覧・編集できるようになっている.これを基盤システムとして,はじめに化学実験に関する情報を電子的に保管するためのテンプレートの作成を行った.実験の情報は,「Material Page」「Method Page」「Result Page」に分類され,相互に関連するページは整合性を保つようにリンク付けされる.データは電子的に保存されているため,検索性に優れており,即座に必要な情報にアクセスすることが可能である.また,前述したように各種の情報は整合性を保つ形で保存されており,どの実験結果のデータからでも元となる原データや実験プロトコルに辿りつくことができる.つまり,traceabilityを備えている.従来の実験系研究では,全てのデータは外部に非公開の実験ノートに記載されていたため,部外者は論文に記載されている一部のデータにしかアクセスできなかった.また,実験ノートにアクセスできたとしても,各々の流儀で書かれているために検索性や可読性,traceabilityに難があったが,本システムの導入により,これらの問題が解決され,実験系研究の進展が加速されることが期待される.また,情報システムの構築に加えて,iGEMの部門賞「Information Processing」を受賞するなど,オープンサイエンス活動に様々な観点から貢献した.
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Hybrid Method for Simulating Small-Number Molecular Systems
模拟小数量分子系统的混合方法
DOI:
--
发表时间:
2009
期刊:
Algorithmic Bioprocesses, Natural Computing Series
影响因子:
--
作者:
[Kazufumi Mizunuma, Masami Hagiya]
通讯作者:
Masami Hagiya
DNAロボットの自動設計に向かって
DNA机器人的自动化设计
DOI:
--
发表时间:
2009
期刊:
影响因子:
--
作者:
[K.Ito, D.Sumpter, T.Nakagaki, Toshihiko Ogura, 萩谷昌己]
通讯作者:
萩谷昌己
DOI:
10.1186/1471-2164-11-s4-s16
发表时间:
2010-12-02
期刊:
BMC genomics
影响因子:
4.4
作者:
[Ayukawa S, Kobayashi A, Nakashima Y, Takagi H, Hamada S, Uchiyama M, Yugi K, Murata S, Sakakibara Y, Hagiya M, Yamamura M, Kiga D]
通讯作者:
Kiga D
合成生物学の実験のためのトレース可能なデータベース
合成生物学实验的可追溯数据库
DOI:
--
发表时间:
2010
期刊:
影响因子:
--
作者:
[川又生吹, 木賀大介, 有田正規, 田中文昭, 萩谷昌己]
通讯作者:
萩谷昌己
DNAプログラミング~塩基配列設計からDNAナノ構造・分子デバイスの設計まで~
DNA编程~从碱基序列设计到DNA纳米结构/分子器件设计~
DOI:
--
发表时间:
2009
期刊:
影响因子:
--
作者:
[田中文昭, 川又生吹, 萩谷昌己]
通讯作者:
萩谷昌己
共 12 条
形態変化する分子を用いた並行計算と分散計算
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批准号:14085202
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$79.49万
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财政年份:2002
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负责人:萩谷 昌己
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依托单位:
分子プログラミング
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批准号:14085101
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$34.88万
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财政年份:2002
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负责人:萩谷 昌己
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依托单位:
ハイブリッド・セル・オートマトンを用いた生物系と化学系の解析と検証
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批准号:14658088
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项目类别:Grant-in-Aid for Exploratory Research
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资助金额:$1.47万
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财政年份:2002
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负责人:萩谷 昌己
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依托单位:
分子計算の効率と忠実度
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批准号:01F00061
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项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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资助金额:$0.77万
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财政年份:2001
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负责人:萩谷 昌己
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依托单位:
高階単一化を用いた例によるプログラミングと例による証明
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批准号:02780027
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.26万
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财政年份:1990
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负责人:萩谷 昌己
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依托单位:
並列LISPについて
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批准号:63780033
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.38万
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财政年份:1988
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负责人:萩谷 昌己
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依托单位:
拡張可能な型を持つ関数型言語に関する研究
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批准号:62780040
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.38万
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财政年份:1987
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负责人:萩谷 昌己
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依托单位:
データ型の編集に関する研究
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批准号:61780044
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.45万
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财政年份:1986
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负责人:萩谷 昌己
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依托单位:
プログラム合成論の論理プログラム・コンパイラへの応用
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批准号:58780040
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.45万
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财政年份:1983
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负责人:萩谷 昌己
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依托单位:
国内基金
海外基金
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青藤碱生物合成下游途径解析及合成生物学体系构建
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批准号:2026JJ30121
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项目类别:省市级项目
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资助金额:--
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批准年份:2026
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负责人:黄雪霜
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依托单位:
天然产物合成生物学绿色制造中试基地建设培育
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批准号:2026ZYQ058
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项目类别:省市级项目
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资助金额:--
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批准年份:2026
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负责人:刘书灿
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依托单位:
基于合成生物学的动物底盘品种优化及中试应用研究
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批准号:
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项目类别:省市级项目
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资助金额:--
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批准年份:2025
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负责人:赵萍
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依托单位:
基于结构和序列的硒糖基转移酶SenB热稳定性改造及麦角硒因合成生物学研究
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批准号:JCZRQN202500672
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项目类别:省市级项目
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资助金额:--
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批准年份:2025
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负责人:
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依托单位:
合成生物学驱动的多源非粮饲料蛋白资源高效利用技术开发和产业化
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批准号:
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项目类别:省市级项目
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资助金额:--
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批准年份:2025
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负责人:韩涛
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依托单位:
基于多模态生物医学数据库的祛风消癥通络方治疗狼疮性肾炎活性小分子作用机制及其合成生物学研究
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批准号:
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项目类别:省市级项目
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资助金额:--
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批准年份:2025
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负责人:涂晓
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依托单位:
基于合成生物学的γ-氨基丁酸高效制备技术研发及产业化
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批准号:
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项目类别:省市级项目
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资助金额:--
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批准年份:2025
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负责人:
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依托单位:
合成生物学驱动的生物电子药物设计开发与应用研究
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批准号:
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项目类别:省市级项目
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资助金额:--
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批准年份:2025
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负责人:叶海峰
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依托单位:
基于合成生物学的汞形态特异性可视化
传感器开发及其在环境与人群暴露监测
中的应用
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批准号:
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项目类别:省市级项目
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资助金额:10.0万元
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批准年份:2025
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负责人:惠长野
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依托单位:
枇杷miRNA跨界转运系统的合成生物学设计与抗病应用
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批准号:
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项目类别:省市级项目
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资助金额:--
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批准年份:2025
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负责人:勾秀红
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依托单位: