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微生物群集の構造的安定性および機能性に寄与する種間相互作用の解明

阐明有助于微生物群落结构稳定性和功能的种间相互作用

基本信息

批准号：
10J02541
负责人：
山本京祐
金额：
$ 0.9万
依托单位：
The University of Tokyo
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份：
2010
资助国家：
日本
起止时间：
2010 至 2011
项目状态：
已结题

项目摘要

本研究では、モデル実験系を用いて空間的不均一性が細胞・個体群間相互作用や群集動態へ及ぼす影響を評価した。本実験系において主要な生育形態であるpellicle(気液界面に形成される多細胞構造体)の解析を中心に、系全体の個体群動態を解析した。pellicie形成機構の解明のため、各種遺伝子変異株を作製することで、各遺伝子のpellicle形成への寄与を評価した。まず、バイオフィルム形成や運動性に関わることが知られているラムノリピッドについて実験したところ、本実験系ではpellicle形成に対する寄与は少ないことがわかった。また、前年度の研究から、気液界面生育において鉄獲得能の重要性が示唆されていたことから、鉄取り込みに関わるシデロフォアについても同様に評価した。その結果、シデロフォア合成系遺伝子の変異はpellicle形成に大きな影響を与えなかった。さらに、鞭毛がpellicle形成に関わることを既に示しているが、鞭毛による運動性の有無と細胞表面の性質の変化とのどちらがpellicle形成に大きく寄与するかは不明であった。そこで、鞭毛モーター変異株を作製し、運動性のpellicle形成への寄与を評価した。その結果、鞭毛は有するが運動性を欠損した株でも、鞭毛欠損株と類似の表現型を示したため、pellicle形成には鞭毛による運動性が重要であることが示された。細胞外マトリックス形成に関わる細胞外多糖についても変異解析をおこない、3種の合成系のうちpslおよびpel遺伝子がpellicle形成に重要であることが示された。pellicle形成の生態学的意義を明らかにするため、細胞外多糖合成系変異株を用いて競合実験をおこなった。前年度と同様に、競合実験における相対適応度からpellicle形成の適応効果を評価したが、変異株はいわゆるsocial cheaterとして振舞う可能性が考えられたため、その頻度依存的効果を検証した。その結果、わずかに頻度依存的な適応度変化はみられたものの、常に適応度は低いままであり、pellicle形成は静置環境特異的に強い適応優位性をもたらすことが示された。

The purpose of this study is to use the heterogeneity of space and the interaction between cells in order to improve the dynamics of the cluster and the impact on the population. This department is mainly concerned with fertility, morphology, pellicle (liquid interface forms multiple cellular structures), analysis center, and dynamic analysis of all individual groups. The pellicie formation mechanism explains that all kinds of oysters are used for spotting, and that all kinds of pellicle are sent and sent to each other. I am sorry to hear that I am sorry to know that I am sorry to know that I am sorry. I am sorry to know that I am sorry to know that I am sorry. In the previous year, in the study of the liquid interface, the importance of the study and the importance of the liquid interface have been shown to indicate that they are of the same importance. The result of the experiment shows that the synthesis system has a large effect on the size of the pellicle. The pellicle formation of the flagella and the flagellum showed that the flagella and the flagellum had the characteristics of the cell surface, the cell surface, the pellicle and the unknown cells. The flagellum, flagellum, flagellum The results showed that the flagella were abnormal, the flagella were abnormal, the flagella were similar to those in the table, and the flagella were important in the formation of flagella. The formation of extracellular polysaccharides (EPS), the formation of extracellular polysaccharides (EPS), the formation of pel pellicle, the formation of extracellular polysaccharides (EPS), the formation of extracellular polysaccharides (EPS), the formation of extracellular polysaccharides (EPS), the formation of extracellular polysaccharides (EPS), the formation of extracellular polysaccharides (EPS), the formation of extracellular polysaccharides (EPS), the formation of extracellular polysaccharides (EPS), the formation of extracellular polysaccharides (EPS), the formation of extracellular polysaccharides (EPS), the formation of extracellular polysaccharides (EPS), the formation of extracellular polysaccharides (EPS), and the formation of three synthetic systems. Pellicle forms the meaning of pharmacology and extracellular polysaccharides synthesis system (EPS). In the previous year, the results showed that the pellicle was the same as that in the previous year. In the previous year, the results showed that the possibility of vibration and dance was the same as that in the previous year. In the previous year, the results of the previous year were similar to those of the previous year. The result of the experiment, the degree of temperature dependence, the temperature response, the low temperature response, and the pellicle formation of static environmental characteristics show that the environment is stable.

项目成果

期刊论文数量（0）

专著数量（0）

科研奖励数量（0）

会议论文数量（0）

专利数量（0）

運動性と多細胞構造体形成による細菌の優位ニッチ獲得戦略～気液界面を巡る陣取り合戦～

细菌通过运动和多细胞结构形成的优势生态位获取策略〜在气液界面争夺位置〜

DOI：
发表时间：
2011
期刊：
影响因子：
0
作者：
三村維真理;井上剛;和田洋一郎;堤修一;油谷浩幸;児玉龍彦;藤田敏郎;南学正臣;山本京祐
通讯作者：
山本京祐

好気性細菌におけるpellicle形成能の適応効果

需氧菌菌膜形成能力的适应性效应

DOI：
发表时间：
2010
期刊：
影响因子：
0
作者：
Imari Mimura;Tsuyoshi Inoue;Youichiro Wada;Shuichi Tsutsumi;Hiroyuki Aburatani;Toshiro Fujita;Tatsuhiko Kodama;Masaomi Nangaku.;山本京祐
通讯作者：
山本京祐

Trade-off between oxygen and iron acquisition in bacterial cells at the air-liquid interface