マウスおよびヒトのインプリンティング領域の比較ゲノム解析

小鼠和人类印迹区域的比较基因组分析

基本信息

  • 批准号:
    00J09638
  • 负责人:
  • 金额:
    $ 1.92万
  • 依托单位:
  • 依托单位国家:
    日本
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for JSPS Fellows
  • 财政年份:
    2000
  • 资助国家:
    日本
  • 起止时间:
    2000 至 2002
  • 项目状态:
    已结题

项目摘要

哺乳類のインプリント遺伝子はしばしば染色体上でクラスターを構成し、ドメインとして独特な発現制御を受けると考えられているが、マウス第18番染色体には父性発現インプリント遺伝子Impactがマップされているのみで、クラスター構造を成しているかどうか明らかでない。全貌が見えつつあるマウスのゲノム情報を利用し、対応するヒトの領域と比較しながらImpact周辺遺伝子のアレル別発現解析を行った。インプリンティングを受けないヒトホモログIMPACTの下流には同じ向きに遺伝子HRH4、上流には逆向きにOSBPL1Aが存在する。これらの遺伝子は末梢血でも発現しており、SNPが見つかった前者1例、後者2例について調べたところ、両遺伝子とも両アレル性に発現していた。次にこれらのマウスホモログHrh4およびOsbpl1aを同定し、Impactの近傍遺伝子であることを確認してから発現解析を行ったところ、ヒト遺伝子と同じく両アレル性であることがわかった。ヒトOSBPL1Aに関しては、転写開始点が異なり、より長い転写産物であるOSBPL1Bが報告されており、このmRNAについてもマウスホモログOsbpl1bを単離し、アレル別発現解析を行った。その結果、マウスの遺伝子に関しては、多くの個体で父性アレルが母性アレルに対してやや優勢的に発現する傾向が認められた。プロモーター領域に存在するCpGアイランドは両アレルともに低メチル化状態であるため、基本的にOsbpl1bは両アレル性に発現する遺伝子であると思われるが、Impactプロモーター領域のアレルによるクロマチン構造の差違を反映して父性アレルの優勢発現傾向が観察されたと考えられる。孤立型インプリント遺伝子も距離によっては近傍遺伝子の発現に多少の影響を及ぼす可能性が示唆された。
In mammalian animals, there is a significant increase in the number of children on the chromosomes, the number of children in the chromosomes, the number of children in the chromosomes of the mammal, the children of mammals, the children, the children, the children, In the full picture, we need to make full use of the information. We need to make full use of the information. In the same direction, the HRH4 is the same as the IMPACT, and the upstream is the reverse. OSBPL1A exists. The blood of the peripheral blood of the child was found to be constipated in 1 case of the former and 2 cases of the SNP in the peripheral blood. Do you want to know that the Hrh4 is the same as the Osbpl1a? the Impact is close to the same location, and the Impact is close to each other. Please make sure that you can resolve the row. You need to OSBPL1A, write, write The result of the test, the child child, the parent child, the maternal parent, the mother, the mother, the mother In the field of information, there is a problem that the status of the CpG is low, the basic Osbpl1b is not, and the Impact is different in the domain. The difference reflects the paternity of the child. The isolated type is far away from each other. The number of shadows and the possibility of the occurrence of the isolated cells indicate that they are far away from each other.

项目成果

期刊论文数量(1)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Kohji OKAMURA: "Comparative Genome Analysis of the Mouse Imprinted Gene Impact and Its Nonimprinted Human Homolog IMPACT : Toward the Structural Basis for Species-Specific Imprinting"Genome Research. 10・12. 1878-1889 (2000)
Kohji OKAMURA:“小鼠印记基因影响及其非印记人类同源影响的比较基因组分析:走向物种特异性印记的结构基础”基因组研究 10・12。
  • DOI:
  • 发表时间:
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
  • 通讯作者:
{{ item.title }}
{{ item.translation_title }}
  • DOI:
    {{ item.doi }}
  • 发表时间:
    {{ item.publish_year }}
  • 期刊:
  • 影响因子:
    {{ item.factor }}
  • 作者:
    {{ item.authors }}
  • 通讯作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ monograph.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ sciAawards.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ conferencePapers.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ patent.updateTime }}

