放線菌インテグラーゼの特性と組み込み型ベクター化への利用開発に関する研究
放线菌整合酶的特性及其在整合矢量化中的应用研究
基本信息
- 批准号:07760090
- 负责人:
- 金额:$ 0.64万
- 依托单位:
- 依托单位国家:日本
- 项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
- 财政年份:1995
- 资助国家:日本
- 起止时间:1995 至 无数据
- 项目状态:已结题
- 来源:
- 关键词:
项目摘要
放線菌Streptomyces azureusのプラスミドpSA1.1の染色体中の組込みに必須な遺伝子を含む1540bpの断片をクローニングし、本断片中に630bpの組込み遺伝子(int)、210bpの切出し遺伝子(xis),及び付着部位(att P)を同定した。本int遺伝子はSacchropolyspora erythraeaのプラスミドpSE211、pSE101やStreptococcus pneumoniaeのトランスポゾンTn1545、乳酸桿菌ファージphiLC3のインテグラーゼと高い相同性が認められた。また、xis遺伝子はpSE211やTn1545の他、Streptomyces ambofaciensのプラスミドpSAM2のイグシジョナーゼ等と相同性が認められた。更に、att Pの宿主染色体上の相同領域att Bを同定し、47bpにわたるコア領域が低G_+C含量であることを示した。これらの結果から、pSA1.1の染色体中への組込み機構を明らかにし、attP-int遺伝子を含む断片をpUC118ベクターにクローニングし、組込みベクターpINT7を構築した。次に、int遺伝子を含むpSA1.1の1156bp SalI断片をtacプロモーターを保持した発現ベクターpGEX-5X-1に挿入し、組換えプラスミドpEXP10を構築した。pEXP10を形質転換したE.coli JM109株を、IPTG誘導によりグルタチオン-s-トランスフェラーゼ(GST)との融合蛋白質を発現させた。発現した融合タンパク質はSDS-PAGEにより分子量を測定し、約50kDaのGST-Int融合蛋白質であることを確認した。本融合タンパク質をアフィニティークロマトグラフィーを用いて精製を行い、得られた標品をFactorXaによって切断した。精製したインテグラーゼとpSA1.1の各断片と反応させ、ゲル移動度シフトアッセイを行った結果、att P領域を含んだ断片のみに移動度の変化が認められ、インテグラーゼがatt P近傍のarmに結合してコア領域の切断・DNA鎖の再結合反応を触媒することが示唆された。
The genome of Streptomyces azureus pSA1.1 contains a fragment of 1540bp, a fragment of 630bp, a fragment of 210bp, and a fragment of 210bp. This int contains Sacchropolyspora erythroea, Streptococcus pneumoniae, Lactobacillus sp. pSE211, pSE101, Lactobacillus sp. pSE1545, Lactobacillus sp. pSE211, Lactobacillus sp. pSE101, Lactobacillus sp. pSE1545, Lactobacillus sp. pSE211, Lactobacillus sp. pSE101, Lactobacillus sp. pSE1545, Lactobacillus sp. pSE101, Lactobacillus sp. pSE1545, Lactobacillus sp. pSE101, Lactobacillus sp. pSE1545, Lactobacillus sp. pSE101, Lactobacillus sp. pSE1545, Lactobacillus sp. pSE101, Lactobacillus sp. pSE211, Lactobacillus sp. pSE101, Lactobacillus sp. pSE1545, Lactobacillus sp. pSE1545, Lactobacillus sp. pSE101, Lactobacillus sp. pSE1545, Lactobacillus sp The identity of pSE211 and Tn1545, Streptomyces ambofaciens and pSAM2, etc. In addition, att P has the same region on the host chromosome, att B, and 47bp. The region has low G_+C content. As a result, pSA1.1 chromosome structure was constructed by pUC118 fragment, attP-int fragment and pINT7 fragment. The 1156bp SalI fragment of pSA1.1 was included in the construct of pGEX-5X-1. pEXP10 was transformed into E.coli JM109 strain, and the fusion protein was produced by IPTG induction. The molecular weight of the fusion protein was determined by SDS-PAGE, and the presence of a GST-Int fusion protein of approximately 50kDa was confirmed. This is the first time I've ever seen a product like this. Refine the fragment of pSA1.1, remove the fragment of pSA1.1
项目成果
期刊论文数量(6)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
