オニドコロ自然集団における種内変異と地理的文化に関する分子集団遺伝学的研究

Onidokoro自然群体种内变异与地理文化的分子群体遗传学研究

• 批准号: 05740521
• 负责人: 寺内 良平
• 金额: $ 0.58万
• 依托单位: Kyoto University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
• 财政年份: 1993
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 1993 至 无数据
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-05740521/
• 关键词: 分子集団遺伝学; オニドコロ; マイクロサテライト; DNAフィンガープリント; 血縁判定; 遺伝子流動; 野生植物

オニドコロ自然集団におけるDNA変異の分子集団遺伝学的研究の一環として、当該年度は集団内の個体間の遺伝的関係・遺伝子流動を解析するためにマイクロサテライト変異の分析をおこなった。真核生物のゲノム中で2から6塩基の短かいDNAモチーフが直列に反復した配列をマイクロサテライトと呼ぶ。マイクロサテライトはDNAポリメラーゼのスリッページがおこりやすく、反復回数は高度に多型的である。この多型的な領域をPCR法により増幅し、産物の長さの変異を検出して集団解析に用いる方法がマイクロサテライト分析である。オニドコロゲノムライブラリーをM13ファージを用いて作成し、(CA)_8,(GT)_8,(GA)_8の3種のオリゴマクレオチドをプローブとしたスクリーニングをおこなった。計4000個の組換元クローンの内80個がスクリーニングで陽性となったので、これらを単離し、うち21クローンの塩基配列を決定した。この中でマイクロサテライトを含む8クローンについて、PCRプライマーを合成した。近畿地方より採集したオニドコロ23個体について上記8つのマイクロサテライトをPCR法により増幅し、電気泳動により増幅産物の長さを調査したところ、7つのマイクロサテライト座が高度に多型的で、平均して座あたり6.2対立遺伝子、0.68の平均ヘテロザイゴシテイをもつことがわかった。7座位を通してみると、23個体で同じ遺伝子型の組を持つ個体は無く、この方法により“DNAフィンガープリント"が可能であることも示された。母親と子どもの遺伝子型が判っている時に父親を識別する能力も7座位で98%となり今後花粉を通じた遺伝子流動の研究に威力を発揮すると考える。

A study of DNA diversity in natural populations is conducted during the current year to analyze inter-individual genetic relationships and gene flows in populations. Eukaryotic organisms have two or six short DNA sequences that repeat in series. The number of DNA fragments is higher than the number of DNA fragments. The polytype domain PCR method increases the amplitude, the product length and the difference are detected, and the cluster analysis method is used. 3 kinds of options of (CA)_8,(GT)_8,(GA)_8,(GA)_9,(CA)_8,(GA)_9,(GA)_9 80 out of 4000 components are selected for positive, negative, negative and negative base alignment. This is a combination of 8 and PCR. Recently, 23 individuals were collected and 8 individuals were recorded. PCR method was used to investigate the length of amplitude-increasing products. Electrophoresis was used to investigate the length of amplitude-increasing products. The average length of amplitude-increasing products was 6.2. The average length of amplitude-increasing products was 0.68. 7 seats, 23 individuals, the same genetic type group, individual, no, no The ability to identify fathers at the time of identification of maternal offspring was 98% and the ability to develop future pollen flow was examined.