連関解析を利用したイネいもち病菌抵抗性関連遺伝子の単離

利用关联分析分离稻瘟病抗性相关基因

• 批准号: 10F00214
• 负责人: 寺内 良平
• 金额: $ 1.22万
• 依托单位: Iwate Biotechnology Research Center
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for JSPS Fellows
• 财政年份: 2010
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2010 至 2012
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-10F00214/
• 关键词: 遺伝学; ゲノム; 植物; 進化; 育種学; 植物病理; いもち病

1.イネもみ枯れ細菌病は、近年、水稲栽培において大きな問題となっている。そこで、イネもみ枯れ細菌病菌をイネに感染する実験系を確立した。さらに、イネもみ枯れ細菌病のIII型分泌システムを利用して、外来タンパク質をイネに導入する実験系を確立した。2.イネ品種20系統にイネもみ枯れ細菌病を接種し、感受性について差を示す系統を選抜した。品種「ひとめぼれ」はイネもみ枯れ細菌病に高度の抵抗性を示すのに対し、外国イネに感受性の高い品種を見いだした。そこで、「ひとめぼれ」と外国イネ間で交配後育成したRecomibinant Inbred Lines(RILs)を用いて、イネもみ枯れ細菌病抵抗性遺伝子の座上位置を同定するために、QTL解析を開始した。有用なQTLが同定できた場合には、直接品種母本として活用する。3.「ひとめぼれ」矮性変異体をインド稲と交配し、F2を得た。これらの分離個体を用いて、原因遺伝子のマッピングを進め、200Kb未満の領域に絞り込んだ。現在、突然変異体の全ゲノム解析により、候補SNPを同定し、原因遺伝子候補を同定する作業を進めている。候補遺伝子が同定できた場合には、相補性試験を実施し、原因遺伝子を単離する。さらに遺伝子機能について解析する。

1. In recent years, there have been many problems in the cultivation of rice. The infection system is established when bacteria are produced. The system of using and introducing foreign substances into the secretion system of bacterial diseases was established. 2. The selection of 20 systems for bacterial disease inoculation and susceptibility The variety " Therefore, QTL analysis will begin when Recomibinant Inbred Lines(RILs) bred after mating in "" and foreign rice plants are used and the seat positions of rice plants that are resistant to bacterial diseases are determined. QTL can be used in the same situation as the direct variety. 3. The short sex of the male and female is very different. The separation of individuals, reasons, and the field of 200Kb. Now, suddenly, all the candidate SNPs are analyzed, and the candidate SNPs are determined. The candidate information is consistent with the situation, complementary to the test, the reason for the separation of information. This is the first time that a child has been identified.