イネ直播適性に関わる遺伝子の同定と利用

水稻直播适播相关基因的鉴定及利用

基本信息

  • 批准号:
    12F02212
  • 负责人:
  • 金额:
    $ 1.47万
  • 依托单位:
  • 依托单位国家:
    日本
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for JSPS Fellows
  • 财政年份:
    2012
  • 资助国家:
    日本
  • 起止时间:
    2012 至 2013
  • 项目状态:
    已结题

项目摘要

申請者らの研究グループでは、東北地方の水稲栽培の省力化を目標とした研究を実施している。この目的のために、申請者らは、東北日本で重要なイネ品種「ひとめぼれ」を材料として、2種類の集団を作成した : (1)大規模EMS突然変異集団、(2)大規模組換え近交系(Recombinant Inbred Lines : RILs)。Fekih Ep Laribi Rym博士は、これらを利用して、直播適性に関わる遺伝子群の同定を目標に研究を開始した。後者の材料のQTL解析から、直播適性に関わる低温発芽性QTLの位置同定に至った。さらにFekih博士は、突然変異体の原因遺伝子を迅速に同定する手法として、MutMap+法の開発に成功した(Fekihら、PLoS One 2013)。MutMap+法は、既報のMutMap法(Abeら, Nature Biotech. 2012)を改良して、突然変異体と野生型親系統の交配由来のF2を材料として、突然変異形質を示す子孫のバルクDNAと野生型形質を示す子孫のバルクDNAの双方の全ゲノムシーケンスを実施して、互いにSNP分布を比較することにより、迅速に原因遺伝子を同定する技術である。MutMap+法を突然変異系統M3世代の集団に適用することにより、交配作業を経ずに原因遺伝子を同定することも可能となったため、致死突然変異体や不稔突然変異体の原因遺伝子同定に、今後大きな力を発揮するものと期待される。この成果に加えて、Fekih博士はイネ擬似病斑突然変異体の原因遺伝子同定にも成功し、その結果を論文発表する準備を進めている。
The applicant's research on labor-saving cultivation of rice in Northeast China was carried out. For this purpose, the applicant should apply for the establishment of two kinds of groups: (1) large-scale EMS sudden change group,(2) large-scale block exchange of recombinant inbred lines (RILs). Dr. Fekih Ep Laribi Rym began his research on the use of genetic diversity and the identification of genetic diversity. QTL analysis of the latter materials, direct seeding suitability, and low temperature germination QTL location were identified. Today, Dr. Fekih successfully developed MutMap+ to identify the causes of sudden change (Fekih, PLoS One 2013). MutMap+ method, MutMap method (Abe, Nature Biotech. 2012). The technique for comparing SNP distributions between mutant and wild-type parent systems and for identifying genetic mutations rapidly and efficiently by comparing genetic mutations between mutant and wild-type parent systems and by comparing genetic mutations between mutant and wild-type parent systems. MutMap+ method is applicable to the group of M3 generations, mating operation, cause, identity, death, sudden change, cause, identity, future development, etc. Dr. Fekih's work on the identification of causes of sudden changes in pseudo-lesions and the preparation of the paper's results

项目成果

期刊论文数量(0)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
MutMap+ : A whole genome sequencing (WGS) based method for simulta neous mapping and isolation of genes without crossing.
MutMap:一种基于全基因组测序 (WGS) 的方法,用于同时进行基因定位和分离,无需交叉。
  • DOI:
  • 发表时间:
    2014
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Fekih;R.;Takagi;H.;Tamiru;M.;Abe;A.;Natsume;S.;et al.
  • 通讯作者:
    et al.
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  • 发表时间:
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    神崎 洋之;吉田 健太郎;寺内 良平
  • 通讯作者:
    寺内 良平
Searching for effectors of Magnaporthe oryzae: a multi-faceted genomics approach
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  • DOI:
  • 发表时间:
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  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
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  • 通讯作者:
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  • 资助金额:
    $ 1.47万
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  • 资助金额:
    $ 1.47万
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  • 资助金额:
    $ 1.47万
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  • 批准号:
    14656023
  • 财政年份:
    2002
  • 资助金额:
    $ 1.47万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Exploratory Research
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  • 批准号:
    11770057
  • 财政年份:
    1999
  • 资助金额:
    $ 1.47万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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    1997
  • 资助金额:
    $ 1.47万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Exploratory Research
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  • 批准号:
    09740640
  • 财政年份:
    1997
  • 资助金额:
    $ 1.47万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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知道了