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多栄養段階に渡る被食－捕食関係における群集・進化動態の実験的解析

跨多个营养级别的猎物-捕食关系的群落和进化动态的实验分析

基本信息

批准号：
22K06350
负责人：
山本京祐
金额：
$ 2.66万
依托单位：
National Institute of Advanced Industrial Science and Technology
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
财政年份：
2022
资助国家：
日本
起止时间：
2022-04-01 至 2025-03-31
项目状态：
未结题

项目摘要

本年度は先行研究において得られた進化株・集団、すなわち被食者（大腸菌）、捕食者（Bdellovibrio bacteriovorus）、上位捕食者（B. bacteriovorus感染性ウイルス）の3種を用いた二者および三者混合連続培養系による短期（5週間）進化実験で得られている各種の進化株・集団について生理学的・遺伝学的特徴づけを進めた。とくに、これまで未実施であった上位捕食者の性状評価に着手するため、上位捕食者進化株の分離培養を進めた。これにより上位捕食者の存在がいかにして捕食―被食系の進化動態を変化させるかという点について評価が可能になる。現在までに祖先型捕食者の捕食非依存性突然変異株（host-independent株）を宿主として用いて分離培養を進めているが、進化上位捕食者の感染性能や進化捕食者の感染感受性に変化がある可能性を考慮し、捕食者進化株のhost-independent株を取得し宿主として使用することも検討する。また、新規進化実験系を立ち上げて長期間の適応共進化実験を実施することはできなかったものの、これまでに得られている中期（10週間）・長期（6ヶ月～、被食者はPseudomonas fluorescens）進化実験系サンプルの一部の集団ゲノム情報を取得したため、変異点の解析に着手した。その結果、捕食者および被食者のゲノムにおいて多数の変異（一塩基置換および欠失）を同定することに成功している。今後各種変異が捕食者および被食者の表現型（捕食性能および捕食耐性等）に及ぼす影響を評価することで、多栄養段階に渡る微生物被食－捕食関係において適応的な表現型の分子基盤に迫る。

This year, we will first study the collection of improved plants, the predators (scallops), the predators (Bdellovibrio bacteriovorus), The last predator (B. bacteriovorus infectious disease) was used to develop a mixture of the two in a short period of time (within 5 years). In a short period of time (within 5 years), we obtained a special training in the physiology of all kinds of improved strains. The trait of the upper predator was not tested, and the plants of the upper predator were isolated and cultured for improvement. The upper predator has a predator that preys on the prey. The prey system changes the dynamics of the prey. Now that the ancestral predator preys on the undependent sudden predator strain (host-independent strain), the host plant uses the isolation culture to improve the infection performance of the epistatic predator, the infection sensitivity of the predator is improved, and the predator strain host-independent is used to obtain the host strain. The new standard system is used to improve the long-term performance of the system. In the middle of the 10-year-old period (over a period of 10 years), there is a long period of time (6 months or more) in the middle of the year (6 months or more, the prey is Pseudomonas fluorescens). According to the results, the predator and the predator did not know that the majority of the predators were successful. In the future, various types of predator tables (predator performance, predator tolerance, etc.) and predator-prey microbes, multi-stage ferry microorganisms are preyed on and prey on the molecular basis of predation.