Morphologische und biomechanische Charakterisierung viraler RNA-Protein-Transportkomplexe

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Die Untersuchung des Rev-abhängigen RNA-Exportes von HIV-1 hat zur Identifizierung des Exportrezeptors Crm-1 und zur Aufklärung eines spezifischen RNA-Exportweges geführt. Andere Retroviren tragen konstitutive RNA-Exportelemente (CTE), die ebenfalls zum Kernexport inkomplett gespleißter RNA führen. Wir haben ein posttranskriptionelles RNA-Element bei einem Retrovirus der Maus (IAP) gefunden, das für Expression der IAP-Proteine notwendig ist und Rev-unabhängige Expression HIV-abgeleiteter RNA vermittelt. Neben dem Einfluß auf RNA-Export wird Akkumulation größerer RNA-Mengen sowie ein Einfluß auf Spleißing beobachtet. Damit weist das Element funktionelle Analogien mit dem post-transkriptionellen Regulator von Hepatitis B Virus (PRE) und verwandten Elementen zellulärer RNAs auf. In der nächsten Antragsperiode soll die funktionelle Charakterisierung des IAP-Elementes im Vergleich zu Rev/RRE, CTE und PRE fortgesetzt und die relative Bedeutung von RNA-Stabilisierung, Spleißinhibition und Kernexport ermittelt werden. Insbesondere soll der Einfluß von Introns in verschiedenen Bereichen der RNA untersucht werden. Daneben soll die Bindung bekannter und neu identifizierter RNA-Bindungsproteine vergleichend analysiert und die Funktion dieser Proteine für IAP-Element vermittelte Genexpression untersucht werden.