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Refinement of protein structure prediction by using simulation and database analyses

Refinement of protein structure prediction by using simulation and database analyses
通过模拟和数据库分析完善蛋白质结构预测
批准号：
16K16142
负责人：
Shirota Matsuyuki
金额：
$2.5万
依托单位：
Tohoku University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
财政年份：
2016
资助国家：
日本
项目状态：
已结题
起止时间：
2016-04-01 至 2018-03-31
来源：
https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-16K16142/
关键词：
蛋白質構造構造予測RNA-seq蛋白質立体構造アミノ酸配列水素結合二次構造シミュレーションリファインメントデータベース解析分子動力学シミュレーション経験的評価関数立体構造予測

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NGSで見つかる選択的マイクロエクソンとタンパク質構造・機能への影響
NGS 发现的选择性微外显子及其对蛋白质结构和功能的影响
DOI： --
发表时间： 2017
期刊：
影响因子： --
作者： [Sakura Rai, Mayu Aoki, Yutaka Shimada, Kantaro Fujiwara, and Tohru Ikeguchi, 城田松之]
通讯作者： 城田松之
Annotation of missense genomic variations based on various protein 3D structures
基于各种蛋白质 3D 结构的错义基因组变异注释
DOI： --
发表时间： 2017
期刊：
影响因子： --
作者： [小山 直毅, 田中 一晶, 小川 浩平, 石黒 浩, Matsuyuki Shirota]
通讯作者： Matsuyuki Shirota
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DOI： --
发表时间： 2017
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影响因子： --
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通讯作者： Matsuyuki Shirota
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生物体的冷适应和蛋白质序列的进化
DOI： --
发表时间： 2016
期刊：
影响因子： --
作者： [Naoki Koyama, Kazuaki Tanaka, Kohei Ogawa, Hiroshi Ishiguro, 城田松之]
通讯作者： 城田松之
共 6 条
    Development of information system for functional annotation of genomic sequence alterations by using protein 3D structures
    • 批准号：
      18K06194
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
    • 资助金额：
      $2.83万
    • 财政年份：
      2018
    • 负责人：
      Shirota Matsuyuki
    • 依托单位：
      Tohoku University
    Development of a database of buried polar residues in protein structures
    • 批准号：
      26730148
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
    • 资助金额：
      $2.41万
    • 财政年份：
      2014
    • 负责人：
      Shirota Matsuyuki
    • 依托单位：
      Tohoku University
    海外基金