適応放散における進化-生態フィードバックの寄与:微生物モデル系による実験的解析
適応放散における進化-生態フィードバックの寄与:微生物モデル系による実験的解析
批准号:
13J09268
负责人:
山本 京祐
金额:
$3.0万
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份:
2013
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2013-04-01 至 2016-03-31
中文摘要
前二年度に実施した進化実験(緑膿菌PAと黄色ブドウ球菌SAを使用)の結果、SAの共存によってPA集団の進化軌道が変化することが明らかとなっていたが、本年度はこの進化軌道の変化をより詳細に評価した。その結果、SAが共存する系では培養初期において有意にPA集団の多様度(Richness)が低下するが、これは特定のPA進化株(Sm株)の出現および優占化が、共存するSAによって促進されることに起因することが明らかとなった。このように、PAの進化動態は共存するSAとの相互作用によって変化することが実験的に示され、病原菌の進化過程、それも短いタイムスケールでの進化過程に種間相互作用が重要な役割を果たすことが示唆された。一方、様々なPA進化株について、より詳細な生理学的解析をおこない、運動性変化やバイオフィルム形成能の変化を検出した。同時に、SAの進化株についても対象を広げて生理学的解析をおこない、生育能やコロニー形態などを評価した。これらの結果、SA進化株の中には生育パターンが変化しているものがみられ、PAの進化動態変化に対応してSAの進化動態も変化していることが示唆された。また、Massey大学(ニュージーランド)において在外研究をおこない、これまでに得られたデータに基づく数理モデル解析を共同で実施した。ゲーム理論をベースとした数理モデルの構築をおこない、二種間の生態―進化フィードバック関係が成立するための相互作用パターンを模索した。
英文摘要
前二年度に実施した進化実験(緑膿菌PAと黄色ブドウ球菌SAを使用)の結果、SAの共存によってPA集団の進化軌道が変化することが明らかとなっていたが、本年度はこの進化軌道の変化をより詳細に評価した。その結果、SAが共存する系では培養初期において有意にPA集団の多様度(Richness)が低下するが、これは特定のPA進化株(Sm株)の出現および優占化が、共存するSAによって促進されることに起因することが明らかとなった。このように、PAの進化動態は共存するSAとの相互作用によって変化することが実験的に示され、病原菌の進化過程、それも短いタイムスケールでの進化過程に種間相互作用が重要な役割を果たすことが示唆された。一方、様々なPA進化株について、より詳細な生理学的解析をおこない、運動性変化やバイオフィルム形成能の変化を検出した。同時に、SAの進化株についても対象を広げて生理学的解析をおこない、生育能やコロニー形態などを評価した。これらの結果、SA進化株の中には生育パターンが変化しているものがみられ、PAの進化動態変化に対応してSAの進化動態も変化していることが示唆された。また、Massey大学(ニュージーランド)において在外研究をおこない、これまでに得られたデータに基づく数理モデル解析を共同で実施した。ゲーム理論をベースとした数理モデルの構築をおこない、二種間の生態―進化フィードバック関係が成立するための相互作用パターンを模索した。
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複雑な微生物群集における構造―機能相関~フィールドと実験室系~
复杂微生物群落的结构-功能关系 - 现场和实验室系统 -
DOI:
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发表时间:
2014
期刊:
影响因子:
--
作者:
[山本京祐, 草田裕之, 鎌形洋一, 玉木秀幸, 山本京祐]
通讯作者:
山本京祐
Impact of interspecies interactions on the evolutionary dynamics of pathogenic bacteria
种间相互作用对病原菌进化动态的影响
DOI:
--
发表时间:
2014
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Kyosuke Yamamoto, Yoichi kamagata, Hideyuki Tamaki]
通讯作者:
Hideyuki Tamaki
Massey University(ニュージーランド)
梅西大学(新西兰)
DOI:
--
发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
種間相互作用が駆動する病原菌の進化動態変化
种间相互作用驱动的病原菌进化动力学的变化
DOI:
--
发表时间:
2016
期刊:
影响因子:
--
作者:
[山本京祐, 草田裕之, 鎌形洋一, 玉木秀幸]
通讯作者:
玉木秀幸
P. aeruginosaの進化動態変化をもたらす共存細菌S. aureusとの種間相互作用
与共存细菌金黄色葡萄球菌的种间相互作用改变了铜绿假单胞菌的进化动态
DOI:
--
发表时间:
2016
期刊:
影响因子:
--
作者:
[山本京祐, 草田裕之, 鎌形洋一, 玉木秀幸]
通讯作者:
玉木秀幸
多栄養段階に渡る被食-捕食関係における群集・進化動態の実験的解析
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批准号:22K06350
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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资助金额:$2.66万
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财政年份:2022
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负责人:山本 京祐
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依托单位:
被食ー捕食ー超捕食系における進化的軍拡競争の微生物実験進化系による解析
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批准号:18K14763
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项目类别:Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
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资助金额:$2.75万
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财政年份:2018
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负责人:山本 京祐
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依托单位:
薬剤フリー環境において抗生物質耐性能がもたらす微生物間相互作用および群集動態変化
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批准号:24870034
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项目类别:Grant-in-Aid for Research Activity Start-up
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财政年份:2012
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负责人:山本 京祐
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依托单位:
微生物群集の構造的安定性および機能性に寄与する種間相互作用の解明
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批准号:10J02541
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项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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资助金额:$0.9万
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财政年份:2010
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负责人:山本 京祐
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依托单位:
国内基金
海外基金
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淫羊藿叶斑病微生物分离鉴定及拮抗菌筛选研究
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批准号:
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项目类别:省市级项目
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批准年份:2025
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依托单位:
耦合环境-病原菌防御-肠道微生物与对虾互作解析EMS/AHPND机理
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批准号:Z25C030006
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项目类别:省市级项目
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批准年份:2025
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负责人:熊金波
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植物共生菌群抑制病原菌入侵中涌现的叠加效应研究
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批准号:
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批准年份:2023
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耦合多病原菌—肠道微生物组—对虾免疫的肝胰腺坏死症机理解析和防控
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批准号:32371596
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项目类别:面上项目
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批准年份:2023
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负责人:熊金波
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批准号:--
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项目类别:面上项目
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批准年份:2022
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负责人:李哲斐
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依托单位:
杨梅腐烂病土传病原菌及其对微生物群落生态影响的研究
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批准号:42107019
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项目类别:青年科学基金项目(C类)
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资助金额:30.0万元
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批准年份:2021
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负责人:楼骏
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依托单位:
番茄青枯病病原菌响应土壤微生物多样性的适应性权衡及其阻控研究
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项目类别:面上项目
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批准年份:2021
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负责人:谷益安
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依托单位:
中华鳖肠道中细菌性病原菌拮抗菌的初步研究
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批准号:2021JJ40377
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项目类别:省市级项目
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批准年份:2021
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负责人:唐白露
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西南喀斯特山区连作半夏根际微生物组成与块茎病害关联性研究
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项目类别:地区科学基金项目
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批准年份:2020
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负责人:余珺
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依托单位:
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项目类别:地区科学基金项目
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批准年份:2020
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