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変性反応過渡状態にあるリゾチームの水素パルスラベル法による研究

氢脉冲标记法研究溶菌酶瞬时变性反应

基本信息

批准号：
10157226
负责人：
瀬川新一
金额：
$ 1.09万
依托单位：
Kwansei Gakuin University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
财政年份：
1998
资助国家：
日本
起止时间：
1998 至无数据
项目状态：
已结题

项目摘要

蛋白質の折りたたみ機構を分子科学的に解明するために、これまではCDスペクトルや蛍光強度変化をモニターとして種々の実験が行われてきた。しかしこれでは分子全体の構造変化に関する情報しか得ることが出来なかった。そこで我々は、水素交換反応とNMR分光法を用いることによって、リゾチーム分子の変性(アンフォールディング)反応を原子レベルの分解能で観測することを試みた。すべての主鎖アミドプロトンをあらかじめ重水素で置換しておき、これを変性反応させ一定時間経過後に、短時間溶媒をpH9の軽水に変化させることによって、溶媒にさらされた蛋白質の領域を^1Hでパルス的にラベルした。このようにして作製した水素パルスラベル・リゾチームの2次元NMRスペクトル(HOHAHA)を測定することによって、残基毎に溶媒露出の速度定数を決めることが出来る。pH3.0、塩酸グアニジン4.0Mの条件下でリゾチームの変性反応を追跡し、約60個の主鎖アミドプロトンの交差ピークを観測して、ほぼすべての残基がいっせいに位相をそろえて溶媒露出するという結果を得た。さらに残基レベルの構造変化の活性化エネルギーを決定した結果、どの残基も36kcal/molとほぼ一定の値を持つことが明らかになった。これは、蛋白質の変性反応が分子全体にわたって協同的に構造変化するものであることを、はじめて実験的に明らかにしたものである。さらに、このような分子全体に渡る協同的な構造変化が、どのようなきっかけで引き起こされるのかという点に注目して、変性条件下において過渡的に折りたたまれたリゾチーム分子の水素交換反応のプロテクション・ファクター(遅延因子)を決定することを試みた。まだ数少ない実験データからの予測であるが、変性溶媒条件下の過渡的な折りたたみ構造においてリゾチームのβドメインの残基のプロテクション・ファクターが著しく減少していることが予測された。この点を今後明らかにするつもりである。

The mechanism of protein folding is explained by the light intensity of CD. The structure of the whole molecule is related to the information obtained. A new method for determination of the molecular properties of a compound by NMR spectroscopy is proposed. The main lock of the solvent is the substitution of heavy water and heavy water. After a certain period of time, the solvent is changed to pH 9 and water is changed to pH9. The solvent is changed to protein domain. 2-D NMR spectra (HOHAHA) were determined by the determination of the solvent exposure rate of each residue. At pH 3.0 and pH 4.0M, about 60 of the main locks were detected, and the residues in the middle of the chain were detected. The structure and activity of the residues were determined by the results and the residues were determined by a certain value of 36kcal/mol. This is the first time that a protein has been identified. In addition, the structure of the molecular whole transition is changed, and the transition point is changed. Under different conditions, the transition point is changed, and the transition point is changed. Under different conditions, the transition point is changed, and the transition point is changed. The transition point is changed, and the transition point is changed. Under different conditions, the transition point is changed, and the transition point is changed. Under different conditions, the transition point is changed, and the transition point is changed, and the transition point is changed. The prediction of the number of residues in the β-terminal under different solvent conditions is based on the analysis of the structure of the transition. This is the first time I've seen you.