連関解析を利用したイネいもち病菌抵抗性関連遺伝子の単離

利用关联分析分离稻瘟病抗性相关基因

• 批准号: 10F00214
• 负责人: 寺内 良平
• 金额: $ 1.22万
• 依托单位: Iwate Biotechnology Research Center
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for JSPS Fellows
• 财政年份: 2010
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2010 至 2012
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-10F00214/
• 关键词: 遺伝学; ゲノム; 植物; 進化; 育種学; 植物病理; いもち病

1.イネもみ枯れ細菌病は、近年、水稲栽培において大きな問題となっている。そこで、イネもみ枯れ細菌病菌をイネに感染する実験系を確立した。さらに、イネもみ枯れ細菌病のIII型分泌システムを利用して、外来タンパク質をイネに導入する実験系を確立した。2.イネ品種20系統にイネもみ枯れ細菌病を接種し、感受性について差を示す系統を選抜した。品種「ひとめぼれ」はイネもみ枯れ細菌病に高度の抵抗性を示すのに対し、外国イネに感受性の高い品種を見いだした。そこで、「ひとめぼれ」と外国イネ間で交配後育成したRecomibinant Inbred Lines(RILs)を用いて、イネもみ枯れ細菌病抵抗性遺伝子の座上位置を同定するために、QTL解析を開始した。有用なQTLが同定できた場合には、直接品種母本として活用する。3.「ひとめぼれ」矮性変異体をインド稲と交配し、F2を得た。これらの分離個体を用いて、原因遺伝子のマッピングを進め、200Kb未満の領域に絞り込んだ。現在、突然変異体の全ゲノム解析により、候補SNPを同定し、原因遺伝子候補を同定する作業を進めている。候補遺伝子が同定できた場合には、相補性試験を実施し、原因遺伝子を単離する。さらに遺伝子機能について解析する。

1. <s:1> ネ み み bacterial diseases れ, recent years, water rice cultivation にお て て major <s:1> な problems となって る る. そ こ で, イ ネ も み withered れ bacterial pathogens を イ ネ に infection す る be を 験 department establish し た. さ ら に, イ ネ も み withered れ bacterial disease の type III secretion シ ス テ ム を using し て, foreign タ ン パ ク qualitative を イ ネ に import す る be を 験 department establish し た. 2. イ ネ 20 varieties system に イ ネ も み withered れ bacterial disease を vaccination し, sensibility に つ い て difference を shown す system を choose sorting し た. Variety "ひ と め ぼ れ" は イ ネ も み withered れ に highly の bacterial disease resistance を shown す の に し seaborne, foreign イ ネ に susceptibility の high い variety を see い だ し た. そ こ で, "ひ と め ぼ れ" と foreign イ ネ で mating between after incubation し た Recomibinant Inbred Lines (RILs) を い て, イ ネ も み withered れ bacterial disease resistance heritage 伝 の seat location を with fixed す る た め に, QTL analytic を began し た. In situations where なQTLが is used in conjunction with で で た た, に する is used, and the parent plant of direct varieties と て is flexibly utilized in する. 3. The dwarf variant of "ひとめぼれ" を と ド ド ド rice と mates <s:1> and F2を to た. を こ れ ら の separated one with い て, reason but 伝 の マ ッ ピ ン グ を め, 200 KB not against に の field ground り 込 ん だ. Now, all of a sudden - variant の full ゲ ノ ム parsing に よ り, alternate with the SNP を し, heritage 伝 son alternate を be す る homework を into め て い る. Alternate heritage 伝 が son be で き た occasions に は, phase fill test を be cause of し, but 伝 を 単 from す る. Youdaoplaceholder0 伝 subfunction に て て analysis する.