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トランスポゾンのもつ新しい型の部位特異的組換え系

一种使用转座子的新型位点特异性重组系统

基本信息

批准号：
02640494
负责人：
津田雅孝
金额：
--
依托单位：
Yamaguchi University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for General Scientific Research (C)
财政年份：
1990
资助国家：
日本
起止时间：
1990 至无数据
项目状态：
已结题

项目摘要

原核生物のトランスポゾンTn1721,Tn4653,Tn4655,Tn4656は、転移反応の前期段階である融合体形成反応に完全な機能的互換性を持つが、後期段階である融合体解離反応の機能並びに転移非関連遺伝子群の構造に多様性を示す。本研究では、これらの4種のトランスポゾン(Tn)について、解離反応に関わる部位特異的組換え系を解析するとともに、各々の部位特異的組換え系がTnの内部構造の多型性に果たす役割を検討した。部位特異的組み込み活性をも持つTn4655の解離酵素TnpRは、その塩基配列の決定から、溶原性ファ-ジがコ-ドする部位特異的組み込み酵素のアミノ酸配列と高い相同性を示し、Tnとファ-ジの間で進化的に部位特異的組換え酵素遺伝子の交換があったことが示された。また、Tn4653の融合体解離に必要な2つの遺伝子産物をコ-ドする領域の塩基配列の決定から、これら2種の遺伝子産物は既知の部位特異的組換え酵素と何ら相同性を示さず、Tn4653の解離系は全く新しい型の部位特異的組換え系であると結論された。トルエン代謝遺伝子を担うTn4656のTnpRは自身の融合体のみを解離するのに対し、薬剤耐性遺伝子を担うTn1721のTnpRは自身の融合体及びTn4656の融合体の両者を解離する。両Tnの解離に関わる領域とその周辺領域の塩基配列の決定・比較から(1)融合・解離に関わる領域の塩基配列は極めて相同性が高く、アミノ酸残基数が同じであった両TnpRでは10残基のみが異なり、解離にcisに必要な区域res内の組換え部位に隣接した6塩基に置換があること、また、(2)resを境界にして相同性が消失することを見いだした。これらの知見から、(a)各々のTnpR間で異なるアミノ酸残基の1つまたは複数がresの認識或いは組換え活性を規定し、res内で異なった塩基の1つまたは複数がTnpRのこのような機能の標的になること、また、(b)Tn内の転移非関連遺伝子群の多型化に融合体解離系が直接関与することが示唆された。

Prokaryotes include Tn1721,Tn4653,Tn 4655,Tn 4656, Tn1721, Tn 4653, Tn 4655, Tn4656, Tn 1721, Tn 4653, Tn 4655, Tn 4656, Tn 4657, Tn 4657, Tn 4658, Tn 4659, T In this study, we analyzed the site-specific component systems of four kinds of structural diversity (Tn), including the structural diversity of Tn and the structural diversity of Tn. site-specific component activity of Tn4655 dissociative enzyme TnpR is determined by nucleotide alignment, lysogenicity, and site-specific component activity of TnpR is determined by nucleotide alignment. site-specific component activity of TnpR is determined by nucleotide exchange. 2. The determination of the base alignment of the domain of Tn4653 fusion product is necessary for the dissociation of Tn4653 fusion product. The identity of the 2 fusion product to the known site-specific enzyme is shown. The dissociation system of Tn4653 is completely novel and site-specific. The metabolic gene TnpR is responsible for the dissociation of its own fusion and the resistant gene TnpR is responsible for the dissociation of its own fusion and the Tn4656 fusion. The determination of base alignment in the domain of Tn dissociation and its peripheral domain is compared with the determination of base alignment in the domain of Tn dissociation and its peripheral domain. The identity of base alignment in the domain of Tn dissociation and its peripheral domain is high, and the identity of base alignment in the domain of Tn dissociation and its peripheral domain is high. The identity of base alignment in the domain of Tn pR and its peripheral domain is high. The identity of base alignment in the domain of Tn dissociation and its peripheral domain is high. (a) the recognition or conversion activity of the plurality of residues in the TnpRs is specified;(b) the dissociation system of the polymorphic fusion of the unrelated residues in the Tn is directly related;