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Activity, function and importance of endobiotic bacteria in deep-sea benthic foraminiferal ecology

Activity, function and importance of endobiotic bacteria in deep-sea benthic foraminiferal ecology
深海底栖有孔虫生态中内生细菌的活性、功能和重要性
批准号:
22KF0423
负责人:
野牧 秀隆
金额:
$1.47万
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份:
2023
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2023-03-08 至 2024-03-31

项目摘要

项目成果

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2021年度に検討した蛍光染色手法を用い、各種有孔虫細胞内で顕著にみられた微生物が、有孔虫細胞内のどこに局在しているのかを確認した。特に、特定の微生物が優先している浅部内在性Bulimina subornata、Bulimina subornataと、葉緑体様配列が特徴的に得られた深部内在性のChilostomella ovoideaについて、それぞれの局在の様子を観察した。Chilostomella ovoideaの葉緑体様細胞小器官については、超薄連続切片による3次元構築も行い、これらの葉緑体が最終房室付近に集中して見られることを確かめた。同時に透過型電子顕微鏡観察も行い、FISHによる観察結果とTEMによる共生微生物、細胞小器官との関連性、整合性を確認した。さらに、沖縄の研究協力者とともに有孔虫と共生微生物のゲノム解析を行った。有孔虫および共生微生物や葉緑体のゲノム構築を行い、葉緑体のゲノムが非常に縮退しており、機能もかなり限定的であることが確かめられた。さらに、Bulimina subornata、Uvigerina akitaensis、Bolivina spissaなど房室を分割しやすい有孔虫種について細胞部位ごとの比較トランスクリプトーム解析を行うための試料採取、処理を行い、一部のデータについて解析を開始した。なお、イイネスサロネンは2022年7月から2023年2月まで産育休を取得しており、今年度の実際の研究期間は4か月である。
期刊论文(7)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
DOI: 10.3389/fmars.2021.708716
发表时间: 2021-07-05
期刊: FRONTIERS IN MARINE SCIENCE
影响因子: 3.7
作者: [Harrison, Jesse P., Chronopoulou, Panagiota-Myrsini, Koho, Karoliina A.]
通讯作者: Koho, Karoliina A.
DOI: 10.1111/jeu.12828
发表时间: 2021-01
期刊: The Journal of eukaryotic microbiology
影响因子: --
作者: [Nomaki H, Chen C, Oda K, Tsuchiya M, Tame A, Uematsu K, Isobe N]
通讯作者: Isobe N
Metabarcoding observations on species-specific microbiomes of deep-sea benthic foraminifera
深海底栖有孔虫物种特异性微生物组的元条形码观察
DOI: --
发表时间: 2021
期刊:
影响因子: --
作者: [Salonen I, Chronopoilou PM, Nomaki H, Langlet D, Tsuchiya M, Koho K]
通讯作者: Koho K
サウサンプトン国立海洋研究所(英国)
南安普敦国家海洋实验室(英国)
DOI: --
发表时间:
期刊:
影响因子: --
作者: []
通讯作者:
6
    有孔虫の脱窒メカニズムを理解するための壁孔、液胞のバイオメトリクス
    単細胞生物の複雑性:有孔虫サブシングルセル遺伝子発現と超微細構造解析で迫る
    深海生底生有孔虫細胞内のマイクロバイオームの機能・活性
    嫌気環境における底生有孔虫の生態と代謝
    国内基金
    海外基金
    改性橘子皮-菌藻共生系统耦合处理陆基水产养殖尾水机理研究
    • 批准号:
      JCZRLH202601548
    • 项目类别:
      省市级项目
    • 资助金额:
      --
    • 批准年份:
      2026
    • 负责人:
    • 依托单位:
    基于可重构智能表面的共生无线电关键技术研究
    • 批准号:
      2026JJ50514
    • 项目类别:
      省市级项目
    • 资助金额:
      --
    • 批准年份:
      2026
    • 负责人:
      黄柯文
    • 依托单位:
    肠道共生菌AKK通过外膜囊泡诱导巨噬细胞胞外诱捕网形成促进iRBCs清除的机制研究
    • 批准号:
      JCZRLH202600113
    • 项目类别:
      省市级项目
    • 资助金额:
      --
    • 批准年份:
      2026
    • 负责人:
    • 依托单位:
    基于光谱特征和基因组信息挖掘青风藤共生链霉菌代谢产物及其生物活性研究
    • 批准号:
      2026JJ30124
    • 项目类别:
      省市级项目
    • 资助金额:
      --
    • 批准年份:
      2026
    • 负责人:
      刘建新
    • 依托单位: