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蛋白質のフォールディング機構相転移の網羅的探索とその物理的駆動力の解明

全面探索蛋白质折叠机制的相变并阐明其物理驱动力

基本信息

批准号：
22KJ1597
负责人：
森祐二郎
金额：
$ 1.6万
依托单位：
Nagoya University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份：
2023
资助国家：
日本
起止时间：
2023-03-08 至 2025-03-31
项目状态：
未结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-22KJ1597/
关键词：
蛋白質フォールディング

项目摘要

Staphylococcal nucleaseの構造形成機構は、リガンドであるアデノシン-3',5'-二リン酸、変性剤である尿素の濃度に依存して切り替わる。本研究の目的は、i)自発的フォールディングからリガンド結合によるフォールディングへと構造形成機構が切り替わる溶媒条件(アデノシン-3',5'-二リン酸、尿素濃度)をフォールディングの速度論の分光的測定に網羅的に探索することと、切り替わり周辺の溶媒条件下における反応に関わる分子種の安定性と構造に基づき、核磁気共鳴(NMR)法と変異体解析を用いることで、ii)各機構の構造形成に本質的な物理的駆動力を明らかにすることにある。さまざまな尿素濃度、アデノシン-3',5'-二リン酸濃度においてォールディングの速度論の分光的測定を行い、Staphylococcal nucleaseのフォールディング機構の切り替わる溶媒条件を網羅的、俯瞰的に見出した。その際、野生型、及び同位体ラベルしたStaphylococcal nucleaseの発現精製を行った。また2022年度後半より、学振の若手研究者海外挑戦プログラムにより、米国Fox chase cancer centerにて、本研究課題の一部を行った。続けて当研究機関で実時間NMR法を用いて、フォールディング機構が切り替わる溶媒条件周辺においてフォールディングの速度論測定を行い、変性状態から天然状態に至るまでのリガンド結合と構造変化をアミノ酸残基レベルで解明する。これらの研究成果の一部を、日本生物物理学会にて報告した。

Staphylococcal nuclease's structure-forming mechanism, リガンドであるアデノシン-3',5'-bisamine acid, であるurea's concentration-dependent してcutting わる. The purpose of this study is: i) The combination of self-made フォールディングからリガンドるフォールディングへとstructure forming mechanism がcutり Alternative わるsolvent conditions (アデノシ Determination of ン-3',5'-diuronic acid, urea concentration) をフォールディングのspeed theory and spectroscopyにNET's にExploration することと, Cut the り substitute わりweek 辺のsolvent conditions における Reflection に关わる分The stability and structure of the seed, the basis of the structure, and the use of nuclear magnetic resonance (NMR) method and analysis of the isomersで, ii) The structure of each mechanism forms the essential physical power and driving force. Staphylococcal urea concentration, Staphylococcal urea concentration, Staphylococcal nuclease のフォールディング Mechanism の cut り substitute わる solvent condition を net, overlooking に见出した. Staphylococcal nuclease その记, wild type, and びisotope ラベルしたStaphylococcal nuclease are now refined を行った.またThe second half of 2022, Gakushin's researchers overseas challenge プログラムにより, the American Fox chase cancer center にて, this research topic's first part を行った.続けてWhen the research institute's time NMR method is used, the フォールディング institution is cut and replaced with solvent conditions and the solvent conditions are used. The velocity theory determines the movement of the molecule, the natural state of the morphological state, and the るまでのリガンド binding and structural modification of the をアミノ acid residue レベルで clarification of the るまでのリガンド combination. The first part of the research results of Japan Biophysical Society, and the report of Japan Biophysical Society.