K.Doi et al.: "Plasmid formation and its relation to the formation of spontaneously developing pocbs in Streptornyces azureus ATCC14921" J.Appl.Bacteriol.79. 237-243 (1995)
K.Doi 等人:“天蓝色链霉菌 ATCC14921 中的质粒形成及其与自发发育 pocb 形成的关系”J.Appl.Bacteriol.79。
- DOI:
- 发表时间:
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
- 通讯作者:
土居 克実: "遺伝子ターゲッティングの基礎と応用" (株)コロナ社, 38 (1995)
Katsumi Doi:“基因打靶的基础和应用” Coronasha Co., Ltd.,38 (1995)
- DOI:
- 发表时间:
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
- 通讯作者:
K.Doi et al.: "Relationship between Fermchtation Quality of Silage and Presence of Phages for Silage-Muking lactobocilli" Bull.Natl Grassl.51. 31-39 (1995)
K.Doi 等人:“青贮饲料发酵质量与青贮饲料发酵乳杆菌噬菌体存在之间的关系”Bull.Natl Grassl.51。
- DOI:
- 发表时间:
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
- 通讯作者:
K.Doi et al.: "Transfer Function of Spi Gene in Plasmid pSA1.1 of Streptomyces azureus ATCC 14921" Actinomycetologica. 9. 44-48 (1995)
K.Doi 等人:“天青链霉菌 ATCC 14921 质粒 pSA1.1 中 Spi 基因的转移功能”放线菌。
- DOI:
- 发表时间:
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
- 通讯作者:
K.Doi et al.: "Two Plasimds Related to Spontaneously Developing Pocks in Streptomyces laurentii" Biosci.Biotech.Biochem.59. 1040-1043 (1995)
K.Doi 等人:“劳伦链霉菌中与自发形成痘痕相关的两个质粒”Biosci.Biotech.Biochem.59。
- DOI:
- 发表时间:
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
- 通讯作者:
{{
item.title }}
{{ item.translation_title }}
- DOI:
{{ item.doi }} - 发表时间:
{{ item.publish_year }} - 期刊:
- 影响因子:{{ item.factor }}
- 作者:
{{ item.authors }} - 通讯作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ monograph.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ sciAawards.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ conferencePapers.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ patent.updateTime }}
土居 克実其他文献
ピルビン酸デヒドロゲナーゼキナーゼの制御機構
丙酮酸脱氢酶激酶的调控机制
- DOI:
- 发表时间:
2015 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
海谷 京香;藤野 泰寛;土居 克実;西本 悦子;廣政 恭明;廣政恭明 - 通讯作者:
廣政恭明
高度好熱菌Thermus thermophilusを用いた異種タンパク質発現システム
使用高度嗜热细菌嗜热栖热菌的异源蛋白表达系统
- DOI:
- 发表时间:
2019 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
末松 佑梨;藤野 泰寛;土居 克実 - 通讯作者:
土居 克実
好熱好アルカリ性Geobacillus toebii OIT60-9-2株を宿主とするウイルスφIN1の分離・性状解析
嗜热嗜碱托氏地芽孢杆菌 OIT60-9-2 菌株宿主病毒 φIN1 的分离和表征
- DOI:
- 发表时间:
2018 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
渡邊 恭伸;大森 勇門;土居 克実;尾崎 清和;大島 敏久 - 通讯作者:
大島 敏久
ファージ由来溶菌タンパク質Holinはミトコンドリア局在によりアポトーシスを誘導する
噬菌体来源的裂解蛋白 Holin 通过线粒体定位诱导细胞凋亡
- DOI:
- 发表时间:
2016 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
千羽 啓太;黒木 未知瑠;原田 額郎;片倉 喜範;土居 克実 - 通讯作者:
土居 克実
サイレージ乳酸菌 Pediococcus lolii NGRI 0510QTのゲノム構造解析
青贮乳酸菌 Lolii NGRI 0510QT 基因组结构分析
- DOI:
- 发表时间:
2012 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
土居 克実;森 一樹;田代 康介;藤野 泰寛;久原 哲;大島 敏久 - 通讯作者:
大島 敏久
土居 克実的其他文献
{{
item.title }}
{{ item.translation_title }}
