蛋白質のフォールディング機構相転移の網羅的探索とその物理的駆動力の解明

全面探索蛋白质折叠机制的相变并阐明其物理驱动力

• 批准号: 22KJ1597
• 负责人: 森 祐二郎
• 金额: $ 1.6万
• 依托单位: Nagoya University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for JSPS Fellows
• 财政年份: 2023
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2023-03-08 至 2025-03-31
• 项目状态: 未结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-22KJ1597/
• 关键词: 蛋白質フォールディング

Staphylococcal nucleaseの構造形成機構は、リガンドであるアデノシン-3',5'-二リン酸、変性剤である尿素の濃度に依存して切り替わる。本研究の目的は、i)自発的フォールディングからリガンド結合によるフォールディングへと構造形成機構が切り替わる溶媒条件(アデノシ ン-3',5'-二リン酸、尿素濃度)をフォールディングの速度論の分光的測定に網羅的に探索することと、切り替わり周辺の溶媒条件下における反応に関わる分子種の安定性と構造に基づき、核磁気共鳴(NMR)法と変異体解析を用いることで、ii)各機構の構造形成に本質的な物理的駆動力を明らかにすることにある。さまざまな尿素濃度、アデノシン-3',5'-二リン酸濃度においてォールディングの速度論の分光的測定を行い、Staphylococcal nucleaseのフォールディング機構の切り替わる溶媒条件を網羅的、俯瞰的に見出した。その際、野生型、及び同位体ラベルしたStaphylococcal nucleaseの発現精製を行った。また2022年度後半より、学振の若手研究者海外挑戦プログラムにより、米国Fox chase cancer centerにて、本研究課題の一部を行った。続けて当研究機関で実時間NMR法を用いて、フォールディング機構が切り替わる溶媒条件周辺においてフォールディングの速度論測定を行い、変性状態から天然状態に至るまでのリガンド結合と構造変化をアミノ酸残基レベルで解明する。これらの研究成果の一部を、日本生物物理学会にて報告した。

Staphylococcal nuclease の は, structure formation リ ガ ン ド で あ る ア デ ノ シ ン - 3 ', 5 '- two リ ン acid, - tonic で あ に の る urea concentration dependent し て り cutting for わ る. は の purpose, this study I) from 発 フ ォ ー ル デ ィ ン グ か ら リ ガ ン ド combining に よ る フ ォ ー ル デ ィ ン グ へ と institutions が り cutting structure formation for わ る solvent condition (ア デ ノ シ ン - 3 ', 5 '- two リ ン acid, urea concentration) を フ ォ ー ル デ ィ ン グ の の spectral measurement speed theory に snare に explore す る こ と と, cut り for わ り weeks 辺 の solvent condition に お け る anti 応 に masato わ る molecules of の stability と tectonic に basis づ き, imaging 気 resonance (NMR) method と - analytical を variants with い る こ と で, ii) の agencies The 駆 dynamic を light that constructs the な physics that forms the に essence ら にする にする とにある とにある. さ ま ざ ま な urea concentration, ア デ ノ シ ン - 3 ', 5 '- two リ ン acid concentration に お い て ォ ー ル デ ィ ン グ の speed theory の spectral line measuring を い, Staphylococcal nuclease の フ ォ ー ル デ ィ ン グ institutions の り cutting for わ る を snare solvent conditions, overlooking に see し た. Youdaoplaceholder0 そ international, wild-type, and び allotrope ラベ た たStaphylococcal nuclease <s:1> shows refined を behavior った. Youdaoplaceholder0 Second half of 2022 よ よ, overseas battle of researcher Hsueh Zhen, プログラムによ, Fox chase cancer center, にて, research project of this study また first division を った. 続 け て when the machine masato で be time を NMR method using い て, フ ォ ー ル デ ィ ン グ institutions for わ が cut り る solvent condition weeks 辺 に お い て フ ォ ー ル デ ィ ン グ の theory of speed measurement line を い, - state か ら に natural state to る ま で の リ ガ ン ド combining と structure - the を ア ミ ノ acid residues レ ベ ル で interpret す る. Youdaoplaceholder6 れら <s:1> research results <e:1> one を, report of the Japanese biophysical society にて た.

项目成果

How to shift the mechanisms from spontaneous folding to ligand-induced folding of staphylococcal nuclease?

如何将葡萄球菌核酸酶的机制从自发折叠转变为配体诱导折叠？

• 发表时间: 2022
• 作者: 森 祐二郎;鈴木 一成;深澤 進伍;槇 亙介
• 通讯作者: 槇 亙介