Epigenetic controls of plant development and genome structure

植物发育和基因组结构的表观遗传控制

基本信息

  • 批准号:
    14GS0321
  • 负责人:
  • 金额:
    $ 215.9万
  • 依托单位:
  • 依托单位国家:
    日本
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Creative Scientific Research
  • 财政年份:
    2002
  • 资助国家:
    日本
  • 起止时间:
    2002 至 2006
  • 项目状态:
    已结题

项目摘要

FWA has been identified as the gene responsible for a late-flowering epigenetic trait (Mol Cell 6, 791-). In this project, we examined expression of the FWA gene during normal development. The FWA gene was expressed specifically in endosperm in an imprinted manner. The tissue-specific and imprinted FWA expression depends on DNA methyltransferase MET1 and DNA demethylase DEMETER (Science 303, 521-). It was also shown that FT is the inducer of flowering (Science 309, 1052-), and the FWA affects flowering by inhibiting the FT function at the protein level (Plant Cell Physiol 48, 205-).We have previously shown that Arabidopsis CACTA transposons are silent in wild type, but they are mobilized in mutant of a chromatin remodeling gene DDM1 (decrease in DNA methylation) (Nature 411, 212-). In this project, we showed that the CACTA transposons transposed in the double mutants of CG methylase MET1 and non-CG methylase CMT3. The results suggest that DNA methylation is necessary for immobilization of this class of transposons (Curr Biol 13, 421-).Transcription of CACTA was de-repressed by mutations in the MET1 or a chromatin assembly factor FAS (Curr Biol 13, 421-, Genes to Cells 18, 153-). Heterochromatin in CACTA locus or other peri-centromeric sequences was disrupted by the ddml mutation, and this effect was heritable even in the wild type background (EMBO J 21, 6549-). Using this system, we also showed that each of CACTA transposition was not targeted to heterochromatin (Genetics 168, 961-). It is interesting how the transposons accumulate to form the heterochromatin.
FWA已被鉴定为负责晚开花表观遗传性状的基因(Mol Cell 6,791-)。在这个项目中,我们研究了FWA基因在正常发育过程中的表达。FWA基因在胚乳中以印迹方式特异表达。组织特异性和印迹FWA表达取决于DNA甲基转移酶MET 1和DNA脱甲基酶DEMETER(Science 303,521-)。FT是开花的诱导剂(Science 309,1052-),并且FWA通过在蛋白质水平上抑制FT功能来影响开花我们先前已经证明拟南芥CACTA转座子在野生型中是沉默的,但是它们在染色质重塑基因DDM 1的突变体中被移动(DNA甲基化减少)(Nature 411,212-)。在该项目中,我们证明了CACTA转座子在CG甲基酶MET 1和非CG甲基酶CMT 3的双突变体中转座。结果表明,DNA甲基化是固定这类转座子所必需的(Curr Biol 13,421-)ACTA的转录被MET 1或染色质组装因子FAS中的突变去抑制(Curr Biol 13,421-,Genes to Cells 18,153-)。在CACTA基因座或其他着丝粒周围序列中的异染色质被ddml突变破坏,并且这种效应即使在野生型背景中也是可遗传的(EMBO J 21,6549-)。使用该系统,我们还表明,每个CACTA转座不靶向异染色质(遗传学168,961-)。有趣的是转座子是如何积累形成异染色质的。

项目成果

期刊论文数量(64)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Simple one-week method to construct gene-targeting vectors: application to production of human knockout cell lines
  • DOI:
    10.2144/000112233
  • 发表时间:
    2006-09-01
  • 期刊:
  • 影响因子:
    2.7
  • 作者:
    Iiizumi, Susumu;Nomura, Yuji;Koyama, Hideki
  • 通讯作者:
    Koyama, Hideki
Soppe W. et al.: "DNA methylation controls histone H3 lysine 9 methylation and heterochromatin assembly in Arabidopsis"EMBO Journal. 21. 6549-6559 (2002)
Soppe W. 等人:“DNA 甲基化控制拟南芥中的组蛋白 H3 赖氨酸 9 甲基化和异染色质组装”EMBO 杂志。
  • DOI:
  • 发表时间:
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
  • 通讯作者:
Kakutani T.: "Epi-alleles in plants : Inheritance of epigenetic information over generations"Plant Cell Physiol. 43. 1106-1111 (2002)
Kakutani T.:“植物中的表观等位基因:表观遗传信息代代相传”植物细胞生理学。
  • DOI:
  • 发表时间:
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
  • 通讯作者:
Histone variant macroH2A1.2 is mono-ubiquitinated at its histone domain
Chromatin assembly factor 1 ensures the stable maintenance of silent chromatin states in Araidopsis
染色质组装因子 1 确保拟南芥中沉默染色质状态的稳定维持
  • DOI:
  • 发表时间:
    2006
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Ono;T.;et. al.
  • 通讯作者:
    et. al.
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    1988
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    1988
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  • 财政年份:
    1988
  • 资助金额:
    $ 215.9万
  • 项目类别:
X-CHROMOSOME INACTIVATION AND DNA METHYLATION
X 染色体失活和 DNA 甲基化
  • 批准号:
    3119677
  • 财政年份:
    1988
  • 资助金额:
    $ 215.9万
  • 项目类别:
X-CHROMOSOME INACTIVATION AND DNA METHYLATION
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  • 批准号:
    3119678
  • 财政年份:
    1988
  • 资助金额:
    $ 215.9万
  • 项目类别:
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作者:{{ showInfoDetail.author }}

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