- DOI:
{{ item.doi }} - 发表时间:
{{ item.publish_year }} - 期刊:
- 影响因子:{{ item.factor }}
- 作者:
{{ item.authors }} - 通讯作者:
{{ item.author }}
{{ truncateString('土居 克実', 18)}}的其他基金
好熱性繊維状ファージの生活環と宿主応答から辿る極限環境での遺伝子水平伝播と進化
从嗜热丝状噬菌体的生命周期和宿主反应追溯极端环境中的水平基因转移和进化
- 批准号:
23K20281 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 0.64万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
Brain-Gut-Microbe Interaction Based on Genetic Structure and Habitat of Plasmalogen-producing Bacteria
基于缩醛磷脂产生细菌的遗传结构和栖息地的脑-肠-微生物相互作用
- 批准号:
22K19155 - 财政年份:2022
- 资助金额:
$ 0.64万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)
Life cycle of hyperthermophilic filamentous phage reveal to horizontal gene transfer and evolution in extreme environment
超嗜热丝状噬菌体的生命周期揭示了极端环境中的水平基因转移和进化
- 批准号:
20H02903 - 财政年份:2020
- 资助金额:
$ 0.64万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
放射菌の形態分化と代謝分化に関与する新規のPSP様蛋白質の解析
一种参与放线菌形态和代谢分化的新型 PSP 样蛋白的分析
- 批准号:
08760092 - 财政年份:1996
- 资助金额:
$ 0.64万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
相似海外基金
プラスミドと細菌の共存機構に関する基盤研究
质粒与细菌共存机制的基础研究
- 批准号:
23K26817 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 0.64万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
プラスミドの宿主細菌予測アルゴリズムの開発
质粒宿主细菌预测算法的开发
- 批准号:
24K20891 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 0.64万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
プラスミド獲得に伴う宿主細菌の核様体再構築過程の分子基盤
与质粒获取相关的宿主细菌核仁重塑过程的分子基础
- 批准号:
24K01663 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 0.64万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
プラスミド性薬剤耐性菌のヒト保菌及び腸内細菌耐性拡散機構の解明
阐明人体携带的基于质粒的耐药菌以及肠道细菌中耐药性传播的机制
- 批准号:
24K01701 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 0.64万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
接合伝達で獲得したプラスミドへの細菌細胞の初期適応過程の解明
阐明细菌细胞对通过接合转移获得的质粒的初始适应过程
- 批准号:
24H00497 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 0.64万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (A)
薬剤耐性IncX3プラスミドの宿主菌への影響評価ー遺伝子型と表現型の観点からー
评估耐药IncX3质粒对宿主细菌的影响——从基因型和表型的角度——
- 批准号:
24K18445 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 0.64万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
新規薬剤耐性菌の出現を担うプラスミドの探索と同定
寻找和鉴定导致新耐药细菌出现的质粒
- 批准号:
21H04149 - 财政年份:2023
- 资助金额:
$ 0.64万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Encouragement of Scientists
プラスミドの宿主域を高確度に予測するための宿主域決定因子の同定
鉴定宿主范围决定因素以高精度预测质粒宿主范围
- 批准号:
22KJ1504 - 财政年份:2023
- 资助金额:
$ 0.64万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
How can plasmids coexist with host bacteria?
质粒如何与宿主细菌共存?
- 批准号:
23H02124 - 财政年份:2023
- 资助金额:
$ 0.64万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
代謝ブラックボックスの可視化から紐解く遺伝子導入パターン最適化手法の確立
基于代谢黑箱可视化的基因转移模式优化方法的建立
- 批准号:
22H01885 - 财政年份:2022
- 资助金额:
$ 0.64万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)