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単細胞生物の複雑性:有孔虫サブシングルセル遺伝子発現と超微細構造解析で迫る

単細胞生物の複雑性:有孔虫サブシングルセル遺伝子発現と超微細構造解析で迫る
单细胞生物的复杂性:有孔虫亚单细胞基因表达和超微结构分析
批准号:
21H01202
负责人:
野牧 秀隆
金额:
$9.07万
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
财政年份:
2021
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2021-04-01 至 2024-03-31

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项目成果

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相模湾深海底の水深700-1500mの範囲で採取、固定したRNA解析用有孔虫4種、およびX線CT、透過型電子顕微鏡(TEM)観察用有孔虫11種の深海性有孔虫個体を用いた解析を行った。RNAseq解析については、相模湾を含めた複数の深海域で追加の試料採取、固定を行い、解析に用いた。X線CT観察では、グルタール固定した底生有孔虫をオスミウムで導電染色し、X線吸収率を高めたうえでレジン樹脂に包埋し、Zeiss Xradia Versa410を用いてX線CT観察を行った。X線CT観察では判別できない、オスミウム導電染色されにくい構造や、数マイクロメートル以下のサイズの細胞小器官(ミトコンドリア、ペルオキシソーム、小胞体など多くの構造が該当)については、TEM観察を行うことで、房室ごとの細胞小器官分布パターンについて観察した。これらをもとに初室から最終房室までの細胞小器官の分布を解明した結果、有孔虫の種類により、その細胞小器官の分布に違いがあることを明らかにした。特に、最終房室側2-3房室で環境とのやり取りをしていることが示唆された。さらに、細胞小器官の分布の違いから推測される房室ごとの機能の違いを、微量遺伝子発現解析および付随する遺伝子発現情報解析により明らかにするための、手法確認をおこなった。まずは大型の有孔虫であるXenophyophore(ゼノフィオフォア)を用いた遺伝子発現解析を行い、有孔虫においてもその手法が有効であることを確認した。
期刊论文(10)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
DOI: 10.3389/fmars.2022.1034950
发表时间: 2022-10
期刊:
影响因子: --
作者: [T. Ikuta;Akihiro Tame;Tomoko Takahashi;H. Nomaki;R. Nakajima]
通讯作者: T. Ikuta;Akihiro Tame;Tomoko Takahashi;H. Nomaki;R. Nakajima
DOI: 10.1186/s40645-022-00515-1
发表时间: 2022
期刊: Progress in Earth and Planetary Science
影响因子: 3.9
作者: [Wakita Masahide, Watanabe Shuichi, Yoshino Jun, Oguri Kazumasa, Nomaki Hidetaka, Kawagucci Shinsuke, Ariyoshi Keisuke, Nagano Akira, Fujikura Katsunori]
通讯作者: Fujikura Katsunori
ウッズホール海洋学研究所(米国)
伍兹霍尔海洋研究所(美国)
DOI: --
发表时间:
期刊:
影响因子: --
作者: []
通讯作者:
Foraminifera and plastic pollution: Knowledge gaps and research opportunities
有孔虫和塑料污染:知识差距和研究机会
DOI: 10.1016/j.envpol.2023.121365
发表时间: 2023
期刊: Environmental Pollution
影响因子: 8.9
作者: [Bouchet Vincent M.P., Seuront Laurent, Tsujimoto Akira, Richirt Julien, Frontalini Fabrizio, Tsuchiya Masashi, Matsuba Misako, Nomaki Hidetaka]
通讯作者: Nomaki Hidetaka
8
    有孔虫の脱窒メカニズムを理解するための壁孔、液胞のバイオメトリクス
    Activity, function and importance of endobiotic bacteria in deep-sea benthic foraminiferal ecology
    深海生底生有孔虫細胞内のマイクロバイオームの機能・活性
    嫌気環境における底生有孔虫の生態と代謝
    海外基金