岡村 浩司其他文献

ヤツメウナギゲノムにおける転写開始点決定およびプロモータ配列の特徴
七鳃鳗基因组转录起始点和启动子序列特征的测定
  • DOI:
  • 发表时间:
    2013
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    岡村 浩司;進導 美幸;日下部 りえ;鈴木 穣;林 恵子;秦 健一郎;中林 一彦
  • 通讯作者:
    中林 一彦
Expansion and contraction of the olfactory receptor universe: Orthology among 13 placental mammals highlights the evolutionary fate of genes
嗅觉受体宇宙的扩张和收缩:13种胎盘哺乳动物的同源性突显了基因的进化命运
  • DOI:
  • 发表时间:
    2014
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    川井 優里;由良 敬;進導 美幸;日下部 りえ;林 恵子;秦 健一郎;中林 一彦;岡村 浩司;Yoshihito Niimura
  • 通讯作者:
    Yoshihito Niimura
オリゴヌクレオチドの位置関係と畳み込みニューラルネットワークを利用したプロモーター配列の解析
使用寡核苷酸位置关系和卷积神经网络分析启动子序列
  • DOI:
  • 发表时间:
    2018
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    青砥 早希;岡村 浩司
  • 通讯作者:
    岡村 浩司
ヒト老化細胞を利用したエピゲノム解析
使用人类衰老细胞进行表观基因组分析
  • DOI:
  • 发表时间:
    2014
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    榊 みずほ;老原 侑子;岡村 浩司;中林 一彦;秦 健一郎;小林 芳郎;前原 佳代子
  • 通讯作者:
    前原 佳代子
遺伝子治療のための迅速で網羅的な染色体挿入部位同定法の開発
开发用于基因治疗的快速、全面的染色体插入位点识别方法
  • DOI:
  • 发表时间:
    2014
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    岡村 浩司;河合 利尚;林 恵子;秦 健一郎;小野寺 雅史;中林 一彦
  • 通讯作者:
    中林 一彦

岡村 浩司的其他文献

{{ item.title }}
{{ item.translation_title }}
  • DOI:
    {{ item.doi }}
  • 发表时间:
    {{ item.publish_year }}
  • 期刊:
  • 影响因子:
    {{ item.factor }}
  • 作者:
    {{ item.authors }}
  • 通讯作者:
    {{ item.author }}

{{ truncateString('岡村 浩司', 18)}}的其他基金

細胞のリプログラミングによるDNAメチル化変化を利用した遺伝子発現制御の理解
利用细胞重编程导致的 DNA 甲基化变化了解基因表达调控
  • 批准号:
    21K06143
  • 财政年份:
    2021
  • 资助金额:
    $ 1.92万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

相似海外基金

エピゲノム解析用フォトニック結晶ナノ共振器アレイの開発とDNAメチル化網羅的解析
开发用于表观基因组分析和DNA甲基化综合分析的光子晶体纳米腔阵列
  • 批准号:
    23K25195
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    $ 1.92万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
DNAメチル化の摂動とDNA損傷・修復応答に着目した孤発性ALSの病態解明
阐明散发性 ALS 的病理学,重点关注 DNA 甲基化和 DNA 损伤/修复反应的扰动
  • 批准号:
    24K10635
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    $ 1.92万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
DNAメチル化異常がもたらすナルコレプシー発症機構の解明
阐明DNA异常甲基化引起的发作性睡病的机制
  • 批准号:
    23K24267
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    $ 1.92万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
DNAメチル化アレイ解析を用いた唇顎口蓋裂における裂型決定因子の同定
使用 DNA 甲基化阵列分析鉴定唇裂和腭裂的裂型决定因素
  • 批准号:
    24K13184
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    $ 1.92万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
DNAメチル化酵素の包括的な理解に向けた構造生命科学研究とその応用
结构生命科学研究及其在全面了解 DNA 甲基转移酶方面的应用
  • 批准号:
    24K01967
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    $ 1.92万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
血球細胞DNAメチル化をターゲットとした慢性腎臓病新規治療戦略の開発
开发针对血细胞 DNA 甲基化的慢性肾病新治疗策略
  • 批准号:
    23K24351
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    $ 1.92万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
表面増強ラマン分光極限1塩基計測によるDNAメチル化シーケンシング
使用表面增强拉曼光谱限制单碱基测量的 DNA 甲基化测序
  • 批准号:
    23K26516
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    $ 1.92万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
小児急性骨髄性白血病の統合解析 ーゲノムワイドDNAメチル化解析を中心としてー
小儿急性髓性白血病综合分析-聚焦全基因组DNA甲基化分析-
  • 批准号:
    24K19214
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    $ 1.92万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
後天性赤芽球癆におけるDNAメチル化解析による発症機序の解明
DNA甲基化分析阐明获得性成红细胞再生障碍性贫血的发病机制
  • 批准号:
    24K19219
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    $ 1.92万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
DNA複製非共役型維持DNAメチル化の分子機構
维持非偶联DNA复制的DNA甲基化分子机制
  • 批准号:
    24K02001
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    $ 1.92万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
{{ showInfoDetail.title }}

作者:{{ showInfoDetail.author }}

知道了