有孔虫の脱窒メカニズムを理解するための壁孔、液胞のバイオメトリクス

通过壁孔和液泡的生物测定来了解有孔虫的反硝化机制

基本信息

项目摘要

相模湾深海底から採取した堆積物を深度ごとにサンプリングすることで、有孔虫Bolivina spissaを酸素濃度および硝酸塩濃度の異なる環境(堆積物深度)ごとに分取した。酸素濃度は船上でのマイクロ電極による計測により、硝酸塩濃度は陸上での吸光度分析により定量化し、生息環境データを取得した。採取した有孔虫試料はグルタールアルデヒドを用いて固定し、樹脂包埋、金属染色後にマイクロフォーカスX線CTを用いた内部微細構造解析を行った。得られたデータを3次元画像構築・解析ソフトを用いて解析し、環境間・種間で硝酸塩を貯める液胞の大きさ(表面積、体積)や数に違いがみられるかを検討した。生息環境における硝酸塩濃度の違いと液胞の表面積、体積、個数には明確な関連が見られなかった一方で、房室ごとの液胞サイズには、初室側、最終室側、中間部で一貫したパターンが見られた。このことはそれぞれの房室において液胞の役割や活性が異なっていることを示す。さらに、Cryo-SEM-EDSを用いて硝酸塩に由来する窒素が液胞にどのように含まれているかを解析したところ、特定の部位に集中している様子が見られた。この構造を詳細に観察すると、サイズや細胞内での配置などから、一部は液胞であることが推察された。しかし、すべての液胞に窒素が濃集している様子は見られず、すべての液胞が硝酸塩を濃集しているわけではないことがわかった。このことが、生息環境と液胞サイズ、数との間に明確な関連がみられなかったことの原因になっている可能性が高い。
Phase mode bay abyssal か ら take し た debris を depth ご と に サ ン プ リ ン グ す る こ と で, foraminifera Bolivina spissa を acid levels お よ び の different nitric acid salt concentration な る environment (deposit depth) ご と に divide し た. Acid levels は ship で の マ イ ク ロ electrode に よ る measuring に よ り, concentration of nitric acid salt は onshore で の absorbance analysis に よ り quantitative し, habitats デ ー タ を obtain し た. Take し た foraminifera sample は グ ル タ ー ル ア ル デ ヒ ド を with い て fixed し dye, resin embedding, metal に マ イ ク ロ フ ォ ー カ ス X-ray CT を with い た internal fine structure parsing line を っ た. Have ら れ た デ ー タ を 3 dimensional portrait building, parsing ソ フ ト を with い て parsing し, environment, a kind of で nitric acid salt を storage め る vacuole の big き さ number (surface area, volume) や に violations い が み ら れ る か を beg し 検 た. Habitats に お け る nitric acid salt concentration の violations い と vacuole の surface area, volume, number of に は clear な masato even see が ら れ な か っ た で, atrioventricular ご と の vacuole サ イ ズ に は, early room side, final chamber side, middle で consistently し た パ タ ー ン が see ら れ た. こ の こ と は そ れ ぞ れ の atrioventricular に お い て vacuole cut や の service activity が different な っ て い る こ と を す. さ ら に, then SEM EDS を with い て nitric acid salt に origin す る smothering element が vacuole に ど の よ う に containing ま れ て い る か を parsing し た と こ ろ, specific part の に concentrated し て い る others see son が ら れ た. こ の tectonic を detailed に 観 examine す る と, サ イ ズ や intracellular で の configuration な ど か ら, a は vacuole で あ る こ と が push examine さ れ た. し か し, す べ て の vacuole に smothering element concentration し が て い る others see son は ら れ ず, す べ て の vacuole が nitric acid salt concentration し を て い る わ け で は な い こ と が わ か っ た. こ の こ と が, habitats と vacuole サ イ ズ, several と の に clear between な masato even が み ら れ な か っ た こ と の reason に な っ て い が high い る possibilities.

项目成果

期刊论文数量(4)
专著数量(0)
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专利数量(0)
Foraminifera and plastic pollution: Knowledge gaps and research opportunities
有孔虫和塑料污染:知识差距和研究机会
  • DOI:
    10.1016/j.envpol.2023.121365
  • 发表时间:
    2023
  • 期刊:
  • 影响因子:
    8.9
  • 作者:
    Bouchet Vincent M.P.;Seuront Laurent;Tsujimoto Akira;Richirt Julien;Frontalini Fabrizio;Tsuchiya Masashi;Matsuba Misako;Nomaki Hidetaka
  • 通讯作者:
    Nomaki Hidetaka
Vacuole pattern in Foraminifera: new insight about their metabolic adaptation to low oxygen environments
有孔虫的液泡模式:关于其代谢适应低氧环境的新见解
  • DOI:
  • 发表时间:
    2023
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Julien Richirt;Takuya Matsuzaki;Yoshiyuki Ishitani;Akihiro Tame;Kaya Oda and Hidetaka Nomaki
  • 通讯作者:
    Kaya Oda and Hidetaka Nomaki
ハンブルグ大学(ドイツ)
汉堡大学(德国)
  • DOI:
  • 发表时间:
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
  • 通讯作者:
サウサンプトン国立海洋研究所(英国)
南安普敦国家海洋实验室(英国)
  • DOI:
  • 发表时间:
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    0
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野牧 秀隆其他文献

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    野牧 秀隆
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  • 发表时间:
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  • 作者:
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  • 通讯作者:
    野牧 秀隆
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  • 发表时间:
    2022
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    小林 香苗;眞壁 明子;中島 悠;平岡 聡史;宮崎 征行;津田 美和子;澄田 智美;野牧 秀隆;布浦 拓郎;川口 慎介;藤田盛久
  • 通讯作者:
    藤田盛久
Formation of sheet convection and helical current coils in geodynamo simulation with low Ekman number
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  • DOI:
  • 发表时间:
    2009
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    並木則行;杉田精司;石原吉明;野田寛大;佐々木晶;岩田隆浩;花田英夫;荒木博士;黒澤耕介;松村瑞秀;横山聖典;鎌田俊一;久保公央;森朝子;佐藤麻里;野牧 秀隆;宮腰剛広
  • 通讯作者:
    宮腰剛広

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Activity, function and importance of endobiotic bacteria in deep-sea benthic foraminiferal ecology
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  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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单细胞生物的复杂性:有孔虫亚单细胞基因表达和超微结构分析
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嫌気環境における底生有孔虫の生態と代謝
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  • 批准号:
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  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for JSPS Fellows
現場培養実験とバイオマーカー分析を用いた底生有孔虫による有機物変質過程の解明
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甘蓝型油菜一液胞铁转运蛋白基因(BnVIT-L2)参与铁胁迫下植物侧根发育的分子机制
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    2024
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内质网吞噬在含布鲁氏菌液泡功能转换中的作用
  • 批准号:
    10793320
  • 财政年份:
    2022
  • 资助金额:
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  • 项目类别:
Transport mechanism of S-adenosyl-L-methionine into vacuole, elucidation of its physiological function and development of its application
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  • 批准号:
    22H02260
  • 财政年份:
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  • 资助金额:
    $ 1.47万
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The malaria digestive vacuole: its role in parasite development
疟疾消化液泡:其在寄生虫发育中的作用
  • 批准号:
    RGPIN-2020-04910
  • 财政年份:
    2022
  • 资助金额:
    $ 1.47万
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    Discovery Grants Program - Individual
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