ホスト－病原体間の相互作用におけるエピジェネティックなゲノム状態間のせめぎ合い

宿主-病原体相互作用中表观遗传和基因组状态之间的冲突

• 批准号: 13J02925
• 负责人: 福世 真樹
• 金额: $ 1.91万
• 依托单位: Chiba University (2014)The Graduate University for Advanced Studies (2013)
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for JSPS Fellows
• 财政年份: 2013
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2013-04-01 至 2015-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-13J02925/
• 关键词: 宿主・病原体共生系; エピジェネティクス; 制限修飾系; エピジェネティックス

感染について最もよく研究された細菌とファージの共進化実験で、軍拡競争がDNA配列レベルのジェネティックな変化の蓄積によることが，最近の実験で知られている．しかし，この様な相互作用の進化にエピゲノムの変遷がどのように関わるかについては，ほとんど報告が無い．そこで本研究では，「利己的なエピジェネティックな系の間のせめぎ合いが，ホスト・病原体の共存を促進する」可能性を検証するための実験系の構築，および小規模でのシミュレーションを用いた解析を行う．本研究は，エピジェネティックなシステム間のせめぎ合いによる、ゲノムのメチル化状態の変化が、ホストパラサイトの共存・共進化に重要な役割を果たしていることを示すパラダイムとなる，その成果は，エピジェネティックス，感染を初めとする生物間相互作用，そして，ゲノム内せめぎ合いの研究に，大きなインパクトを与えることが予想される．今年度の研究では，２種類のエピジェネティック系による大腸菌・ファージの共存に必要なパラメータ領域を求め，特に空間構造のあるときに維持されやすいことを示した．また当初の計画以外にも，新しい制限酵素の機能解析に取り組み，新しい制限酵素グループを提唱した．この結果について研究代表者を筆頭著者として論文にまとめた．さらに，大腸鋸歯状腺腫の臨床検体について変異解析，メチル化解析を行い，腺腫に特徴的な変異とメチル化を同定した．この結果について研究代表者を第二著者として論文を現在投稿中である．

Infection に つ い て most も よ く research さ れ た bacteria と フ ァ ー ジ の total evolution be 験 で, army company competition が DNA match column レ ベ ル の ジ ェ ネ テ ィ ッ ク な variations change の accumulation に よ る こ と が, recently の be 験 で know ら れ て い る. し か し, こ の others な interaction の evolution に エ ピ ゲ ノ ム の - moving が ど の よ う に masato わ る か に つ い て は, ほ と ん が no い ど report. そ こ で this study で は, "self-interested な エ ピ ジ ェ ネ テ ィ ッ ク な system between の の せ め ぎ close い が, ホ ス ト の coexist, pathogens を promote す る" を likely 検 card す る た め の be 験 の construct, お よ び small-scale で の シ ミ ュ レ ー シ ョ ン を with い た parsing う を line. This study は エ ピ ジ ェ ネ テ ィ ッ ク な シ ス テ ム between の せ め ぎ close い に よ る, ゲ ノ ム の メ チ ル change state の - が, ホ ス ト パ ラ サ イ ト の coexistence, common evolution に important な "を cut fruit た し て い る こ と を shown す パ ラ ダ イ ム と な る, そ は の achievements, エ ピ ジ ェ ネ テ ィ ッ ク ス, early infection を め と す る interaction between organisms, Within そ し て, ゲ ノ ム せ め ぎ close い に の research, big き な イ ン パ ク ト を and え る こ と が to think さ れ る. Our の research で は, 2 species の エ ピ ジ ェ ネ テ ィ ッ ク department に よ る coliform · フ ァ ー ジ の coexistence に necessary な パ ラ メ ー タ field を め, に spatial structure の あ る と き に maintain さ れ や す い こ と を shown し た. Youdaoplaceholder0 In addition to the original <s:1> plan, に に, the function analysis of the new <s:1> limiting enzyme に, taking the g group み, the new <s:1> limiting enzyme グ, プを プを, プを, た. Youdaoplaceholder5 <s:1> results に に て て て representative of the study を author of the paper と て て paper にまとめた. さ ら に, e. saw 歯 swollen glands の clinical 検 body に つ い て - analytical, メ チ ル resolve analysis を い, swollen glands of 徴 に な - different と メ チ ル change を be し た. The <s:1> results に に に て て the representative of the study を the second author と て て the paper を is now in the process of submission である.

项目成果

共起する遺伝子クラスターと可動性に基づくピロリ菌pan-genomeの特徴付け

基于共现基因簇和迁移性的幽门螺杆菌泛基因组特征

• 发表时间: 2014
• 作者: Jacob Albritton;福世真樹;矢原耕史;小林一三;内山郁夫
• 通讯作者: 内山郁夫

病原体の毒性進化解析 : バクテリオファージにおける溶原, 溶菌化の進化

病原体毒力进化分析：噬菌体中溶原和裂解的进化

• 发表时间: 2014
• 作者: 福世真樹;佐々木顕
• 通讯作者: 佐々木顕

Haploinsufficiency of the c-myc transcriptional repressor FIR, as a dominant negative-alternative splicing model, promoted p53-dependent T-cell acute lymphoblastic leukemia progression by activating Notch1.

• DOI: 10.18632/oncotarget.3244
• 发表时间: 2015-03-10
• 期刊: Oncotarget
• 作者: Matsushita K;Kitamura K;Rahmutulla B;Tanaka N;Ishige T;Satoh M;Hoshino T;Miyagi S;Mori T;Itoga S;Shimada H;Tomonaga T;Kito M;Nakajima-Takagi Y;Kubo S;Nakaseko C;Hatano M;Miki T;Matsuo M;Fukuyo M;Kaneda A;Iwama A;Nomura F
• 通讯作者: Nomura F

Success of an altruistic suicidal defense strategy: demonstration in bacteria-phage experimental system

利他自杀防御策略的成功：细菌噬菌体实验系统的演示

• 发表时间: 2014
• 作者: K. Matsushita;K. Kitamura;B. Rahmutulla;N. Tanaka;T. Ishige;M. Satoh;T. Hoshino;S. Miyagi;T. Mori;S. Itoga;H. Shimada;T. Tomonaga;M. Kito;Y. Nakajima-Takagi;S. Kubo;C. Nakaseko;M. Hatano;T. Miki;M. Matsuo;M. Fukuyo;A. Kaneda;A. Iwama,;Masaki Fukuyo，Akira Sasaki，Ichizo Kobayashi
• 通讯作者: Masaki Fukuyo，Akira Sasaki，Ichizo Kobayashi