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脂質ベシクル変形機構の解明;三次元画像解析とシミュレーションによるアプローチ

脂質ベシクル変形機構の解明;三次元画像解析とシミュレーションによるアプローチ
利用三维图像分析和模拟阐明脂质囊泡变形机制
批准号:
13J10807
负责人:
坂下 あい
金额:
$0.64万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份:
2013
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2013 至 --

项目摘要

项目成果

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生体活動を維持する重要な細胞小器官の一つに、ミトコンドリアがある。その内膜にはクリステと呼ばれる特殊な襞状構造が存在するが、我々はこれが外膜による空間拘束の影響によるものであると仮定し、形状の起源を探究した。モデル系として脂質のみからなるモデル生体膜ベシクル(以下、ベシクル)を用い、実験・シミュレーション・理論の三方向から形状の定量化することで、拘束条件と形状の関係性を定量的に理解することに成功した。研究計画初年度である今年は、既に撮影していた実験結果を以下の二つのカテゴリーに分類した : 1)外側のべシクルが球形の場合。2)外側のべシクルが非球形の場合。ミトコンドリアは後者に近いが、今回は簡単のために前者の形状定量化を行った。シミュレーションには動的三角格子モデル(Noguchi, et al., 2009, J. Phys. Soc, Jpn.)を拡張した手法を構築し、実験結果と比較しながら形状を定量化した。その結果、実験で得られた球状ベシクルに内包されたベシクルの変形過程を忠実に再現することに成功した。その後はArea-difference--elasticityモデル(Svetina, et al., 1989 Eur Biophys.)を拡張し独自のモデルを作成したところ、今回の結果をよく記述できた。これはミトコンドリアのような複雑な構造が空間の制限だけで再現できるという非常に重要な結果である。同様の機構では他にも細胞分裂の胚にみられる構造も観察されたため、応用の余地があると言える。以上の結果は、物理学におけるベシクル形状研究がより生物学に近い形状の理解を可能にする第一歩になったと言える。
期刊论文(9)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
拘束条件及びトポロジーの違いによるベシクル変形機構の解明
阐明由于约束条件和拓扑差异导致的囊泡变形机制
DOI: --
发表时间: 2014
期刊:
影响因子: --
作者: [T. Toyao, K. Liang, K. Okada, R. Ricco, M. J. Styles, Y Tokudome, Y. Horiuchi, A. J. Hill, M. Takahashi, M. Matsuoka, P. Falcaro, 坂下あい]
通讯作者: 坂下あい
Morphological variation of a lipid vesicle confined in a spherical vesicle
限制在球形囊泡中的脂质囊泡的形态变化
DOI: 10.1103/physreve.89.040701
发表时间: 2014
期刊: Physical Review E
影响因子: 2.4
作者: [Ai Sakashita, Masayuki Imai, and Hiroshi Noguchi]
通讯作者: and Hiroshi Noguchi
Compartmentalization by confinement in multi-lamellar vesicles
通过多层囊泡的限制进行区室化
DOI: --
发表时间: 2013
期刊:
影响因子: --
作者: [Nguyen Duy Vy, Takuya Iida, ○山口奈美子,関根悠介,関根史織,一條秀憲, Yuuta Moriyama, Ai Sakashita]
通讯作者: Ai Sakashita
球状ベシクルに内包されたべシクルの形状決定機構の解明
阐明球形囊泡中所含囊泡的形状决定机制
DOI: --
发表时间: 2013
期刊:
影响因子: --
作者: [吉川貴康, 田村守, Nguyen Duy Vy, 西田敬亮, 床波志保, 飯田琢也, 守山裕大, 石橋賢, 坂下あい]
通讯作者: 坂下あい
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