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Development of information system for functional annotation of genomic sequence alterations by using protein 3D structures

Development of information system for functional annotation of genomic sequence alterations by using protein 3D structures
利用蛋白质 3D 结构开发基因组序列改变功能注释的信息系统
批准号：
18K06194
负责人：
Shirota Matsuyuki
金额：
$2.83万
依托单位：
Tohoku University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
财政年份：
2018
资助国家：
日本
项目状态：
已结题
起止时间：
2018-04-01 至 2021-03-31
来源：
https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-18K06194/
关键词：
タンパク質立体構造ゲノムバリアントデータベース機能欠失変異蛋白質構造ゲノム配列変化蛋白質機能非同義置換機能解析蛋白質立体構造ゲノム塩基配列変化

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Development of genome variant annotation system with protein 3D structures and applications to variants in Japanese population
开发具有蛋白质 3D 结构的基因组变异注释系统及其在日本人群变异中的应用
DOI： --
发表时间： 2018
期刊：
影响因子： --
作者： [Saitoh Yasuaki, Katane Masumi, Miyamoto Tetsuya, Sekine Masae, Sakamoto Taro, Imai Hirotaka, Homma Hiroshi, Matsuyuki Shirota]
通讯作者： Matsuyuki Shirota
Comprehensive and Up-to-date Annotation of Nonsynonymous Single Nucleotide Variants of Human Genome with Protein Structure Information
具有蛋白质结构信息的人类基因组非同义单核苷酸变异体的全面和最新注释
DOI： --
发表时间： 2020
期刊：
影响因子： --
作者： [Hanai Toshihiko, Katane Masumi, Homma Hiroshi, Matsuyuki Shirota]
通讯作者： Matsuyuki Shirota
蛋白質立体構造を用いたゲノムバリアントのアノテーション法の開発と日本人集団バリアントへの応用
使用蛋白质 3D 结构开发基因组变异注释方法及其在日本人群变异中的应用
DOI： --
发表时间： 2018
期刊：
影响因子： --
作者： [Saitoh Yasuaki, Katane Masumi, Miyamoto Tetsuya, Sekine Masae, Sakamoto Taro, Imai Hirotaka, Homma Hiroshi, Matsuyuki Shirota, Zhiying You, 城田松之]
通讯作者： 城田松之
Analysis on nonsynonymous variations with possible structural and functional impact on loss-of-function intolerant proteins
分析对功能丧失不耐受蛋白可能产生结构和功能影响的非同义变异
DOI： --
发表时间： 2019
期刊：
影响因子： --
作者： [Hanai Toshihiko, Katane Masumi, Homma Hiroshi, Matsuyuki Shirota, Matsuyuki Shirota]
通讯作者： Matsuyuki Shirota
共 6 条
    Refinement of protein structure prediction by using simulation and database analyses
    • 批准号：
      16K16142
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
    • 资助金额：
      $2.5万
    • 财政年份：
      2016
    • 负责人：
      Shirota Matsuyuki
    • 依托单位：
      Tohoku University
    Development of a database of buried polar residues in protein structures
    • 批准号：
      26730148
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
    • 资助金额：
      $2.41万
    • 财政年份：
      2014
    • 负责人：
      Shirota Matsuyuki
    • 依托单位：
      Tohoku University
    海外基金