Untersuchungen zur Evolution von E. Coli unter besonderer Berücksichtigung der Integration des Locus of Enterocyte Effacement (LEE) in Nicht-O157-E.coli-Stämmen

研究大肠杆菌的进化，特别关注非 O157 大肠杆菌菌株中肠细胞消失位点 (LEE) 的整合

• 批准号: 5110816
• 负责人: Professor Dr. Lothar H. Wieler
• 金额: --
• 依托单位: HPI Digital Health Center
• 依托单位国家: 德国
• 项目类别: Priority Programmes
• 财政年份: 1998
• 资助国家: 德国
• 起止时间: 1997-12-31 至 2004-12-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://gepris.dfg.de/gepris/projekt/5110816?language=en
• 关键词: Untersuchungen; zur; Evolution; von; E.

Im bisherigen Untersuchungszeitraum konnte durch die Identifizierung eines dritten Insertionsortes des Locus of enterocyte effacement (LEE) im E. coli-Genom die Entstehungsgeschichte der LEE-positiven Shigatoxin-bildenden E. coli (STEC) weiter aufgeklärt werden. Neben dem von McDaniel et al. (1995) nachgewiesenem LEE1 (selC) und dem von Benkel et al. (1996) bestimmten LEE2 (pheU) konnten wir einen dritten Insertionsort des LEE3 von Stamm RW1374 (O103:H2) identifizieren. Anhand der institutseigenen umfangreichen Stammsammlung gelang es uns darüber hinaus nachzuweisen, daß eine Assoziation zwischen dem jeweiligen LEE-Insertionsort, einem bestimmten Intimintyp sowie bestimmten Flagellin-Typen besteht. Weiterhin konnten wir durch Makrorestriktionsanalyse und Virulenztypisierung belegen, daß die STEC-Serogruppe O118 drei distinkte klonale Gruppen beherbergt. Lediglich Stämme der Serovare O118:H16/H- sind Zoonoseerreger. Sie kommen endemisch in Kälbern vor und sind von humanen O118:H16/H-EHEC-Stämmen nicht zu unterscheiden. Hingegen sind die humanen STEC-Serovare O118:H12 und O118:H30 anderen klonalen Gruppe zuzuordnen, und diese sind bei Kälbern nicht nachweisbar. Im beantragten Förderungszeitraum sollen nun weitere aufgedeckte Lücken in der Phylogenese LEE-positiver E. coli unter Einbeziehung bislang nicht untersuchter STEC-Stämme sowie zusätzlich enteropathogener E. coli (EPEC) -Stämme mit seltenen Serovaren und von verschiedener Herkunft (bovin, porcin, aviär, canin, human) geschlossen werden. Hierbei steht die Bestimmung der LEE-Insertionsorte, der Intimintypen sowie der H-Typen im Vordergrund, durch die bislang nicht untersuchte LEE-positive E. coli-Serovare phylogenetisch eingeordnet werden. Die Analysen sollen mit der objektivierbaren Methode der Multilocus-Sequenztypisierung (MLST) durchgeführt werden, wodurch die Methodik der Multilocus-Enzymelektrophorese (MLEE) ersetzt werden kann. Da die DNA-Analyse der flankierenden Bereiche des LEE3 aus Stamm RW1374 Sequenzen eines Prophagen sowie von Insertionselementen ergab, soll darüber hinaus die Mobilisierbarkeit des LEE3 untersucht werden. Schließlich soll durch Gewinnung von Antikörpern gegen den variablen Teil der einzelnen Intimintypen eine einfache Methode zur Einordnung einzelner Stämme in die jeweiligen phylogenetischen Linien etabliert werden.

通过对大肠杆菌肠上皮细胞缺失位点（LEE）的直接插入分类的鉴定，可以进一步了解LEE的临床特征。大肠杆菌LEE阳性志贺毒素Bildenden E.大肠杆菌（STEC）感染韦尔登。根据McDaniel等（1995）对LEE 1（selC）的研究和Benkel等（1996）对LEE 2（pheU）的估计，我们可以对Stamm RW 1374（O 103：H2）的LEE 3进行插入排序。此外，该机构还专门设计了一种新的标准，即在LEE嵌入式珠宝中加入一种新的协会，这种协会的最佳类型就是Flagellin-Typen。我们通过对O 118血清型STEC的病毒学分析和毒力分型，发现O 118血清型有三个不同的致病菌群。Lediglich Stämme der Serovare O118：H16/H- sind Zoonoseerreger.您可以在Kälbern的O 118：H16/H-EHEC-Stämmen中终止，但不需要进行检测。Hingegen sind die humanen STEC-Serovare O118：H12 und O118：H30 anderen klonalen Gruppe zuzuordnen，and diese sind bei Kälbern nicht nachweisbar. Im beantragten Förderungszeitraum sollen nun weitere aufgedeckte Lücken in der Phylogenese LEE-positiver E.大肠杆菌unter Einbeziehung bislang nicht untersuchter STEC-Stämme sowie zusätzlich肠病原体E.大肠杆菌（EPEC）-Stämme mit seltenen Serovaren und von vertenedener Herkunft（bovin，porcin，aviär，canin，human）geschlossen韦尔登。因此，我们可以将LEE插入分类，通过对未检测到LEE阳性的E.大肠杆菌-血清型大肠杆菌韦尔登。采用多位点测序分型（MLST）的客观方法进行分析，可以采用多位点酶促电泳（MLEE）的方法。用RW 1374测序仪对LEE 3侧翼序列进行DNA分析，可以获得插入序列，从而使LEE 3的移动性得到韦尔登。Schließlich soll durch Gewinnung von Antikörpern gegen den den variablen Teil der einzelnen Intimintypen eine einfache Methode zur Einordnung einzelner Stämme in die jeweiligen genetischen Linien etablert韦尔登.