Computersimulation und Interpretation kraftmikroskopischer Experimente zur Antikörper-Antigen-Bindung

抗体-抗原结合力显微镜实验的计算机模拟和解释

• 批准号: 5298520
• 负责人: Professor Dr. Helmut Grubmüller
• 金额: --
• 依托单位: Abteilung für theoretische und computergestützte Biophysik
• 依托单位国家: 德国
• 项目类别: Research Grants
• 财政年份: 1999
• 资助国家: 德国
• 起止时间: 1998-12-31 至 2001-12-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://gepris.dfg.de/gepris/projekt/5298520?language=en
• 关键词: Computersimulation; und; Interpretation; kraftmikroskopischer; Experimente

Aufbauend auf den Methoden und motiviert durch die Erkenntnisse, die wir in der vorangegangenen Bewilligungsperiode aus der Molekulardynamiksimulation beschleunigter Ligand/Rezeptor-Trennungen gewonnen haben, zielt das vorliegende Projekt verstärkt auf die Aufklärung konformativer Bewegungen, welche bei der Trennung von Antikörper/Antigen-Komplexen zu erwarten sind. Es stehen zwei Aspekte im Vordergrund: zum einen die Beschreibung von 'induced-fit'-Bewegungen von Rezeptor und Ligand; zum anderen die systematische Analyse der durch unsere Arbeiten nahegelegten überraschend großen Vielfalt möglicher Bindungsreaktionswege. Diese führen zu einem bedeutenden entropischen Beitrag, der erstmals quantifiziert werden soll. Wir erwarten ein verbessertes mikroskopisches Verständnis von 'induced-fit'-Prozessen, das die Vorhersagekraft etwa von Dockingmethoden verbessern sollte, welche zum Design pharmakologischer Wirkstoffe eingesetzt werden. Die Untersuchungen sollen sich wesentlich auf den monoklonalen Antilysozym-Antikörper Hyhel-5 konzentrieren, an dem gegenwärtig am Biophysikalischen Institut der Universität Linz kraftmikroskopische Einzelmolekülexperimente begonnen werden. Diese sollten es gestatten, unsere Simulationsrechnungen zu überprüfen.

在分子动力学模拟中，我们采用了单一配体/Rezeptor-Trennungen，并在模拟过程中通过Antikörper/Antigen-Komplexen的方法和动力学来验证这一点。这是两种不同的前景：一种是对受体和配体的“诱导匹配”的描述;另一种是对劳动者最大劳动强度的系统分析。这是一个非常有趣的故事，最初的韦尔登是定量的。我们需要对“诱导匹配”-Prozessen的微结构进行详细说明，只有对接方法的预处理工艺，才能设计出韦尔登。Die Untersuchungen sollen sich wesentlich auf den monoklonalen Antilysozym-Antikörper Hyhel-5 konzentrieren，an dem gegenwärtig am Biophysikalischen Institut der Universität林茨大学的Kraft mikroskopische Einzelmolekülexperimente begonnen韦尔登.这是一个由模拟器产生的过程。