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Prediction of macromolecular interactions involving lncRNAs

Prediction of macromolecular interactions involving lncRNAs
涉及 lncRNA 的大分子相互作用的预测
批准号：
16K16143
负责人：
Iwakiri Junichi
金额：
$2.66万
依托单位：
The University of Tokyo
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
财政年份：
2016
资助国家：
日本
项目状态：
已结题
起止时间：
2016-04-01 至 2020-03-31
来源：
https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-16K16143/
关键词：
長鎖ノンコーディングRNAlncRNARNA-RNA相互作用核内構造体長鎖非コードRNARNA-seq2次構造long non-coding RNARNA-タンパク質相互作用CLIP-seq機械学習lncRNAの機能

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会议论文
Identification of Transposable Elements which contribute to tissue specific expression of lncRNAs
鉴定有助于 lncRNA 组织特异性表达的转座元件
DOI： --
发表时间： 2017
期刊：
影响因子： --
作者： [Takafumi Chishima, Junichi Iwakiri and Michiaki Hamada]
通讯作者： Junichi Iwakiri and Michiaki Hamada
先進的RNA-seqのデータ解析を改善するマッピングパラメータ学習
映射参数学习以改进高级 RNA-seq 数据分析
DOI： --
发表时间： 2018
期刊：
影响因子： --
作者： [岩切淳一, Martin C. Frith, 浜田道昭, 浅井潔]
通讯作者： 浅井潔
LncRRIsearch: A Web Server for lncRNA-RNA Interaction Prediction Integrated With Tissue-Specific Expression and Subcellular Localization Data
DOI： 10.3389/fgene.2019.00462
发表时间： 2019-05-28
期刊： FRONTIERS IN GENETICS
影响因子： 3.7
作者： [Fukunaga, Tsukasa, Iwakiri, Junichi, Hamada, Michiaki]
通讯作者： Hamada, Michiaki
reactIDR: evaluation of the statistical reproducibility of high-throughput structural analyses towards a robust RNA structure prediction
DOI： 10.1186/s12859-019-2645-4
发表时间： 2019-03-29
期刊： BMC BIOINFORMATICS
影响因子： 3
作者： [Kawaguchi, Risa, Kiryu, Hisanori, Sese, Jun]
通讯作者： Sese, Jun
共 18 条
    Large-scale analysis of archived sequencing data in public database for functional analysis of long non-coding RNAs
    • 批准号：
      20K12041
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
    • 资助金额：
      $2.83万
    • 财政年份：
      2020
    • 负责人：
      Iwakiri Junichi
    • 依托单位：
      The University of Tokyo
    国内基金
    海外基金
    基于 LnCRNA TUG1/KLF2 途径探讨小胶质细胞在 AD 中的炎性活化机制及阿司匹林姜黄素酯抗炎机制研究
    • 批准号：
      2026JJ70134
    • 项目类别：
      省市级项目
    • 资助金额：
      --
    • 批准年份：
      2026
    • 负责人：
      贺春香
    • 依托单位：
      湖南省中医药研究院
    LncRNA SCAT8通过E2F1/CCND1通路调控结直肠癌奥沙利铂耐药的机制研究
    • 批准号：
      2026JJ82383
    • 项目类别：
      省市级项目
    • 资助金额：
      --
    • 批准年份：
      2026
    • 负责人：
      胡英斌
    • 依托单位：
      湖南省肿瘤医院
    新型lncRNA RP11-386G11.10通过ceRNA网络调控miR-345-3p/CREB5轴促进黑色素瘤进展的机制探索
    • 批准号：
      2026JJ81952
    • 项目类别：
      省市级项目
    • 资助金额：
      --
    • 批准年份：
      2026
    • 负责人：
      党委
    • 依托单位：
      长沙市中心医院
    外泌体lncRNA TUG1通过miR-204-5p/FOXC1信号通路靶向调控HUVECs促进肝母细胞瘤血管生成的机制研究
    • 批准号：
      2026JJ81317
    • 项目类别：
      省市级项目
    • 资助金额：
      --
    • 批准年份：
      2026
    • 负责人：
      袁妙贤
    • 依托单位：
      湖南省儿童医院