权益分类	功能权益	普通用户	{{item.name}}会员
{{category.name}}	{{benefitItem.name}}

Genetic basis of allopatric differentiation in the seas around Japan: population genomics based on multiple hybridization zones

日本周边海域异源分化的遗传基础：基于多个杂交区的群体基因组学

基本信息

批准号：
22KJ0876
负责人：
加藤柊也
金额：
$ 1.09万
依托单位：
The University of Tokyo
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份：
2023
资助国家：
日本
起止时间：
2023-03-08 至 2024-03-31
项目状态：
已结题

项目摘要

海洋は物流的障壁に乏しいにもかかわらず、過去の隔離により異所的な分化を遂げた海洋生物が現在でも多く維持されている。本研究では、こうした異所的分化を維持するゲノム基盤を探索するために、分化した系統間の交雑が複数回生じたアゴハゼを対象とした集団ゲノミクス解析を行っている。本年度は、瀬戸内海沿岸に形成されたアゴハゼ日本海系統と太平洋系統の交雑帯について網羅的なサンプリングを行い、当該サンプル200個体以上のlow coverage全ゲノムリシーケンスを行った。その結果、山口県宇部市周辺から防府市にかけて急峻な交雑クラインが形成されていること、各集団はわずか10km単位の距離で互いに遺伝的に分化していることが判明した。現在、この交雑帯サンプルについてクライン解析を行うことで、系統間の融合が妨げられている領域を全ゲノムレベルで探索している。また、アゴハゼ第3の種内系統である東シナ海系統についてもゲノム解析を進めた。デモグラフィックモデリング解析の結果、太平洋系統から古くに分岐した絶滅系統が日本海系統と十万年以上前に交雑したことで東シナ海系統が形成されたというシナリオが支持された。この東シナ海系統において絶滅系統が受け継がれた領域と受け継がれなかった領域(introgression landscape)の特徴を観察したところ、絶滅系統が受け継がれなかったゲノム領域は機能的に重要な領域や低組み換え領域に富んでいるなどの特徴が判明した。これらの結果は、絶滅系統の遺伝子浸透を防いだ選択圧が存在したことを示唆している。さらに、本年度にはアゴハゼの飼育下での人工繁殖に成功し、初めての系統間交配にも成功した。したがって、交雑帯・古代の交雑に起因する東シナ海系統・人工交配といった様々なスケールでの交雑研究をアゴハゼについて展開する基盤を本年度に整えることができたと考えている。

The barrier of ocean logistics has been reduced, and the isolation of the past and the differentiation of different places have led to the maintenance of marine life. The purpose of this study is to maintain the basic structure of different places and to explore the differentiation of different places. Inter-system communication and plural rebirth of the system. This year, the Japan Sea System and the Pacific Ocean System are formed along the coast of the Seto Inland Sea. The Nasukuru that I have collected in the Snare should be low if there are more than 200 Nasaru Coverage is full of ゲノムリシーケンスを行った.そのRESULTS, Yamaguchi Prefecture Ube City Zhoubei からFangfu City にかけて久久な交雑クラインが Formation されていること, each episode is based on the distance of 10km and the difference between each other is clear. Now, この交曑帯サンプルについてクラインanalytic を行うことで, system The fusion between the system and the field is the whole field of exploration.また, アゴハゼThe 3rd species within the system である东シナ海System についてもゲノムanalytic を入めた. The results of the analysis of the デモグラフィックモデリング, the Pacific system, the ancient system, the extinction system, the Japan Sea system The system was formed more than 100,000 years ago and was supported by the Toshiro Sea System.この东シナ海System においてExtinction System がReceive け継がれた Domain Received け継がれなかった Domain (introgression landscape)の特徴を観看したところ、Extinction System がけ継がれなかったゲノThe important function of the field is the low group, the field is rich, and the special field is clear. The result of the system is the result of the extinction system.さらに, this year's にはアゴハゼの breeding, でのartificial breeding was successful, and the first めての inter-system mating was successful.したがって, 交雑帯・Ancient の交雑に origin する东シナ海System・Artificial mating といった様々なスケールでの交曑研究をアゴハゼについてDevelopmentするbaseをThis year's full えることができたとtest えている.