新規薬剤耐性菌の出現を担うプラスミドの探索と同定

プラスミドは，異なる細菌細胞どうしの接触（=接合）によって，プラスミドを持つ細菌（供与菌）から持たない細菌（受容菌）へと，接合伝達によって移動し，宿主に新たな能力を与える遺伝因子である．プラスミドは微生物の高い多様性を生み出し，我々にとって有用な微生物の出現にも寄与する一方，薬剤耐性遺伝子もプラスミドによって伝播することが知られている．そこで本研究では，我々の身近な環境（特に生活に密接した土壌や水圏）を中心に，薬剤耐性菌やその遺伝子を運ぶプラスミドがどの程度分布し調べることを目的とした.本研究では実環境中から抗生物質耐性を指標に薬剤耐性菌を収集を行った．今後,実環境中で薬剤耐性遺伝子の伝播を担うプラスミドを探索する．受容菌として大腸菌を準備し，静岡県の土壌・河川・湖沼の水・底泥や，下水処理槽内の微生物群集等の試料と混合し，薬剤耐性を指標として，プラスミドを獲得した受容菌を収集する．得られたプラスミドについて，既存の薬剤耐性プラスミド固有の遺伝子配列（複製開始タンパク質をコード）から設計した特異的プライマーを用い，PCR による増幅の有無を調べて種類を同定する．環境試料ごとにどのプラスミドがどの程度存在するのか，その分布について明らかにする．なお，抗生物質としては，近年深刻な問題となっているコリスチンやチゲサイクリン耐性をもたらす菌株・プラスミドを想定している．

プラスミドは，異なる細菌細胞どうしの接触（=接合）によって，プラスミドを持つ細菌（供与菌）から持たない細菌（受容菌）へと，接合伝達によって移動し，宿主に新たな能力を与える遺伝因子である．プラスミドは微生物の高い多様性を生み出し，我々にとって有用な微生物の出現にも寄与する一方，薬剤耐性遺伝子もプラスミドによって伝播することが知られている．そこで本研究では，我々の身近な環境（特に生活に密接した土壌や水圏）を中心に，薬剤耐性菌やその遺伝子を運ぶプラスミドがどの程度分布し調べることを目的とした.本研究では実環境中から抗生物質耐性を指標に薬剤耐性菌を収集を行った．今後,実環境中で薬剤耐性遺伝子の伝播を担うプラスミドを探索する．受容菌として大腸菌を準備し，静岡県の土壌・河川・湖沼の水・底泥や，下水処理槽内の微生物群集等の試料と混合し，薬剤耐性を指標として，プラスミドを獲得した受容菌を収集する．得られたプラスミドについて，既存の薬剤耐性プラスミド固有の遺伝子配列（複製開始タンパク質をコード）から設計した特異的プライマーを用い，PCR による増幅の有無を調べて種類を同定する．環境試料ごとにどのプラスミドがどの程度存在するのか，その分布について明らかにする．なお，抗生物質としては，近年深刻な問題となっているコリスチンやチゲサイクリン耐性をもたらす菌株・プラスミドを想定している．